Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07620
- Subject:
- NM_026056.4
- Aligned Length:
- 1442
- Identities:
- 1216
- Gaps:
- 25
Alignment
Query 1 ATGGCCAACATGCAGGGACTGGTGGAAAGACTGGAACGAGCTGTCAGCCGCCTGGAGTCGCTGTCTGCAGAG-- 72
|||.|..|||||..|||||||.||||.||.||||||||.||.||||.|||.||||||..|||||||||||.|
Sbjct 1 ATGACAGACATGGCGGGACTGATGGAGAGGCTGGAACGTGCAGTCATCCGGCTGGAGCAGCTGTCTGCAGGGTT 74
Query 73 ---------TCCCACAGGCCCCCTGGGAACTGCGGGGAAGTCAATGGTGTCATTGCAGGTGTGGCACCCTCCGT 137
|||||.||| ||||||||||||.||||||||||.||.||||||||||||.|||||
Sbjct 75 AGACGGACCTCCCAGAGG-----------CTGCGGGGAAGTGAATGGTGTCAATGGAGGTGTGGCACCGTCCGT 137
Query 138 GGAAGCCTTTGACAAGCTGATGGACAGTATGGTGGCCGAGTTTTTAAAGAACAGTAGGATCCTTGCTGGGGACG 211
||||||.||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||..|..||||||||||.||||
Sbjct 138 GGAAGCTTTTGACAAACTGATAAACAGTATGGTGGCCGAGTTCTTAAAGAACAGCCGAGTCCTTGCTGGTGACG 211
Query 212 TGGAGACCCATGCAGAAATGGTGCACAGTGCTTTCCAGGCCCAGCGGGCTTTCCTTCTGATGGCCTCTCAGTAC 285
|.|||||.||.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||.|||.||||||
Sbjct 212 TAGAGACTCACGCAGAAATGGTGCACGGTGCTTTCCAAGCCCAGCGTGCTTTTCTTCTCATGGTCTCGCAGTAC 285
Query 286 CAACAACCCCACGAGAATGACGTGGCCGCACTTCTGAAACCCATATCGGAAAAGATTCAGGAAATCCAAACTTT 359
|||||||||||.||||||||.||.||.|..||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 286 CAACAACCCCAAGAGAATGAAGTTGCTGTCCTTCTGAAGCCCATATCGGAGAAGATTCAAGAAATACAGACTTT 359
Query 360 CAGAGAGAGAAACCGGGGGAGTAACATGTTTAATCATCTTTCGGCCGTCAGCGAAAGCATCCCTGCCCTTGGAT 433
|.||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||.|||||||||.|.|||||.||.|
Sbjct 360 CCGAGAGAGAAACCGGGGAAGCAACATGTTCAACCACCTCTCGGCAGTCAGTGAAAGCATCGCCGCCCTGGGCT 433
Query 434 GGATAGCTGTGTCTCCCAAACCTGGTCCTTATGTCAAGGAGATGAATGACGCTGCCACCTTTTACACTAACAGG 507
|||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 434 GGATAGCCGTGTCCCCCAAACCTGGTCCTTATGTCAAGGAGATGAACGACGCTGCCACCTTTTACACAAACAGG 507
Query 508 GTCTTAAAGGACTACAAACACAGTGATTTGCGTCATGTGGATTGGGTGAAGTCATATTTGAACATTTGGAGTGA 581
|||.|.||.||||||||.|||||.|||.||||.||.|||||||||||||.|||.||..|.|||||.|||||.||
Sbjct 508 GTCCTGAAAGACTACAAGCACAGCGATCTGCGCCACGTGGATTGGGTGAGGTCCTACCTCAACATCTGGAGCGA 581
Query 582 ACTTCAAGCATACATCAAGGAACACCACACCACGGGCCTCACATGGAGCAAAACAGGTCCTGTAGCATCCACAG 655
.||.|||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 582 GCTGCAAGCCTACATCAGGGAACACCACACCACAGGCCTCACTTGGAGCAAAACAGGTCCTGTGGCATCCACAG 655
Query 656 TATCAGCGTTTTCTGTCCTCTCCTCTGGGCCTGGCCTTCCTCCACCCCCTCCTCCTCTGCCTCCTCCAGGGCCA 729
..|||||||||||..|||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.|..||||||||.||||||
