Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07642
- Subject:
- NM_007636.2
- Aligned Length:
- 1605
- Identities:
- 1429
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGGCGTCCCTTTCCCTTGCACCTGTTAACATCTTTAAGGCAGGAGCTGATGAAGAGAGAGCAGAGACAGCTCG 74
|||||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGGCTTCCCTTTCCCTCGCACCTGTTAATATCTTCAAGGCTGGAGCTGATGAAGAGAGGGCCGAGACAGCTCG 74
Query 75 TCTGACTTCTTTTATTGGTGCCATCGCCATTGGAGACTTGGTAAAGAGCACCTTGGGACCCAAAGGCATGGACA 148
.|||.|.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||
Sbjct 75 CCTGTCGTCGTTTATCGGTGCCATCGCCATTGGAGACTTGGTGAAGAGCACTTTGGGACCGAAGGGCATGGACA 148
Query 149 AAATTCTTCTAAGCAGTGGACGAGATGCCTCTCTTATGGTAACCAATGATGGTGCCACTATTCTAAAAAACATT 222
|||||||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||.||.||||||
Sbjct 149 AAATTCTCCTAAGCAGTGGACGAGACGCCGCTCTGATGGTGACCAACGACGGTGCTACCATTCTCAAGAACATT 222
Query 223 GGTGTTGACAATCCAGCAGCTAAAGTTTTAGTTGATATGTCAAGGGTTCAAGATGATGAAGTTGGTGATGGCAC 296
|||||.|||||.||.|||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GGTGTGGACAACCCCGCAGCAAAGGTTCTAGTTGATATGTCAAGGGTTCAAGATGATGAAGTTGGTGATGGCAC 296
Query 297 TACCTCTGTTACCGTTTTAGCAGCAGAATTATTAAGGGAAGCAGAATCTTTAATTGCAAAAAAGATTCATCCAC 370
||||||||||||.||.|||||.|||||..|..|..|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 297 TACCTCTGTTACTGTCTTAGCCGCAGAGCTGCTCCGGGAAGCAGAATCTTTAATTGCAAAAAAGATACATCCAC 370
Query 371 AGACCATCATAGCGGGTTGGAGAGAAGCCACGAAGGCTGCAAGAGAGGCGCTGTTGAGTTCTGCAGTTGATCAT 444
||||||||||..|.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||.||||.||.||.||.||||||
Sbjct 371 AGACCATCATCTCAGGTTGGAGAGAAGCCACAAAGGCAGCAAGAGAGGCCCTGCTGAGCTCCGCTGTGGATCAT 444
Query 445 GGTTCCGATGAAGTTAAATTCCGTCAAGATTTAATGAATATTGCGGGCACAACATTATCCTCAAAACTTCTTAC 518
|||||.|||||||..|.||||.|.||.||.||||||||.|||||.||.||.|||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 445 GGTTCTGATGAAGCCAGATTCTGGCAGGACTTAATGAACATTGCAGGAACGACATTGTCCTCAAAGCTCCTTAC 518
Query 519 TCATCACAAAGACCACTTTACAAAGTTAGCTGTAGAAGCAGTTCTCAGACTGAAAGGCTCTGGCAACCTGGAGG 592
|||.|||||.|||||||||||.||..|.||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCACCACAAGGACCACTTTACTAAACTGGCCGTGGAAGCGGTTCTCAGACTGAAAGGCTCTGGCAACCTGGAGG 592
Query 593 CAATTCATATTATCAAGAAGCTAGGAGGAAGTTTGGCAGATTCCTATTTAGATGAAGGCTTCCTGTTGGATAAA 666
|.||||||.|.||||||||.|||||.||.|||.|||||||.||||||.||||||||||.||.||.|||||||||
Sbjct 593 CGATTCATGTCATCAAGAAACTAGGTGGGAGTCTGGCAGACTCCTATCTAGATGAAGGTTTTCTTTTGGATAAA 666
Query 667 AAAATTGGAGTAAATCAACCAAAACGAATTGAAAATGCTAAAATTCTTATTGCAAATACTGGTATGGATACAGA 740
|||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 AAAATTGGAGTAAATCAACCAAAGAGAATTGAAAATGCTAAAATTCTTATTGCAAATACTGGGATGGATACAGA 740
