Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07628
• Subject: XM_005252343.5
• Aligned Length: 3042
• Identities: 2798
• Gaps: 243

Alignment

Query    1  ATGAGGGTCCCTGTATTTGAGGATATAAAAGATGAAACTGAAGAAGAAAAGATAGGGGAAGAAGAAAATGAAGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAGGGTCCCTGTATTTGAGGATATAAAAGATGAAACTGAAGAAGAAAAGATAGGGGAAGAAGAAAATGAAGA  74

Query   75  AGACCAGGTCTTCTATAAGCCTGTTATTGAAGACTTAAGCATGGAATTGGCCAGAAAATGCACGGAACTCATTA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGACCAGGTCTTCTATAAGCCTGTTATTGAAGACTTAAGCATGGAATTGGCCAGAAAATGCACGGAACTCATTA  148

Query  149  GCGATATCCGTTATAAAGAAGAGTTTAAAAAGTCCAAGGATAAGTGTACATTTGTGACTGACAGTCCTATGCTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCGATATCCGTTATAAAGAAGAGTTTAAAAAGTCCAAGGATAAGTGTACATTTGTGACTGACAGTCCTATGCTA  222

Query  223  AACCATGTAAAAAATATCGGTGCTTTTATTTCTGAGGCAAAATACAAAGGCACCATTAAAGCTGACCTTTCTAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AACCATGTAAAAAATATCGGTGCTTTTATTTCTGAGGCAAAATACAAAGGCACCATTAAAGCTGACCTTTCTAA  296

Query  297  TTCTCTTTATAAGCGGATGCCAGCCACAATTGACAGTGTTTTTGCAGGAGAAGTTACACAGCTCCAGAGTGAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTCTCTTTATAAGCGGATGCCAGCCACAATTGACAGTGTTTTTGCAGGAGAAGTTACACAGCTCCAGAGTGAGG  370

Query  371  TGGCCTACAAGCAGAAACATGATGCTGCCAAAGGATTCTCAGATTATGCCCACATGAAGGAGCCCCCTGAGGTT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGGCCTACAAGCAGAAACATGATGCTGCCAAAGGATTCTCAGATTATGCCCACATGAAGGAGCCCCCTGAGGTT  444

Query  445  AAACATGCCATGGAGGTCAATAAACACCAGAGTAATATTTCTTATAGGAAAGACGTGCAGGACACCCACACGTA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AAACATGCCATGGAGGTCAATAAACACCAGAGTAATATTTCTTATAGGAAAGACGTGCAGGACACCCACACGTA  518

Query  519  CAGTGCAGAACTTGACCGACCAGACATCAAGATGGCAACCCAGATCTCTAAGATCATAAGCAATGCAGAATACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGTGCAGAACTTGACCGACCAGACATCAAGATGGCAACCCAGATCTCTAAGATCATAAGCAATGCAGAATACA  592

Query  593  AGAAAGGACAAGGAATAATGAATAAAGAGCCCGCTGTAATTGGAAGACCAGATTTTGAACATGCCGTGGAAGCT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGAAAGGACAAGGAATAATGAATAAAGAGCCCGCTGTAATTGGAAGACCAGATTTTGAACATGCCGTGGAAGCT  666

Query  667  TCTAAACTTTCTAGTCAAATTAAATACAAAGAAAAATTTGATAATGAAATGAAGGATAAGAAACATCATTACAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTAAACTTTCTAGTCAAATTAAATACAAAGAAAAATTTGATAATGAAATGAAGGATAAGAAACATCATTACAA  740

Query  741  TCCTCTTGAAAGTGCTTCTTTTAGGCAGAATCAGCTTGCTGCTACACTGGCGAGCAATGTGAAGTACAAGAAAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCCTCTTGAAAGTGCTTCTTTTAGGCAGAATCAGCTTGCTGCTACACTGGCGAGCAATGTGAAGTACAAGAAAG  814

Query  815  ACATTCAAAATATGCATGATCCAGTTTCAGATCTCCCAAATTTGTTGTTTTTAGACCATGTTTTGAAAGCCAGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ACATTCAAAATATGCATGATCCAGTTTCAGATCTCCCAAATTTGTTGTTTTTAGACCATGTTTTGAAAGCCAGC  888

Query  889  AAAATGCTCAGCGGCCGAGAATATAAAAAGCTCTTTGAGGAAAACAAAGGAATGTATCATTTTGATGCAGATGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAATGCTCAGCGGCCGAGAATATAAAAAGCTCTTTGAGGAAAACAAAGGAATGTATCATTTTGATGCAGATGC  962

Query  963  TGTGGAACATCTGCACCATAAAGGCAATGCCGTCCTCCAAAGTCAGGTGAAATATAAAGAAGAATATGAGAAAA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTGGAACATCTGCACCATAAAGGCAATGCCGTCCTCCAAAGTCAGGTGAAATATAAAGAAGAATATGAGAAAA  1036

