Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07592
• Subject: XM_024450080.1
• Aligned Length: 1256
• Identities: 1217
• Gaps: 16

Alignment

Query    1  ATGAGTGGGCATCGATCAACAAGGAAAAGATGTGGAGATTCTCACCCGGAGTCCCCAGTGGGCTTCGGGCATAT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGTGGGCATCGATCAACAAGGAAAAGATGTGGAGATTCTCACCCGGAGTCCCCAGTGGGCTTCGGGCATAT  74

Query   75  GAGTACTACAGGATGTGTATTAAATAAATTGTTTCAGTTACCAACACCACCATTGTCAAGACACCAACTAAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAGTACTACAGGATGTGTATTAAATAAATTGTTTCAGTTACCAACACCACCATTGTCAAGACACCAACTAAAGC  148

Query  149  GGCTAGAAGAACACAGATATCAAAGTGCTGGACGGTCCCTGCTTGAGCCCTTAATGCAAGGGTATTGGGAATGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GGCTAGAAGAACACAGATATCAAAGTGCTGGACGGTCCCTGCTTGAGCCCTTAATGCAAGGGTATTGGGAATGG  222

Query  223  CTCGTTAGAAGAGTTCCCTCCTGGATTGCCCCAAATCTCATCACCATCATTGGACTGTCAATAAACATCTGTAC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTCGTTAGAAGAGTTCCCTCCTGGATTGCCCCAAATCTCATCACCATCATTGGACTGTCAATAAACATCTGTAC  296

Query  297  AACTATTTTATTAGTCTTCTACTGCCCTACAGCTACAGAGCAGGCACCTCTGTGGGCATATATTGCTTGTGCCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AACTATTTTATTAGTCTTCTACTGCCCTACAGCTACAGAGCAGGCACCTCTGTGGGCATATATTGCTTGTGCCT  370

Query  371  GTGGCCTTTTCATTTACCAGTCTTTGGATGCTATTGATGGGAAACAGGCAAGAAGAACCAATAGTAGTTCTCCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGGCCTTTTCATTTACCAGTCTTTGGATGCTATTGATGGGAAACAGGCAAGAAGAACCAATAGTAGTTCTCCT  444

Query  445  CTGGGAGAACTTTTTGATCATGGCTGTGATTCACTATCAACAGTTTTTGTGGTTCTCGGAACTTGTATTGCAGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  445  CTGGGAGAACTTTTTGATCATGGCTGTGATTCACTATCAACAGTTTTTGTGGTTCTTGGAACTTGTATTGCAGT  518

Query  519  GCAGCTGGGGACAAACCCTGATTGGATGTTTTTTTGTTGTTTTGCGGGGACATTTATGTTCTATTGTGCGCACT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCAGCTGGGGACAAACCCTGATTGGATGTTTTTTTGTTGTTTTGCGGGGACATTTATGTTCTATTGTGCGCACT  592

Query  593  GGCAAACGTATGTTTCTGGAACATTGCGATTTGGAATAATTGATGTGACTGAAGT-GCAAATCTTCATAATAAT  665
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|||||.||.| ||| .||.|||.|.||.|||||
Sbjct  593  GGCAAACGTATGTTTCTGGAACATTGCGATTTGGAATATTCGATGTTACAG-AGTCCCAGATCATAATTATAAT  665

Query  666  CATG-CATTTGCTGGCAGTGA---TTGGAGGACCACCT---TTTTGGCAATCTATGATTCCAGTGCTGAATATT  732
             ||| ||..|.||..||| ||   .|||.|     |||   ||.|||.|.|..|.|||||||||||||||||||
Sbjct  666  -ATGCCAGCTTCTCACAG-GAACCCTGGGG-----CCTTGGTTCTGGAACTTCACGATTCCAGTGCTGAATATT  732

Query  733  CAAATGAAAATTTTTCCTGCACTTTGTACTGTAGCAGGGACCATATTTTCCTGTACAAATTACTTCCGTGTAAT  806
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  CAAATGAAAATTTTTCCTGCACTTTGTACTGTAGCAGGGACCATATTTTCCTGTACAAATTACTTCCGTGTAAT  806

Query  807  CTTCACAGGTGGTGTTGGCAAAAATGGATCAACAATAGCAGGAACAAGTGTCCTTTCTCCTTTTCTCCATATTG  880
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  CTTCACAGGTGGTGTTGGCAAAAATGGATCAACAATAGCAGGAACAAGTGTCCTTTCTCCTTTTCTCCATATTG  880

Query  881  GATCAGTGATTACATTAGCTGCAATGATCTACAAGAAATCTGCAGTTCAGCTTTTTGAAAAGCATCCCTGTCTT  954
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881  GATCAGTGATTACATTAGCTGCAATGATCTACAAGAAATCTGCAGTTCAGCTTTTTGAAAAGCATCCCTGTCTT  954

Query  955  TATATACTGACATTTGGTTTTGTGTCTGCTAAAATCACTAATAAGCTTGTGGTTGCACACATGACGAAAAGTGA  1028
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  TATATACTGACATTTGGTTTTGTGTCTGCTAAAATCACTAATAAGCTTGTGGTTGCACACATGACGAAAAGTGA  1028

Query 1029  AATGCATTTGCATGACACAGCATTCATAGGTCCGGCACTTTTGTTTCTGGACCAGTATTTTAACAGCTTTATTG  1102
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  AATGCATTTGCATGACACAGCATTCATAGGTCCGGCACTTTTGTTTCTGGACCAGTATTTTAACAGCTTTATTG  1102

Query 1103  ATGAATATATTGTACTTTGGATTGCCCTGGTTTTCTCTTTCTTTGATTTGATCCGCTACTGTGTCAGTGTTTGC  1176
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103  ATGAATATATTGTACTTTGGATTGCCCTGGTTTTCTCTTTCTTTGATTTGATCCGCTACTGTGTCAGTGTTTGC  1176

Query 1177  AATCAGATTGCGTCTCACCTGCACATACATGTCTTCAGAATCAAGGTCTCTACAGCTCATTCTAATCATCAT  1248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177  AATCAGATTGCGTCTCACCTGCACATACATGTCTTCAGAATCAAGGTCTCTACAGCTCATTCTAATCATCAT  1248