Sbjct 656 CGTCAGCGTTTTCCATCCTCTCCTCTGGGCCTGGTCTCCCGCCACCACCTCCACCACCACCTCCTCCTGGGCCA 729
Query 730 CCTCCACTTTTCGAGAATGAAGGCAAAAAAGAGGAATCTTCTCCTTCACGCTCAGCTTTATTTGCCCAACTTAA 803
|||||||..||.||||||||.|..|||||.|||||..|.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||
Sbjct 730 CCTCCACCCTTTGAGAATGAGGATAAAAAGGAGGAGCCCTCCCCTTCTCGCTCAGCTTTATTTGCCCAGCTCAA 803
Query 804 CCAGGGAGAAGCAATTACAAAAGGGCTCCGCCATGTCACAGATGACCAGAAGACATACAAAAATCCCAGCCTGC 877
.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct 804 TCAAGGAGAAGCCATCACTAAAGGGCTCCGGCATGTCACAGATGACAAGAAGACATACAAGAATCCCAGCCTGA 877
Query 878 GGGCTCAAGGAGGGCAAACTCAATCTCCCACCAAAAGTCACACTCCAAGTCCCACATCTCCTAAATCTTATCCT 951
||||||||||| ||.|.||..|||||.|||||||.||||||.||.||.|||||||||||.|||||..||.||
Sbjct 878 GGGCTCAAGGA---CAGATTCGCTCTCCAACCAAAACTCACACGCCGAGCCCCACATCTCCAAAATCGAATTCT 948
Query 952 TCTCAAAAACATGCCCCAGTGTTGGAGTTGGAAGGAAAGAAATGGAGAGTGGAGTACCAAGAGGACAGGAATGA 1025
.||||.||||||.|.||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 949 CCTCAGAAACATACTCCAGTGTTGGAGCTGGAAGGGAAGAAGTGGAGAGTGGAATACCAAGAGGACAGGAATGA 1022
Query 1026 CCTTGTGATTTCAGAGACTGAGCTGAAACAAGTGGCTTACATTTTCAAATGCGAAAAATCAACTATTCAGATAA 1099
||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||.|||||||||
Sbjct 1023 CCTTGTCATCTCCGAGACCGAGCTGAAACAAGTGGCTTACATTTTCAAATGTGACAAATCCACTCTTCAGATAA 1096
Query 1100 AAGGGAAAGTAAACTCCATTATAATTGACAACTGTAAGAAACTCGGCCTGGTGTTTGACAATGTGGTGGGCATT 1173
|.||.|||||.||||||||.|...|.||.|||||.|||||..|.||||||||||||||..||||||||||||||
Sbjct 1097 AGGGAAAAGTGAACTCCATCACTGTCGATAACTGCAAGAAGTTTGGCCTGGTGTTTGATCATGTGGTGGGCATT 1170
Query 1174 GTGGAAGTGATCAACTCCCAGGACATTCAAATCCAGGTAATGGGGAGAGTGCCAACAATTTCCATTAATAAGAC 1247
||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 1171 GTGGAAGTGATCAACTCCAAGGACATTCAGATCCAGGTAATGGGGAGAGTACCAACAATCTCCATTAATAAGAC 1244
Query 1248 AGAAGGTTGCCACATATACCTCAGTGAAGATGCATTAGACTGTGAGATCGTGAGCGCCAAGTCATCTGAAATGA 1321
||||||.||||||.|.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct 1245 AGAAGGATGCCACCTGTACCTCAGTGAAGATGCACTAGACTGTGAGATCGTGAGCGCGAAGTCGTCCGAGATGA 1318
Query 1322 ACATACTTATCCCTCAGGATGGTGATTATAGAGAATTTCCCATTCCTGAACAGTTCAAGACAGCATGGGATGGA 1395
|..|.||..||||||||||||..||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||..|||||||||.
Sbjct 1319 ATGTCCTGGTCCCTCAGGATGACGATTATAGAGAATTCCCCATTCCCGAGCAGTTCAAGACAATATGGGATGGC 1392
Query 1396 TCCAAGTTAATCACTGAACCTGCAGAAATTATGGCC 1431
||||||.|..||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1393 TCCAAGCTGGTCACCGAACCTGCAGAGATCATGGCC 1428