Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07608
• Subject: NM_019498.2
• Aligned Length: 1493
• Identities: 1235
• Gaps: 130

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------------------ATG--CCAG--  7
                                                                           |||  ||||  
Sbjct    1  ATGTCGGTGCCGCTGCTGAAGATCGGGGTCGTGCTAAGCACCATGGCCATGATCACCAACTGGATGTCCCAGAC  74

Query    8  ------GTCGTTGGAGGTGGCAGCGAGACATGCACCCGGC----------------CCGGAAGCT---CCTCAG  56
                  .|||.|||.|  |||..|.|.||   ||||||||                |.|||.|||   ||.|||
Sbjct   75  GCTGCCCTCGCTGGTG--GGCCTCAATAC---CACCCGGCTTTCGGCCGCCAGCGGCGGGACGCTGGACCGCAG  143

Query   57  CCTCCTCTTCCTCATCCTGATGGGCACTGAACTCACTCAAGTGCTGCCCACCAACCCTGAGGAGAGCTGGCAGG  130
            |                  |..|||               |||.|||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  144  C------------------ACCGGC---------------GTGTTGCCCACCAACCCCGAGGAGAGCTGGCAGG  184

Query  131  TGTACAGCTCTGCCCAGGACAGCGAGGGCAGGTGTATCTGCACAGTGGTCGCCCCACAGCAGACCATGTGTTCA  204
            ||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  185  TGTACAGCTCTGCCCAGGACAGTGAGGGCAGGTGTATCTGCACAGTGGTCGCCCCCCAGCAGACCATGTGTTCG  258

Query  205  CGGGATGCCCGCACAAAACAGCTGAGGCAGCTACTGGAGAAGGTGCAGAACATGTCTCAATCCATAGAGGTCTT  278
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  259  CGGGATGCCCGCACAAAACAGCTGAGGCAGCTACTGGAGAAGGTGCAAAACATGTCTCAATCCATAGAAGTCTT  332

Query  279  GGACAGGCGGACCCAGAGAGACTTGCAGTACGTGGAGAAGATGGAGAACCAAATGAAAGGACTGGAGTCCAAGT  352
            |||||||||.||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||.||||||
Sbjct  333  GGACAGGCGAACTCAGAGAGACCTGCAGTACGTGGAGAAGATGGAGAACCAGATGAAAGGCCTGGAGACCAAGT  406

Query  353  TCAAACAGGTGGAGGAGAGTCATAAGCAACACCTGGCCAGGCAGTTTAAGGCGATAAAAGCGAAAATGGATGAA  426
            ||||.||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  407  TCAAGCAGGTGGAGGAGAGCCATAAGCAGCATCTAGCCAGGCAGTTCAAGGCAATAAAAGCGAAAATGGATGAA  480

Query  427  CTTAGGCCTTTGATACCTGTGTTGGAAGAGTACAAGGCCGATGCCAAATTGGTATTGCAGTTTAAAGAGGAGGT  500
            ||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  481  CTTAGGCCTTTGATTCCTGTGTTGGAAGAGTACAAGGCCGATGCCAAATTGGTATTGCAGTTTAAGGAGGAGGT  554

Query  501  CCAGAATCTGACGTCAGTGCTTAACGAGCTGCAAGAGGAAATTGGCGCCTATGACTACGATGAACTTCAGAGCA  574
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  555  CCAGAATCTGACGTCAGTGCTTAACGAACTGCAAGAGGAGATTGGCGCCTATGACTACGATGAACTTCAGAGCA  628

Query  575  GAGTGTCCAATCTTGAAGAAAGGCTCCGTGCATGCATGCAAAAACTAGCTTGCGGGAAGTTGACGGGCATCAGT  648
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||.|||||.|||
Sbjct  629  GAGTGTCCAATCTTGAAGAAAGGCTCCGTGCATGCATGCAAAAACTAGCCTGCGGGAAGCTGACAGGCATAAGT  702