Query 1037  ATAAGGGAAAGCCAATGCTTGAATTTGTTGAGACACCATCATATCAAGCTTCAAAGGAGGCTCAAAAGATGCAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATAAGGGAAAGCCAATGCTTGAATTTGTTGAGACACCATCATATCAAGCTTCAAAGGAGGCTCAAAAGATGCAA  1110

Query 1111  AGTGAAAAAGTTTACAAAGAGGATTTTGAGAAGGAGATTAAAGGAAGGTCATCACTGGATTTAGACAAGACTCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AGTGAAAAAGTTTACAAAGAGGATTTTGAGAAGGAGATTAAAGGAAGGTCATCACTGGATTTAGACAAGACTCC  1184

Query 1185  AGAATTTTTACATGTAAAGTACATCACCAACCTTCTGAGGGAGAAAGAATATAAAAAAGATTTGGAAAATGAGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAATTTTTACATGTAAAGTACATCACCAACCTTCTGAGGGAGAAAGAATATAAAAAAGATTTGGAAAATGAGA  1258

Query 1259  TAAAAGGGAAAGGAATGGAACTTAATTCAGAAGTTCTTGATATCCAAAGAGCAAAGCGAGCCTCTGAAATGGCA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TAAAAGGGAAAGGAATGGAACTTAATTCAGAAGTTCTTGATATCCAAAGAGCAAAGCGAGCCTCTGAAATGGCA  1332

Query 1333  AGTGAGAAAGAATACAAGAAAGACCTGGAGTCAATAATTAAAGGGAAAGGAATGCAAGCTGGCACTGACACCCT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AGTGAGAAAGAATACAAGAAAGACCTGGAGTCAATAATTAAAGGGAAAGGAATGCAAGCTGGCACTGACACCCT  1406

Query 1407  TGAAATGCAGCATGCCAAGAAGGCTGCAGAGATAGCGAGTGAGAAAGACTATAAAAGAGATCTGGAGACTGAAA  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  TGAAATGCAGCATGCCAAGAAGGCTGCAGAGATAGCGAGTGAGAAAGACTATAAAAGAGATCTGGAGACTGAAA  1480

Query 1481  TTAAAGGGAAAGGGATGCAGGTGAGCACAGACACTCTTGATGTCCAGAGAGCTAAGAAAGCATCCGAGATGGCC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  TTAAAGGGAAAGGGATGCAGGTGAGCACAGACACTCTTGATGTCCAGAGAGCTAAGAAAGCATCCGAGATGGCC  1554

Query 1555  AGCCAGAAACAATACAAGAAGGACTTAGAAAATGAAATTAAAGGGAAAGGAATGCAAGTGAGCATGGATATCCC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AGCCAGAAACAATACAAGAAGGACTTAGAAAATGAAATTAAAGGGAAAGGAATGCAAGTGAGCATGGATATCCC  1628

Query 1629  AGATATCCTTCGAGCCAAGAGGACATCTGAAATCTATAGCCAGAGAAAGTATAAAGATGAAGCAGAGAAGATGC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  AGATATCCTTCGAGCCAAGAGGACATCTGAAATCTATAGCCAGAGAAAGTATAAAGATGAAGCAGAGAAGATGC  1702

Query 1703  TTTCTAACTATTCTACCATAGCAGATACTCCTGAAATTCAGAGAATTAAGACAACTCAACAAAACATTAGTGCG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  TTTCTAACTATTCTACCATAGCAGATACTCCTGAAATTCAGAGAATTAAGACAACTCAACAAAACATTAGTGCG  1776

Query 1777  GTATTTTATAAGAAAGAAGTGGGAGCTGGCACTGCAGTGAAAGATAGCCCAGAGATCGAACGAGTGAAGAAAAA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  GTATTTTATAAGAAAGAAGTGGGAGCTGGCACTGCAGTGAAAGATAGCCCAGAGATCGAACGAGTGAAGAAAAA  1850

Query 1851  TCAGCAGAATATTAGTTCAGTGAAATACAAAGAAGAGATTAAACATGCAACAGCCATTTCTGATCCTCCAGAAC  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TCAGCAGAATATTAGTTCAGTGAAATACAAAGAAGAGATTAAACATGCAACAGCCATTTCTGATCCTCCAGAAC  1924

Query 1925  TAAAGAGAGTTAAAGAAAACCAGAAGAACATCAGCAATCTCCAGTATAAAGAGCAAAACTACAAGGCCACTCCG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  TAAAGAGAGTTAAAGAAAACCAGAAGAACATCAGCAATCTCCAGTATAAAGAGCAAAACTACAAGGCCACTCCG  1998

