Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07620
• Subject: NM_001363533.1
• Aligned Length: 1431
• Identities: 1094
• Gaps: 336

Alignment

Query    1  ATGGCCAACATGCAGGGACTGGTGGAAAGACTGGAACGAGCTGTCAGCCGCCTGGAGTCGCTGTCTGCAGAGTC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCAACATGCAGGGACTGGTGGAAAGACTGGAACGAGCTGTCAGCCGCCTGGAGTCGCTGTCTGCAGAGTC  74

Query   75  CCACAGGCCCCCTGGGAACTGCGGGGAAGTCAATGGTGTCATTGCAGGTGTGGCACCCTCCGTGGAAGCCTTTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCACAGGCCCCCTGGGAACTGCGGGGAAGTCAATGGTGTCATTGCAGGTGTGGCACCCTCCGTGGAAGCCTTTG  148

Query  149  ACAAGCTGATGGACAGTATGGTGGCCGAGTTTTTAAAGAACAGTAGGATCCTTGCTGGGGACGTGGAGACCCAT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAAGCTGATGGACAGTATGGTGGCCGAGTTTTTAAAGAACAGTAGGATCCTTGCTGGGGACGTGGAGACCCAT  222

Query  223  GCAGAAATGGTGCACAGTGCTTTCCAGGCCCAGCGGGCTTTCCTTCTGATGGCCTCTCAGTACCAACAACCCCA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCAGAAATGGTGCACAGTGCTTTCCAGGCCCAGCGGGCTTTCCTTCTGATGGCCTCTCAGTACCAACAACCCCA  296

Query  297  CGAGAATGACGTGGCCGCACTTCTGAAACCCATATCGGAAAAGATTCAGGAAATCCAAACTTTCAGAGAGAGAA  370
            ||||                                                                      
Sbjct  297  CGAG----------------------------------------------------------------------  300

Query  371  ACCGGGGGAGTAACATGTTTAATCATCTTTCGGCCGTCAGCGAAAGCATCCCTGCCCTTGGATGGATAGCTGTG  444
                                                                                      
Sbjct  301  --------------------------------------------------------------------------  300

Query  445  TCTCCCAAACCTGGTCCTTATGTCAAGGAGATGAATGACGCTGCCACCTTTTACACTAACAGGGTCTTAAAGGA  518
                                                                                      
Sbjct  301  --------------------------------------------------------------------------  300

Query  519  CTACAAACACAGTGATTTGCGTCATGTGGATTGGGTGAAGTCATATTTGAACATTTGGAGTGAACTTCAAGCAT  592
                                                                                      
Sbjct  301  --------------------------------------------------------------------------  300

Query  593  ACATCAAGGAACACCACACCACGGGCCTCACATGGAGCAAAACAGGTCCTGTAGCATCCACAGTATCAGCGTTT  666
                                                        ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  301  --------------------------------------------GGTCCTGTAGCATCCACAGTATCAGCGTTT  330

Query  667  TCTGTCCTCTCCTCTGGGCCTGGCCTTCCTCCACCCCCTCCTCCTCTGCCTCCTCCAGGGCCACCTCCACTTTT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  331  TCTGTCCTCTCCTCTGGGCCTGGCCTTCCTCCACCCCCTCCTCCTCTGCCTCCTCCAGGGCCACCTCCACTTTT  404

Query  741  CGAGAATGAAGGCAAAAAAGAGGAATCTTCTCCTTCACGCTCAGCTTTATTTGCCCAACTTAACCAGGGAGAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  405  CGAGAATGAAGGCAAAAAAGAGGAATCTTCTCCTTCACGCTCAGCTTTATTTGCCCAACTTAACCAGGGAGAAG  478

Query  815  CAATTACAAAAGGGCTCCGCCATGTCACAGATGACCAGAAGACATACAAAAATCCCAGCCTGCGGGCTCAAGGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  CAATTACAAAAGGGCTCCGCCATGTCACAGATGACCAGAAGACATACAAAAATCCCAGCCTGCGGGCTCAAGGA  552

Query  889  GGGCAAACTCAATCTCCCACCAAAAGTCACACTCCAAGTCCCACATCTCCTAAATCTTATCCTTCTCAAAAACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  GGGCAAACTCAATCTCCCACCAAAAGTCACACTCCAAGTCCCACATCTCCTAAATCTTATCCTTCTCAAAAACA  626

Query  963  TGCCCCAGTGTTGGAGTTGGAAGGAAAGAAATGGAGAGTGGAGTACCAAGAGGACAGGAATGACCTTGTGATTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  TGCCCCAGTGTTGGAGTTGGAAGGAAAGAAATGGAGAGTGGAGTACCAAGAGGACAGGAATGACCTTGTGATTT  700

Query 1037  CAGAGACTGAGCTGAAACAAGTGGCTTACATTTTCAAATGCGAAAAATCAACTATTCAGATAAAAGGGAAAGTA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  701  CAGAGACTGAGCTGAAACAAGTGGCTTACATTTTCAAATGCGAAAAATCAACTATTCAGATAAAAGGGAAAGTA  774

Query 1111  AACTCCATTATAATTGACAACTGTAAGAAACTCGGCCTGGTGTTTGACAATGTGGTGGGCATTGTGGAAGTGAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  AACTCCATTATAATTGACAACTGTAAAAAACTCGGCCTGGTGTTTGACAATGTGGTGGGCATTGTGGAAGTGAT  848

Query 1185  CAACTCCCAGGACATTCAAATCCAGGTAATGGGGAGAGTGCCAACAATTTCCATTAATAAGACAGAAGGTTGCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  CAACTCCCAGGACATTCAAATCCAGGTAATGGGGAGAGTGCCAACAATTTCCATTAATAAGACAGAAGGTTGCC  922

Query 1259  ACATATACCTCAGTGAAGATGCATTAGACTGTGAGATCGTGAGCGCCAAGTCATCTGAAATGAACATACTTATC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  923  ACATATACCTCAGTGAAGATGCATTAGACTGTGAGATCGTGAGCGCCAAGTCATCTGAAATGAACATACTTATC  996

Query 1333  CCTCAGGATGGTGATTATAGAGAATTTCCCATTCCTGAACAGTTCAAGACAGCATGGGATGGATCCAAGTTAAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  997  CCTCAGGATGGTGATTATAGAGAATTTCCCATTCCTGAACAGTTCAAGACAGCATGGGATGGATCCAAGTTAAT  1070

Query 1407  CACTGAACCTGCAGAAATTATGGCC  1431
            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1071  CACTGAACCTGCAGAAATTATGGCC  1095