Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07620
- Subject:
- NM_001363534.1
- Aligned Length:
- 1431
- Identities:
- 1352
- Gaps:
- 78
Alignment
Query 1 ATGGCCAACATGCAGGGACTGGTGGAAAGACTGGAACGAGCTGTCAGCCGCCTGGAGTCGCTGTCTGCAGAGTC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCCAACATGCAGGGACTGGTGGAAAGACTGGAACGAGCTGTCAGCCGCCTGGAGTCGCTGTCTGCAGAGTC 74
Query 75 CCACAGGCCCCCTGGGAACTGCGGGGAAGTCAATGGTGTCATTGCAGGTGTGGCACCCTCCGTGGAAGCCTTTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCACAGGCCCCCTGGGAACTGCGGGGAAGTCAATGGTGTCATTGCAGGTGTGGCACCCTCCGTGGAAGCCTTTG 148
Query 149 ACAAGCTGATGGACAGTATGGTGGCCGAGTTTTTAAAGAACAGTAGGATCCTTGCTGGGGACGTGGAGACCCAT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACAAGCTGATGGACAGTATGGTGGCCGAGTTTTTAAAGAACAGTAGGATCCTTGCTGGGGACGTGGAGACCCAT 222
Query 223 GCAGAAATGGTGCACAGTGCTTTCCAGGCCCAGCGGGCTTTCCTTCTGATGGCCTCTCAGTACCAACAACCCCA 296
Sbjct 223 -------------------------------------------------------------------------- 222
Query 297 CGAGAATGACGTGGCCGCACTTCTGAAACCCATATCGGAAAAGATTCAGGAAATCCAAACTTTCAGAGAGAGAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ----AATGACGTGGCCGCACTTCTGAAACCCATATCGGAAAAGATTCAGGAAATCCAAACTTTCAGAGAGAGAA 292
Query 371 ACCGGGGGAGTAACATGTTTAATCATCTTTCGGCCGTCAGCGAAAGCATCCCTGCCCTTGGATGGATAGCTGTG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 293 ACCGGGGGAGTAACATGTTTAATCATCTTTCGGCCGTCAGCGAAAGCATCCCTGCCCTTGGATGGATAGCTGTG 366
Query 445 TCTCCCAAACCTGGTCCTTATGTCAAGGAGATGAATGACGCTGCCACCTTTTACACTAACAGGGTCTTAAAGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 367 TCTCCCAAACCTGGTCCTTATGTCAAGGAGATGAATGACGCTGCCACCTTTTACACTAACAGGGTCTTAAAGGA 440
Query 519 CTACAAACACAGTGATTTGCGTCATGTGGATTGGGTGAAGTCATATTTGAACATTTGGAGTGAACTTCAAGCAT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 441 CTACAAACACAGTGATTTGCGTCATGTGGATTGGGTGAAGTCATATTTGAACATTTGGAGTGAACTTCAAGCAT 514
Query 593 ACATCAAGGAACACCACACCACGGGCCTCACATGGAGCAAAACAGGTCCTGTAGCATCCACAGTATCAGCGTTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 515 ACATCAAGGAACACCACACCACGGGCCTCACATGGAGCAAAACAGGTCCTGTAGCATCCACAGTATCAGCGTTT 588
Query 667 TCTGTCCTCTCCTCTGGGCCTGGCCTTCCTCCACCCCCTCCTCCTCTGCCTCCTCCAGGGCCACCTCCACTTTT 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 589 TCTGTCCTCTCCTCTGGGCCTGGCCTTCCTCCACCCCCTCCTCCTCTGCCTCCTCCAGGGCCACCTCCACTTTT 662
Query 741 CGAGAATGAAGGCAAAAAAGAGGAATCTTCTCCTTCACGCTCAGCTTTATTTGCCCAACTTAACCAGGGAGAAG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 663 CGAGAATGAAGGCAAAAAAGAGGAATCTTCTCCTTCACGCTCAGCTTTATTTGCCCAACTTAACCAGGGAGAAG 736
Query 815 CAATTACAAAAGGGCTCCGCCATGTCACAGATGACCAGAAGACATACAAAAATCCCAGCCTGCGGGCTCAAGGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 737 CAATTACAAAAGGGCTCCGCCATGTCACAGATGACCAGAAGACATACAAAAATCCCAGCCTGCGGGCTCAAGGA 810
Query 889 GGGCAAACTCAATCTCCCACCAAAAGTCACACTCCAAGTCCCACATCTCCTAAATCTTATCCTTCTCAAAAACA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 811 GGGCAAACTCAATCTCCCACCAAAAGTCACACTCCAAGTCCCACATCTCCTAAATCTTATCCTTCTCAAAAACA 884
Query 963 TGCCCCAGTGTTGGAGTTGGAAGGAAAGAAATGGAGAGTGGAGTACCAAGAGGACAGGAATGACCTTGTGATTT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 885 TGCCCCAGTGTTGGAGTTGGAAGGAAAGAAATGGAGAGTGGAGTACCAAGAGGACAGGAATGACCTTGTGATTT 958
Query 1037 CAGAGACTGAGCTGAAACAAGTGGCTTACATTTTCAAATGCGAAAAATCAACTATTCAGATAAAAGGGAAAGTA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 959 CAGAGACTGAGCTGAAACAAGTGGCTTACATTTTCAAATGCGAAAAATCAACTATTCAGATAAAAGGGAAAGTA 1032
Query 1111 AACTCCATTATAATTGACAACTGTAAGAAACTCGGCCTGGTGTTTGACAATGTGGTGGGCATTGTGGAAGTGAT 1184
||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1033 AACTCCATTATAATTGACAACTGTAAAAAACTCGGCCTGGTGTTTGACAATGTGGTGGGCATTGTGGAAGTGAT 1106
Query 1185 CAACTCCCAGGACATTCAAATCCAGGTAATGGGGAGAGTGCCAACAATTTCCATTAATAAGACAGAAGGTTGCC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1107 CAACTCCCAGGACATTCAAATCCAGGTAATGGGGAGAGTGCCAACAATTTCCATTAATAAGACAGAAGGTTGCC 1180
Query 1259 ACATATACCTCAGTGAAGATGCATTAGACTGTGAGATCGTGAGCGCCAAGTCATCTGAAATGAACATACTTATC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1181 ACATATACCTCAGTGAAGATGCATTAGACTGTGAGATCGTGAGCGCCAAGTCATCTGAAATGAACATACTTATC 1254
Query 1333 CCTCAGGATGGTGATTATAGAGAATTTCCCATTCCTGAACAGTTCAAGACAGCATGGGATGGATCCAAGTTAAT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1255 CCTCAGGATGGTGATTATAGAGAATTTCCCATTCCTGAACAGTTCAAGACAGCATGGGATGGATCCAAGTTAAT 1328
Query 1407 CACTGAACCTGCAGAAATTATGGCC 1431
|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1329 CACTGAACCTGCAGAAATTATGGCC 1353