Query  649  GACCCCGTGACTGTCAAGACCTCCGGCTCGAGGTTCGGATCCTGGATGACAGACCCTCTCGCCCCTGAAGGCGA  722
            |||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct  703  GACCCAGTGACTGTCAAGACCTCTGGCTCAAGGTTCGGGTCCTGGATGACAGACCCGCTGGCCCCAGAAGGCGA  776

Query  723  TAACCGGGTGTGGTACATGGACGGCTATCACAACAACCGCTTCGTACGTGAGTACAAGTCCATGGTTGACTTCA  796
            |||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  777  TAACCGGGTCTGGTACATGGATGGTTATCACAACAACCGCTTCGTCCGTGAGTACAAGTCCATGGTGGACTTCA  850

Query  797  TGAACACGGACAATTTCACCTCCCACCGTCTCCCCCACCCCTGGTCGGGCACGGGGCAGGTGGTCTACAACGGT  870
            |||||||||||||.||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||.||.
Sbjct  851  TGAACACGGACAACTTTACCTCTCACCGTCTCCCACACCCCTGGTCAGGTACGGGCCAGGTGGTCTACAATGGC  924

Query  871  TCTATCTACTTCAACAAGTTCCAGAGCCACATCATCATCAGGTTTGACCTGAAGACAGAGACCATCCTCAAGAC  944
            ||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.||.|||||
Sbjct  925  TCCATCTATTTCAACAAATTCCAGAGTCACATTATCATTAGGTTTGACCTGAAGACAGAGACGATTCTGAAGAC  998

Query  945  CCGCAGCCTGGACTATGCCGGTTACAACAACATGTACCACTACGCCTGGGGTGGCCACTCGGACATCGACCTCA  1018
            .|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct  999  GCGCAGCCTGGACTATGCTGGCTACAACAATATGTATCACTATGCCTGGGGCGGCCACTCAGACATCGACCTCA  1072

Query 1019  TGGTGGACGAGAGCGGGCTGTGGGCCGTGTACGCCACCAACCAGAACGCTGGCAACATCGTGGTCAGTAGGCTG  1092
            ||||||||||||..|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||||||.||||||||.||..||||.|.||||
Sbjct 1073  TGGTGGACGAGAATGGGCTCTGGGCTGTCTATGCCACAAACCAGAACGCAGGCAACATTGTCATCAGCAAGCTG  1146

Query 1093  GACCCCGTGTCCCTGCAGACCCTGCAGACCTGGAACACGAGCTACCCCAAGCGCAGCGCCGGGGAGGCCTTCAT  1166
            ||.||.||.||.|||||||.|||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1147  GATCCTGTCTCACTGCAGATCCTCCAGACCTGGAACACCAGCTACCCCAAGCGCAGTGCCGGTGAGGCCTTCAT  1220

Query 1167  CATCTGCGGCACGCTGTACGTCACCAACGGCTACTCAGGGGGTACCAAGGTCCACTATGCATACCAGACCAATG  1240
            ||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1221  CATCTGCGGCACCCTCTATGTCACCAACGGTTACTCGGGGGGCACCAAGGTCCACTATGCCTACCAAACCAACG  1294

Query 1241  CCTCCACCTATGAATACATCGACATCCCATTCCAGAACAAATACTCCCACATCTCCATGCTGGACTACAACCCC  1314
            ||||.|||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1295  CCTCGACCTACGAGTACATTGACATCCCCTTCCAGAACAAATACTCTCACATCTCCATGCTGGACTACAACCCT  1368

Query 1315  AAGGACCGGGCCCTGTATGCCTGGAACAACGGCCACCAGATCCTCTACAACGTGACCCTCTTCCACGTCATCCG  1388
            ||.|||||.||.|||||.|||||||||||.|||||.||||.||||||.||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1369  AAAGACCGCGCGCTGTACGCCTGGAACAATGGCCATCAGACCCTCTATAATGTCACCCTCTTCCATGTCATCCG  1442

Query 1389  CTCCGACGAGTTG  1401
            ||||||.||||||
Sbjct 1443  CTCCGATGAGTTG  1455