Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07592
• Subject: NM_001293694.1
• Aligned Length: 1255
• Identities: 1137
• Gaps: 14

Alignment

Query    1  ATGAGTGGGCATCGATCAACAAGGAAAAGATGTGGAGATTCTCACCCGGAGTCCCCAGTGGGCTTCGGGCATAT  74
            ||||||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGGGCATCGGTCAACAAGGAAACGATGTGGAGATTCTCACCCAGAGTCCCCTGTGGGCTTTGGGCATAT  74

Query   75  GAGTACTACAGGATGTGTATTAAATAAATTGTTTCAGTTACCAACACCACCATTGTCAAGACACCAACTAAAGC  148
            ||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||..||||.|
Sbjct   75  GAGTACTACAGGGTGTGTATTAAATAAATTGTTTCAGTTACCGACACCACCACTGTCAAGACACCAGTTAAAAC  148

Query  149  GGCTAGAAGAACACAGATATCAAAGTGCTGGACGGTCCCTGCTTGAGCCCTTAATGCAAGGGTATTGGGAATGG  222
            ||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct  149  GGCTAGAAGAACACAGGTATCAGAGTGCTGGACGGTCCCTTCTCGAGCCCTTAATGCAAGGATACTGGGAATGG  222

Query  223  CTCGTTAGAAGAGTTCCCTCCTGGATTGCCCCAAATCTCATCACCATCATTGGACTGTCAATAAACATCTGTAC  296
            ||.|||.|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct  223  CTAGTTGGAAGAGTACCCTCATGGATTGCCCCAAATCTCATCACCATCATTGGACTATCAATAAATATCTGTAC  296

Query  297  AACTATTTTATTAGTCTTCTACTGCCCTACAGCTACAGAGCAGGCACCTCTGTGGGCATATATTGCTTGTGCCT  370
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.|
Sbjct  297  AACTATTTTGTTAGTCTTCTACTGCCCTACAGCTACAGAGCAGGCACCTCTGTGGGCTTATATTGCCTGTGCTT  370

Query  371  GTGGCCTTTTCATTTACCAGTCTTTGGATGCTATTGATGGGAAACAGGCAAGAAGAACCAATAGTAGTTCTCCT  444
            |||||||||||||||||||||||.|||||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct  371  GTGGCCTTTTCATTTACCAGTCTCTGGATGCCATAGATGGGAAACAGGCCAGAAGAACTAACAGTAGCTCTCCT  444

Query  445  CTGGGAGAACTTTTTGATCATGGCTGTGATTCACTATCAACAGTTTTTGTGGTTCTCGGAACTTGTATTGCAGT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGGAGAACTTTTTGATCATGGCTGTGACTCACTATCGACAGTTTTTGTGGTTCTTGGAACTTGTATTGCAGT  518

Query  519  GCAGCTGGGGACAAACCCTGATTGGATGTTTTTTTGTTGTTTTGCGGGGACATTTATGTTCTATTGTGCGCACT  592
            .||.||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct  519  ACAACTTGGGACAAATCCTGACTGGATGTTTTTTTGTTGTTTTGCTGGGACATTCATGTTCTATTGTGCACACT  592

Query  593  GGCAAACGTATGTTTCTGGAACATTGCGATTTGGAATAATTGATGTGACTGAAGT-GCAAATCTTCATAATAAT  665
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.| ||| .||.|||.|.||.|||.|
Sbjct  593  GGCAAACATATGTTTCTGGAACATTGCGATTTGGAATATTCGATGTTACAG-AGTCCCAGATCCTAATTATATT  665

Query  666  CATGCATTTGCTGGCAGTGA---TTGGAGGACCACCT---TTTTGGCAATCTATGATTCCAGTGCTGAATATTC  733
            ..|.||..|.||..||| ||   .|||.|     |||   ||.|||.|.|..|.||||||.|||.|||||||||
Sbjct  666  ATTCCAGCTTCTCTCAG-GAACCGTGGGG-----CCTTGGTTCTGGAACTTCACGATTCCTGTGTTGAATATTC  733

Query  734  AAATGAAAATTTTTCCTGCACTTTGTACTGTAGCAGGGACCATATTTTCCTGTACAAATTACTTCCGTGTAATC  807
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  734  AAATGAAACTTCTTCCTGCACTTTGTACTGTGGCAGGGACCATATTTTCCTGTACAAATTACTTCCGTGTAATC  807

Query  808  TTCACAGGTGGTGTTGGCAAAAATGGATCAACAATAGCAGGAACAAGTGTCCTTTCTCCTTTTCTCCATATTGG  881
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  808  TTCACAGGTGGTGTTGGCAAAAATGGGTCAACCATAGCAGGAACAAGTGTCCTTTCTCCTTTTCTGCATATTGG  881

Query  882  ATCAGTGATTACATTAGCTGCAATGATCTACAAGAAATCTGCAGTTCAGCTTTTTGAAAAGCATCCCTGTCTTT  955
            |||||||||.||.|||||||..|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  882  ATCAGTGATCACGTTAGCTGTTATGATCTACAAGAAATCAGCAGTTCAGCTTTTTGAAAAGCATCCATGTCTTT  955

Query  956  ATATACTGACATTTGGTTTTGTGTCTGCTAAAATCACTAATAAGCTTGTGGTTGCACACATGACGAAAAGTGAA  1029
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  956  ATATACTGACATTTGGTTTTGTGTCGGCTAAAATCACTAATAAGCTTGTGGTTGCTCACATGACGAAAAGTGAA  1029

Query 1030  ATGCATTTGCATGACACAGCATTCATAGGTCCGGCACTTTTGTTTCTGGACCAGTATTTTAACAGCTTTATTGA  1103
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1030  ATGCATTTGCATGACACAGCATTCATAGGTCCAGCACTTCTGTTTCTGGACCAGTATTTTAACAGCTTCATTGA  1103

Query 1104  TGAATATATTGTACTTTGGATTGCCCTGGTTTTCTCTTTCTTTGATTTGATCCGCTACTGTGTCAGTGTTTGCA  1177
            |||||||||.|||||||||||||||.||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1104  TGAATATATAGTACTTTGGATTGCCTTGATCTTCTCTTTCTTTGATTTGATTCGTTACTGTGTCAGTGTTTGCA  1177

Query 1178  ATCAGATTGCGTCTCACCTGCACATACATGTCTTCAGAATCAAGGTCTCTACAGCTCATTCTAATCATCAT  1248
            ||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.|.||||||||||||.|||||||||||.
Sbjct 1178  ATCAGATTGCATCTCACCTGCATATACATGTCTTCAGAATTAAAGCCTCTACAGCTCACTCTAATCATCAC  1248