Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07628
• Subject: XM_017015468.1
• Aligned Length: 3053
• Identities: 2979
• Gaps: 70

Alignment

Query    1  ATGAGGGTCCCTGTATTTGAGGATATAAAAGATGA-----AACTG------AAGAAGAAAAGATAGGGGAAGAA  63
                                           ||||     |||||      |||                    
Sbjct    1  -------------------------------ATGAGAAATAACTGCACTGCAAG--------------------  23

Query   64  GAAAATGAAGAAGACCAGGTCTTCTATAAGCCTGTTATTGAAGACTTAAGCATGGAATTGGCCAGAAAATGCAC  137
               ..|||.||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   24  ---CCTGATGA-----AGGTCTTCTATAAGCCTGTTATTGAAGACTTAAGCATGGAATTGGCCAGAAAATGCAC  89

Query  138  GGAACTCATTAGCGATATCCGTTATAAAGAAGAGTTTAAAAAGTCCAAGGATAAGTGTACATTTGTGACTGACA  211
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   90  GGAACTCATTAGCGATATCCGTTATAAAGAAGAGTTTAAAAAGTCCAAGGATAAGTGTACATTTGTGACTGACA  163

Query  212  GTCCTATGCTAAACCATGTAAAAAATATCGGTGCTTTTATTTCTGAGGCAAAATACAAAGGCACCATTAAAGCT  285
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  164  GTCCTATGCTAAACCATGTAAAAAATATCGGTGCTTTTATTTCTGAGGCAAAATACAAAGGCACCATTAAAGCT  237

Query  286  GACCTTTCTAATTCTCTTTATAAGCGGATGCCAGCCACAATTGACAGTGTTTTTGCAGGAGAAGTTACACAGCT  359
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  238  GACCTTTCTAATTCTCTTTATAAGCGGATGCCAGCCACAATTGACAGTGTTTTTGCAGGAGAAGTTACACAGCT  311

Query  360  CCAGAGTGAGGTGGCCTACAAGCAGAAACATGATGCTGCCAAAGGATTCTCAGATTATGCCCACATGAAGGAGC  433
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  312  CCAGAGTGAGGTGGCCTACAAGCAGAAACATGATGCTGCCAAAGGATTCTCAGATTATGCCCACATGAAGGAGC  385

Query  434  CCCCTGAGGTTAAACATGCCATGGAGGTCAATAAACACCAGAGTAATATTTCTTATAGGAAAGACGTGCAGGAC  507
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  386  CCCCTGAGGTTAAACATGCCATGGAGGTCAATAAACACCAGAGTAATATTTCTTATAGGAAAGACGTGCAGGAC  459

Query  508  ACCCACACGTACAGTGCAGAACTTGACCGACCAGACATCAAGATGGCAACCCAGATCTCTAAGATCATAAGCAA  581
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  460  ACCCACACGTACAGTGCAGAACTTGACCGACCAGACATCAAGATGGCAACCCAGATCTCTAAGATCATAAGCAA  533

Query  582  TGCAGAATACAAGAAAGGACAAGGAATAATGAATAAAGAGCCCGCTGTAATTGGAAGACCAGATTTTGAACATG  655
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  534  TGCAGAATACAAGAAAGGACAAGGAATAATGAATAAAGAGCCCGCTGTAATTGGAAGACCAGATTTTGAACATG  607

Query  656  CCGTGGAAGCTTCTAAACTTTCTAGTCAAATTAAATACAAAGAAAAATTTGATAATGAAATGAAGGATAAGAAA  729
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  608  CCGTGGAAGCTTCTAAACTTTCTAGTCAAATTAAATACAAAGAAAAATTTGATAATGAAATGAAGGATAAGAAA  681

Query  730  CATCATTACAATCCTCTTGAAAGTGCTTCTTTTAGGCAGAATCAGCTTGCTGCTACACTGGCGAGCAATGTGAA  803
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  682  CATCATTACAATCCTCTTGAAAGTGCTTCTTTTAGGCAGAATCAGCTTGCTGCTACACTGGCGAGCAATGTGAA  755

Query  804  GTACAAGAAAGACATTCAAAATATGCATGATCCAGTTTCAGATCTCCCAAATTTGTTGTTTTTAGACCATGTTT  877
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  756  GTACAAGAAAGACATTCAAAATATGCATGATCCAGTTTCAGATCTCCCAAATTTGTTGTTTTTAGACCATGTTT  829

Query  878  TGAAAGCCAGCAAAATGCTCAGCGGCCGAGAATATAAAAAGCTCTTTGAGGAAAACAAAGGAATGTATCATTTT  951
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  830  TGAAAGCCAGCAAAATGCTCAGCGGCCGAGAATATAAAAAGCTCTTTGAGGAAAACAAAGGAATGTATCATTTT  903

Query  952  GATGCAGATGCTGTGGAACATCTGCACCATAAAGGCAATGCCGTCCTCCAAAGTCAGGTGAAATATAAAGAAGA  1025
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  904  GATGCAGATGCTGTGGAACATCTGCACCATAAAGGCAATGCCGTCCTCCAAAGTCAGGTGAAATATAAAGAAGA  977