Query 1999  GTAAGCATGACCCCGGAGATAGAGAGAGTGAGGCGAAACCAGGAGCAGCTGAGTGCGGTAAAATATAAGGGAGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  GTAAGCATGACCCCGGAGATAGAGAGAGTGAGGCGAAACCAGGAGCAGCTGAGTGCGGTAAAATATAAGGGAGA  2072

Query 2073  ACTTCAACGGGGAACTGCAATTTCTGATCCACCAGAGCTGAAGAGGGCAAAAGAAAACCAGAAAAACATCAGCA  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  ACTTCAACGGGGAACTGCAATTTCTGATCCACCAGAGCTGAAGAGGGCAAAAGAAAACCAGAAAAACATCAGCA  2146

Query 2147  ATGTTTATTACAGAGGTCAGCTGGGAAGAGCTACCACTTTAAGTGTAACTCCTGAAATGGAAAGAGTGAAGAAG  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  ATGTTTATTACAGAGGTCAGCTGGGAAGAGCTACCACTTTAAGTGTAACTCCTGAAATGGAAAGAGTGAAGAAG  2220

Query 2221  AATCAAGAAAATATTAGCTCGGTAAAATATACCCAGGACCATAAACAGATGAAAGGTAGACCAAGTCTGATTTT  2294
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221  AATCAAGAAAATATTAGCTCGGTAAAATATACCCAGGACCATAAACAGATGAAAGGTAGACCAAGTCTGATTTT  2294

Query 2295  AGATACACCTGCTATGAGACATGTTAAAGAAGCACAAAATCATATTTCAATGGTAAAATACCATGAAGATTTTG  2368
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295  AGATACACCTGCTATGAGACATGTTAAAGAAGCACAAAATCATATTTCAATGGTAAAATACCATGAAGATTTTG  2368

Query 2369  AAAAAACAAAGGGGAGAGGCTTTACTCCCGTCGTGGACGATCCTGTGACAGAGAGAGTGAGGAAGAACACCCAG  2442
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369  AAAAAACAAAGGGGAGAGGCTTTACTCCCGTCGTGGACGATCCTGTGACAGAGAGAGTGAGGAAGAACACCCAG  2442

Query 2443  GTGGTCAGCGATGCTGCCTATAAAGGGGTCCACCCTCACATCGTGGAGATGGACAGGAGACCTGGAATCATTGT  2516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443  GTGGTCAGCGATGCTGCCTATAAAGGGGTCCACCCTCACATCGTGGAGATGGACAGGAGACCTGGAATCATTGT  2516

Query 2517  TGACCTCAAAGTTTGGCGCACAGATCCTGGCTCCATCTTCGACCTTGATCCCCTGGAAGACAATATTCAGTCTA  2590
            |                                                                         
Sbjct 2517  T-------------------------------------------------------------------------  2517

Query 2591  GAAGTCTCCATATGCTCTCTGAAAAGGCGAGTCACTATAGGCGACACTGGTCTCGATCCCATTCCAGCAGTACT  2664
                                                                                      
Sbjct 2518  --------------------------------------------------------------------------  2517

Query 2665  TTCGGTACAGGTCTCGGAGACGACAGGTCAGAAATCTCCGAGATTTACCCTAGCTTTTCATGCTGCAGTGAGGT  2738
                                                                                      
Sbjct 2518  --------------------------------------------------------------------------  2517

Query 2739  AACAAGACCGTCTGATGAAGGAGCACCTGTTCTTCCCGGAGCCTATCAGCAAAGCCATTCCCAAGGCTATGGCT  2812
                                  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2518  ----------------------GCACCTGTTCTTCCCGGAGCCTATCAGCAAAGCCATTCCCAAGGCTATGGCT  2569

Query 2813  ACATGCACCAGACCAGTGTGTCATCCATGAGATCAATGCAGCATTCACCAAATCTAAGGACCTACCGAGCCATG  2886
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2570  ACATGCACCAGACCAGTGTGTCATCCATGAGATCAATGCAGCATTCACCAAATCTAAGGACCTACCGAGCCATG  2643

Query 2887  TACGATTACAGTGCCCAGGATGAAGACGAGGTCTCCTTTAGAGACGGCGACTACATCGTCAACGTGCAGCCTAT  2960
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2644  TACGATTACAGTGCCCAGGATGAAGACGAGGTCTCCTTTAGAGACGGCGACTACATCGTCAACGTGCAGCCTAT  2717

Query 2961  TGACGATGGCTGGATGTACGGCACAGTGCAGAGAACGGGGAGAACAGGAATGCTCCCAGCGAATTACATTGAGT  3034
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2718  TGACGATGGCTGGATGTACGGCACAGTGCAGAGAACAGGGAGAACAGGAATGCTCCCAGCGAATTACATTGAGT  2791

Query 3035  TTGTTAAT  3042
            ||||||||
Sbjct 2792  TTGTTAAT  2799