Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07620
- Subject:
- XM_006516946.2
- Aligned Length:
- 1532
- Identities:
- 1216
- Gaps:
- 115
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGGCCCGCCATGCACATGAGACTATTTATTCTCATCAACACCACAGAGGCTGTGCATTAAGTCATGTCGGAAT 74
Query 1 ----------------ATGGCCAACATGCAGGGACTGGTGGAAAGACTGGAACGAGCTGTCAGCCGCCTGGAGT 58
|||.|..|||||..|||||||.||||.||.||||||||.||.||||.|||.||||||.
Sbjct 75 CCAGGCGTTCTTTATAATGACAGACATGGCGGGACTGATGGAGAGGCTGGAACGTGCAGTCATCCGGCTGGAGC 148
Query 59 CGCTGTCTGCAGAG-----------TCCCACAGGCCCCCTGGGAACTGCGGGGAAGTCAATGGTGTCATTGCAG 121
.|||||||||||.| |||||.||| ||||||||||||.||||||||||.||.||
Sbjct 149 AGCTGTCTGCAGGGTTAGACGGACCTCCCAGAGG-----------CTGCGGGGAAGTGAATGGTGTCAATGGAG 211
Query 122 GTGTGGCACCCTCCGTGGAAGCCTTTGACAAGCTGATGGACAGTATGGTGGCCGAGTTTTTAAAGAACAGTAGG 195
||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||..|.
Sbjct 212 GTGTGGCACCGTCCGTGGAAGCTTTTGACAAACTGATAAACAGTATGGTGGCCGAGTTCTTAAAGAACAGCCGA 285
Query 196 ATCCTTGCTGGGGACGTGGAGACCCATGCAGAAATGGTGCACAGTGCTTTCCAGGCCCAGCGGGCTTTCCTTCT 269
.||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||.||||||||||.||||||||.|||||.|||||
Sbjct 286 GTCCTTGCTGGTGACGTAGAGACTCACGCAGAAATGGTGCACGGTGCTTTCCAAGCCCAGCGTGCTTTTCTTCT 359
Query 270 GATGGCCTCTCAGTACCAACAACCCCACGAGAATGACGTGGCCGCACTTCTGAAACCCATATCGGAAAAGATTC 343
.||||.|||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.|..||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 360 CATGGTCTCGCAGTACCAACAACCCCAAGAGAATGAAGTTGCTGTCCTTCTGAAGCCCATATCGGAGAAGATTC 433
Query 344 AGGAAATCCAAACTTTCAGAGAGAGAAACCGGGGGAGTAACATGTTTAATCATCTTTCGGCCGTCAGCGAAAGC 417
|.|||||.||.||||||.||||||||||||||||.||.||||||||.||.||.||.|||||.|||||.||||||
Sbjct 434 AAGAAATACAGACTTTCCGAGAGAGAAACCGGGGAAGCAACATGTTCAACCACCTCTCGGCAGTCAGTGAAAGC 507
Query 418 ATCCCTGCCCTTGGATGGATAGCTGTGTCTCCCAAACCTGGTCCTTATGTCAAGGAGATGAATGACGCTGCCAC 491
|||.|.|||||.||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 508 ATCGCCGCCCTGGGCTGGATAGCCGTGTCCCCCAAACCTGGTCCTTATGTCAAGGAGATGAACGACGCTGCCAC 581
Query 492 CTTTTACACTAACAGGGTCTTAAAGGACTACAAACACAGTGATTTGCGTCATGTGGATTGGGTGAAGTCATATT 565
|||||||||.|||||||||.|.||.||||||||.|||||.|||.||||.||.|||||||||||||.|||.||..
Sbjct 582 CTTTTACACAAACAGGGTCCTGAAAGACTACAAGCACAGCGATCTGCGCCACGTGGATTGGGTGAGGTCCTACC 655
Query 566 TGAACATTTGGAGTGAACTTCAAGCATACATCAAGGAACACCACACCACGGGCCTCACATGGAGCAAAACAGGT 639
|.|||||.|||||.||.||.|||||.|||||||.|||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 656 TCAACATCTGGAGCGAGCTGCAAGCCTACATCAGGGAACACCACACCACAGGCCTCACTTGGAGCAAAACAGGT 729
Query 640 CCTGTAGCATCCACAGTATCAGCGTTTTCTGTCCTCTCCTCTGGGCCTGGCCTTCCTCCACCCCCTCCTCCTCT 713
|||||.||||||||||..|||||||||||..|||||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||.||.|.