Query 1026  ATATGAGAAAAATAAGGGAAAGCCAATGCTTGAATTTGTTGAGACACCATCATATCAAGCTTCAAAGGAGGCTC  1099
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  978  ATATGAGAAAAATAAGGGAAAGCCAATGCTTGAATTTGTTGAGACACCATCATATCAAGCTTCAAAGGAGGCTC  1051

Query 1100  AAAAGATGCAAAGTGAAAAAGTTTACAAAGAGGATTTTGAGAAGGAGATTAAAGGAAGGTCATCACTGGATTTA  1173
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1052  AAAAGATGCAAAGTGAAAAAGTTTACAAAGAGGATTTTGAGAAGGAGATTAAAGGAAGGTCATCACTGGATTTA  1125

Query 1174  GACAAGACTCCAGAATTTTTACATGTAAAGTACATCACCAACCTTCTGAGGGAGAAAGAATATAAAAAAGATTT  1247
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1126  GACAAGACTCCAGAATTTTTACATGTAAAGTACATCACCAACCTTCTGAGGGAGAAAGAATATAAAAAAGATTT  1199

Query 1248  GGAAAATGAGATAAAAGGGAAAGGAATGGAACTTAATTCAGAAGTTCTTGATATCCAAAGAGCAAAGCGAGCCT  1321
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1200  GGAAAATGAGATAAAAGGGAAAGGAATGGAACTTAATTCAGAAGTTCTTGATATCCAAAGAGCAAAGCGAGCCT  1273

Query 1322  CTGAAATGGCAAGTGAGAAAGAATACAAGAAAGACCTGGAGTCAATAATTAAAGGGAAAGGAATGCAAGCTGGC  1395
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1274  CTGAAATGGCAAGTGAGAAAGAATACAAGAAAGACCTGGAGTCAATAATTAAAGGGAAAGGAATGCAAGCTGGC  1347

Query 1396  ACTGACACCCTTGAAATGCAGCATGCCAAGAAGGCTGCAGAGATAGCGAGTGAGAAAGACTATAAAAGAGATCT  1469
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1348  ACTGACACCCTTGAAATGCAGCATGCCAAGAAGGCTGCAGAGATAGCGAGTGAGAAAGACTATAAAAGAGATCT  1421

Query 1470  GGAGACTGAAATTAAAGGGAAAGGGATGCAGGTGAGCACAGACACTCTTGATGTCCAGAGAGCTAAGAAAGCAT  1543
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1422  GGAGACTGAAATTAAAGGGAAAGGGATGCAGGTGAGCACAGACACTCTTGATGTCCAGAGAGCTAAGAAAGCAT  1495

Query 1544  CCGAGATGGCCAGCCAGAAACAATACAAGAAGGACTTAGAAAATGAAATTAAAGGGAAAGGAATGCAAGTGAGC  1617
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1496  CCGAGATGGCCAGCCAGAAACAATACAAGAAGGACTTAGAAAATGAAATTAAAGGGAAAGGAATGCAAGTGAGC  1569

Query 1618  ATGGATATCCCAGATATCCTTCGAGCCAAGAGGACATCTGAAATCTATAGCCAGAGAAAGTATAAAGATGAAGC  1691
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1570  ATGGATATCCCAGATATCCTTCGAGCCAAGAGGACATCTGAAATCTATAGCCAGAGAAAGTATAAAGATGAAGC  1643

Query 1692  AGAGAAGATGCTTTCTAACTATTCTACCATAGCAGATACTCCTGAAATTCAGAGAATTAAGACAACTCAACAAA  1765
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1644  AGAGAAGATGCTTTCTAACTATTCTACCATAGCAGATACTCCTGAAATTCAGAGAATTAAGACAACTCAACAAA  1717

Query 1766  ACATTAGTGCGGTATTTTATAAGAAAGAAGTGGGAGCTGGCACTGCAGTGAAAGATAGCCCAGAGATCGAACGA  1839
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1718  ACATTAGTGCGGTATTTTATAAGAAAGAAGTGGGAGCTGGCACTGCAGTGAAAGATAGCCCAGAGATCGAACGA  1791

Query 1840  GTGAAGAAAAATCAGCAGAATATTAGTTCAGTGAAATACAAAGAAGAGATTAAACATGCAACAGCCATTTCTGA  1913
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1792  GTGAAGAAAAATCAGCAGAATATTAGTTCAGTGAAATACAAAGAAGAGATTAAACATGCAACAGCCATTTCTGA  1865

Query 1914  TCCTCCAGAACTAAAGAGAGTTAAAGAAAACCAGAAGAACATCAGCAATCTCCAGTATAAAGAGCAAAACTACA  1987
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1866  TCCTCCAGAACTAAAGAGAGTTAAAGAAAACCAGAAGAACATCAGCAATCTCCAGTATAAAGAGCAAAACTACA  1939

Query 1988  AGGCCACTCCGGTAAGCATGACCCCGGAGATAGAGAGAGTGAGGCGAAACCAGGAGCAGCTGAGTGCGGTAAAA  2061
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1940  AGGCCACTCCGGTAAGCATGACCCCGGAGATAGAGAGAGTGAGGCGAAACCAGGAGCAGCTGAGTGCGGTAAAA  2013

