Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07641
• Subject: NM_001166284.1
• Aligned Length: 1629
• Identities: 1366
• Gaps: 261

Alignment

Query    1  ATGATGCCCACACCAGTTATCCTATTGAAAGAGGGGACTGATAGCTCCCAAGGCATCCCCCAGCTTGTGAGTAA  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  CATCAGTGCCTGCCAGGTGATTGCTGAGGCTGTAAGAACTACCCTGGGTCCCCGTGGCATGGACAAGCTTATTG  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TAGATGGCAGAGGCAAAGCAACAATTTCTAATGATGGGGCCACAATTCTGAAACTTCTTGATGTTGTCCATCCT  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GCAGCAAAGACTTTGGTAGACATTGCCAAATCCCAAGATGCTGAGGTGGGTGATGGCACCACCTCAGTGACCTT  296
                                                 |||.|  ||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------ATGAT--GGTGGGTGATGGCACCACCTCAGTGACCTT  35

Query  297  GCTGGCTGCAGAGTTTCTGAAGCAGGTGAAACCCTATGTGGAGGAAGGTTTACACCCCCAGATCATCATTCGAG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   36  GCTGGCTGCAGAGTTTCTGAAGCAGGTGAAACCCTATGTGGAGGAAGGTTTACACCCCCAGATCATCATTCGAG  109

Query  371  CTTTCCGCACAGCCACCCAGCTGGCAGTTAACAAGATCAAAGAGATTGCTGTGACCGTGAAGAAGGCAGATAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  110  CTTTCCGCACAGCCACCCAGCTGGCAGTTAACAAGATCAAAGAGATTGCTGTGACCGTGAAGAAGGCAGATAAA  183

Query  445  GTGGAGCAGAGGAAGCTGCTGGAAAAGTGTGCCATGACCGCTCTGAGCTCCAAGCTGATCTCCCAGCAGAAAGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  184  GTGGAGCAGAGGAAGCTGCTGGAAAAGTGTGCCATGACCGCTCTGAGCTCCAAGCTGATCTCCCAGCAGAAAGC  257

Query  519  TTTCTTTGCTAAGATGGTGGTGGATGCAGTGATGATGCTCGATGATTTGCTGCAGCTTAAAATGATTGGAATCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  258  TTTCTTTGCTAAGATGGTGGTGGATGCAGTGATGATGCTCGATGATTTGCTGCAGCTTAAAATGATTGGAATCA  331

Query  593  AGAAGGTACAGGGTGGAGCCCTCGAGGATTCTCAGCTGGTAGCTGGTGTTGCATTCAAGAAGACTTTCTCTTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  332  AGAAGGTACAGGGTGGAGCCCTCGAGGATTCTCAGCTGGTAGCTGGTGTTGCATTCAAGAAGACTTTCTCTTAC  405

Query  667  GCTGGGTTTGAAATGCAACCCAAAAAGTACCACAATCCCAAGATTGCCCTTTTGAATGTCGAGCTCGAGTTGAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  406  GCTGGGTTTGAAATGCAACCCAAAAAGTACCACAATCCCAAGATTGCCCTTTTGAATGTCGAGCTCGAGTTGAA  479

Query  741  AGCTGAGAAAGACAATGCTGAGATAAGAGTCCACACAGTTGAGGATTATCAGGCAATTGTTGATGCTGAGTGGA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  480  AGCTGAGAAAGACAATGCTGAGATAAGAGTCCACACAGTTGAGGATTATCAGGCAATTGTTGATGCTGAGTGGA  553

Query  815  ACATTCTCTATGACAAGTTAGAGAAGATCCATCATTCTGGAGCCAAAGTTGTCTTGTCCAAACTCCCCATTGGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  554  ACATTCTCTATGACAAGTTAGAGAAGATCCATCATTCTGGAGCCAAAGTTGTCTTGTCCAAACTCCCCATTGGG  627

Query  889  GATGTGGCCACCCAGTACTTTGCTGACAGGGACATGTTCTGTGCTGGCCGAGTACCTGAGGAGGATCTGAAGAG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  628  GATGTGGCCACCCAGTACTTTGCTGACAGGGACATGTTCTGTGCTGGCCGAGTACCTGAGGAGGATCTGAAGAG  701

Query  963  GACAATGATGGCCTGTGGAGGCTCAATCCAGACCAGTGTGAATGCTCTGTCAGCAGATGTGCTGGGTCGATGCC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  702  GACAATGATGGCCTGTGGAGGCTCAATCCAGACCAGTGTGAATGCTCTGTCAGCAGATGTGCTGGGTCGATGCC  775

Query 1037  AGGTGTTTGAAGAGACCCAGATTGGAGGCGAGAGGTACAATTTTTTTACTGGCTGCCCCAAGGCCAAGACATGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  776  AGGTGTTTGAAGAGACCCAGATTGGAGGCGAGAGGTACAATTTTTTTACTGGCTGCCCCAAGGCCAAGACATGC  849

Query 1111  ACCTTCATTCTCCGTGGCGGCGCCGAGCAGTTTATGGAGGAGACAGAGCGGTCCCTGCATGATGCCATCATGAT  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  850  ACCTTCATTCTCCGTGGCGGCGCCGAGCAGTTTATGGAGGAGACAGAGCGGTCCCTGCATGATGCCATCATGAT  923

Query 1185  CGTCAGGAGGGCCATCAAGAATGATTCAGTGGTGGCTGGTGGCGGGGCCATTGAGATGGAACTCTCCAAGTACC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  924  CGTCAGGAGGGCCATCAAGAATGATTCAGTGGTGGCTGGTGGCGGGGCCATTGAGATGGAACTCTCCAAGTACC  997

Query 1259  TGCGGGATTACTCAAGGACTATTCCAGGAAAACAGCAGCTGTTGATTGGGGCTTATGCCAAGGCCTTGGAGATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  998  TGCGGGATTACTCAAGGACTATTCCAGGAAAACAGCAGCTGTTGATTGGGGCATATGCCAAGGCCTTGGAGATT  1071

Query 1333  ATCCCACGCCAGCTGTGTGACAATGCTGGCTTTGATGCCACAAACATTCTCAACAAGCTGCGGGCTCGGCATGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1072  ATCCCACGCCAGCTGTGTGACAATGCTGGCTTTGATGCCACAAACATTCTCAACAAGCTGCGGGCTCGGCATGC  1145

Query 1407  CCAGGGGGGTACATGGTATGGAGTAGACATCAACAACGAGGACATTGCTGACAACTTTGAAGCTTTCGTGTGGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1146  CCAGGGGGGTACATGGTATGGAGTAGACATCAACAACGAGGACATTGCTGACAACTTTGAAGCTTTCGTGTGGG  1219

Query 1481  AGCCAGCTATGGTGCGGATCAATGCGCTGACAGCAGCCTCTGAGGCTGCGTGCCTGATCGTGTCTGTAGATGAA  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1220  AGCCAGCTATGGTGCGGATCAATGCGCTGACAGCAGCCTCTGAGGCTGCGTGCCTGATCGTGTCTGTAGATGAA  1293

Query 1555  ACCATCAAGAACCCCCGCTCGACTGTGGATGCTCCCACAGCAGCAGGCCGGGGCCGTGGTCGTGGCCGCCCCCA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1294  ACCATCAAGAACCCCCGCTCGACTGTGGATGCTCCCACAGCAGCAGGCCGGGGCCGTGGTCGTGGCCGCCCCCA  1367

Query 1629  C  1629
            |
Sbjct 1368  C  1368