Sbjct 730 CCTGTGGCATCCACAGCGTCAGCGTTTTCCATCCTCTCCTCTGGGCCTGGTCTCCCGCCACCACCTCCACCACC 803
Query 714 GCCTCCTCCAGGGCCACCTCCACTTTTCGAGAATGAAGGCAAAAAAGAGGAATCTTCTCCTTCACGCTCAGCTT 787
.||||||||.|||||||||||||..||.||||||||.|..|||||.|||||..|.||.|||||.||||||||||
Sbjct 804 ACCTCCTCCTGGGCCACCTCCACCCTTTGAGAATGAGGATAAAAAGGAGGAGCCCTCCCCTTCTCGCTCAGCTT 877
Query 788 TATTTGCCCAACTTAACCAGGGAGAAGCAATTACAAAAGGGCTCCGCCATGTCACAGATGACCAGAAGACATAC 861
||||||||||.||.||.||.||||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 878 TATTTGCCCAGCTCAATCAAGGAGAAGCCATCACTAAAGGGCTCCGGCATGTCACAGATGACAAGAAGACATAC 951
Query 862 AAAAATCCCAGCCTGCGGGCTCAAGGAGGGCAAACTCAATCTCCCACCAAAAGTCACACTCCAAGTCCCACATC 935
||.||||||||||||.||||||||||| ||.|.||..|||||.|||||||.||||||.||.||.||||||||
Sbjct 952 AAGAATCCCAGCCTGAGGGCTCAAGGA---CAGATTCGCTCTCCAACCAAAACTCACACGCCGAGCCCCACATC 1022
Query 936 TCCTAAATCTTATCCTTCTCAAAAACATGCCCCAGTGTTGGAGTTGGAAGGAAAGAAATGGAGAGTGGAGTACC 1009
|||.|||||..||.||.||||.||||||.|.||||||||||||.|||||||.|||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1023 TCCAAAATCGAATTCTCCTCAGAAACATACTCCAGTGTTGGAGCTGGAAGGGAAGAAGTGGAGAGTGGAATACC 1096
Query 1010 AAGAGGACAGGAATGACCTTGTGATTTCAGAGACTGAGCTGAAACAAGTGGCTTACATTTTCAAATGCGAAAAA 1083
||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1097 AAGAGGACAGGAATGACCTTGTCATCTCCGAGACCGAGCTGAAACAAGTGGCTTACATTTTCAAATGTGACAAA 1170
Query 1084 TCAACTATTCAGATAAAAGGGAAAGTAAACTCCATTATAATTGACAACTGTAAGAAACTCGGCCTGGTGTTTGA 1157
||.|||.||||||||||.||.|||||.||||||||.|...|.||.|||||.|||||..|.||||||||||||||
Sbjct 1171 TCCACTCTTCAGATAAAGGGAAAAGTGAACTCCATCACTGTCGATAACTGCAAGAAGTTTGGCCTGGTGTTTGA 1244
Query 1158 CAATGTGGTGGGCATTGTGGAAGTGATCAACTCCCAGGACATTCAAATCCAGGTAATGGGGAGAGTGCCAACAA 1231
..||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1245 TCATGTGGTGGGCATTGTGGAAGTGATCAACTCCAAGGACATTCAGATCCAGGTAATGGGGAGAGTACCAACAA 1318
Query 1232 TTTCCATTAATAAGACAGAAGGTTGCCACATATACCTCAGTGAAGATGCATTAGACTGTGAGATCGTGAGCGCC 1305
|.||||||||||||||||||||.||||||.|.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1319 TCTCCATTAATAAGACAGAAGGATGCCACCTGTACCTCAGTGAAGATGCACTAGACTGTGAGATCGTGAGCGCG 1392
Query 1306 AAGTCATCTGAAATGAACATACTTATCCCTCAGGATGGTGATTATAGAGAATTTCCCATTCCTGAACAGTTCAA 1379
|||||.||.||.|||||..|.||..||||||||||||..||||||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct 1393 AAGTCGTCCGAGATGAATGTCCTGGTCCCTCAGGATGACGATTATAGAGAATTCCCCATTCCCGAGCAGTTCAA 1466
Query 1380 GACAGCATGGGATGGATCCAAGTTAATCACTGAACCTGCAGAAATTATGGCC 1431
||||..|||||||||.||||||.|..||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1467 GACAATATGGGATGGCTCCAAGCTGGTCACCGAACCTGCAGAGATCATGGCC 1518