Query 2062  TATAAGGGAGAACTTCAACGGGGAACTGCAATTTCTGATCCACCAGAGCTGAAGAGGGCAAAAGAAAACCAGAA  2135
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2014  TATAAGGGAGAACTTCAACGGGGAACTGCAATTTCTGATCCACCAGAGCTGAAGAGGGCAAAAGAAAACCAGAA  2087

Query 2136  AAACATCAGCAATGTTTATTACAGAGGTCAGCTGGGAAGAGCTACCACTTTAAGTGTAACTCCTGAAATGGAAA  2209
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2088  AAACATCAGCAATGTTTATTACAGAGGTCAGCTGGGAAGAGCTACCACTTTAAGTGTAACTCCTGAAATGGAAA  2161

Query 2210  GAGTGAAGAAGAATCAAGAAAATATTAGCTCGGTAAAATATACCCAGGACCATAAACAGATGAAAGGTAGACCA  2283
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2162  GAGTGAAGAAGAATCAAGAAAATATTAGCTCGGTAAAATATACCCAGGACCATAAACAGATGAAAGGTAGACCA  2235

Query 2284  AGTCTGATTTTAGATACACCTGCTATGAGACATGTTAAAGAAGCACAAAATCATATTTCAATGGTAAAATACCA  2357
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2236  AGTCTGATTTTAGATACACCTGCTATGAGACATGTTAAAGAAGCACAAAATCATATTTCAATGGTAAAATACCA  2309

Query 2358  TGAAGATTTTGAAAAAACAAAGGGGAGAGGCTTTACTCCCGTCGTGGACGATCCTGTGACAGAGAGAGTGAGGA  2431
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2310  TGAAGATTTTGAAAAAACAAAGGGGAGAGGCTTTACTCCCGTCGTGGACGATCCTGTGACAGAGAGAGTGAGGA  2383

Query 2432  AGAACACCCAGGTGGTCAGCGATGCTGCCTATAAAGGGGTCCACCCTCACATCGTGGAGATGGACAGGAGACCT  2505
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2384  AGAACACCCAGGTGGTCAGCGATGCTGCCTATAAAGGGGTCCACCCTCACATCGTGGAGATGGACAGGAGACCT  2457

Query 2506  GGAATCATTGTTGACCTCAAAGTTTGGCGCACAGATCCTGGCTCCATCTTCGACCTTGATCCCCTGGAAGACAA  2579
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2458  GGAATCATTGTTGACCTCAAAGTTTGGCGCACAGATCCTGGCTCCATCTTCGACCTTGATCCCCTGGAAGACAA  2531

Query 2580  TATTCAGTCTAGAAGTCTCCATATGCTCTCTGAAAAGGCGAGTCACTATAGGCGACACTGGTCTCGATCCCATT  2653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2532  TATTCAGTCTAGAAGTCTCCATATGCTCTCTGAAAAGGCGAGTCACTATAGGCGACACTGGTCTCGATCCCATT  2605

Query 2654  CCAGCAGTACTTTCGGTACAGGTCTCGGAGACGACAGGTCAGAAATCTCCGAGATTTACCCTAGCTTTTCATGC  2727
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2606  CCAGCAGTACTTTCGGTACAGGTCTCGGAGACGACAGGTCAGAAATCTCCGAGATTTACCCTAGCTTTTCATGC  2679

Query 2728  TGCAGTGAGGTAACAAGACCGTCTGATGAAGGAGCACCTGTTCTTCCCGGAGCCTATCAGCAAAGCCATTCCCA  2801
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2680  TGCAGTGAGGTAACAAGACCGTCTGATGAAGGAGCACCTGTTCTTCCCGGAGCCTATCAGCAAAGCCATTCCCA  2753

Query 2802  AGGCTATGGCTACATGCACCAGACCAGTGTGTCATCCATGAGATCAATGCAGCATTCACCAAATCTAAGGACCT  2875
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2754  AGGCTATGGCTACATGCACCAGACCAGTGTGTCATCCATGAGATCAATGCAGCATTCACCAAATCTAAGGACCT  2827

Query 2876  ACCGAGCCATGTACGATTACAGTGCCCAGGATGAAGACGAGGTCTCCTTTAGAGACGGCGACTACATCGTCAAC  2949
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2828  ACCGAGCCATGTACGATTACAGTGCCCAGGATGAAGACGAGGTCTCCTTTAGAGACGGCGACTACATCGTCAAC  2901

Query 2950  GTGCAGCCTATTGACGATGGCTGGATGTACGGCACAGTGCAGAGAACGGGGAGAACAGGAATGCTCCCAGCGAA  3023
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2902  GTGCAGCCTATTGACGATGGCTGGATGTACGGCACAGTGCAGAGAACAGGGAGAACAGGAATGCTCCCAGCGAA  2975

Query 3024  TTACATTGAGTTTGTTAAT  3042
            |||||||||||||||||||
Sbjct 2976  TTACATTGAGTTTGTTAAT  2994