Query 741 CAAAATAAAGATATTTGGTTCCCGGGTAAGAGTTGACTCTACAGCAAAGGTTGCAGAAATAGAACATGCGGAAA 814
||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 741 CAAAATAAAGATATTTGGCTCTCGGGTAAGAGTTGATTCCACAGCAAAGGTTGCAGAGATAGAACATGCAGAAA 814
Query 815 AGGAAAAAATGAAGGAGAAAGTTGAACGTATTCTTAAGCATGGAATAAATTGCTTTATTAACAGGCAATTAATT 888
||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||
Sbjct 815 AGGAGAAGATGAAGGAGAAAGTTGAACGTATTCTTAAGCATGGAATAAATTGCTTTATTAACAGACAGTTAATT 888
Query 889 TATAATTATCCTGAACAGCTCTTTGGTGCTGCTGGTGTCATGGCTATTGAGCATGCAGATTTTGCAGGTGTGGA 962
||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 889 TATAATTACCCTGAACAACTCTTCGGCGCTGCTGGCGTCATGGCTATTGAGCATGCGGATTTCGCAGGTGTGGA 962
Query 963 ACGCCTAGCTCTTGTCACAGGTGGTGAAATTGCCTCTACCTTTGATCACCCAGAACTGGTGAAGCTTGGAAGTT 1036
.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 963 GCGCCTCGCTCTTGTCACAGGTGGTGAGATTGCCTCTACCTTTGATCACCCAGAACTTGTGAAGCTTGGAAGTT 1036
Query 1037 GCAAACTTATCGAGGAAGTCATGATTGGAGAAGACAAACTCATTCACTTTTCTGGGGTTGCCCTTGGTGAGGCT 1110
||||||||||.||.|||||.|||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 1037 GCAAACTTATTGAAGAAGTTATGATCGGGGAAGATAAACTCATTCACTTTTCTGGGGTTGCCCTTGGTGAGGCA 1110
Query 1111 TGTACCATTGTTTTGCGTGGTGCCACTCAACAAATTTTAGATGAAGCAGAAAGATCATTGCATGATGCTCTTTG 1184
||.||||||||..|.||||||||||||||.||||||.|.||||||||.|||.||||..||||||||||||||||
Sbjct 1111 TGCACCATTGTGCTTCGTGGTGCCACTCAGCAAATTCTGGATGAAGCTGAACGATCTCTGCATGATGCTCTTTG 1184
Query 1185 TGTTCTTGCGCAAACTGTAAAGGACTCTAGAACAGTTTATGGAGGAGGCTGTTCTGAGATGTTGATGGCTCATG 1258
|||||||||.||.||||||||.||..|||||||||||||.||.||||||||.|||||||||.|||||||.||||
Sbjct 1185 TGTTCTTGCTCAGACTGTAAAAGATCCTAGAACAGTTTACGGGGGAGGCTGCTCTGAGATGCTGATGGCCCATG 1258
Query 1259 CTGTGACACAGCTTGCCAATAGAACACCAGGCAAAGAAGCTGTTGCAATGGAGTCTTATGCTAAAGCACTGAGA 1332
|||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||.|.|||.|||||.||||||
Sbjct 1259 CTGTGACACAGCTTGCCAACAGAACCCCAGGAAAAGAAGCTGTAGCAATGGAGTCGTTTGCAAAAGCCCTGAGA 1332
Query 1333 ATGTTGCCAACCATCATAGCTGACAATGCAGGCTATGACAGTGCAGACCTGGTGGCACAGCTCAGGGCTGCTCA 1406
||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||
Sbjct 1333 ATGTTGCCGACCATCATAGCCGACAATGCGGGCTATGACAGTGCAGATCTGGTGGCACAGCTCCGAGCTGCTCA 1406
Query 1407 CAGTGAAGGCAATACCACTGCTGGATTGGATATGAGGGAAGGCACCATTGGAGATATGGCTATCCTGGGTATAA 1480
||||||||||.|||..|||||||||.|||||||||.||||||.|||||.||.||||||||..|.||||||||||
Sbjct 1407 CAGTGAAGGCCATATAACTGCTGGACTGGATATGAAGGAAGGTACCATCGGCGATATGGCAGTACTGGGTATAA 1480
Query 1481 CAGAAAGTTTTCAAGTGAAGCGACAGGTTCTTCTGAGTGCAGCTGAAGCAGCGGAGGTGATTCTGCGTGTGGAC 1554
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1481 CAGAGAGTTTTCAAGTGAAGCGACAGGTTCTTCTGAGTGCGGCTGAAGCAGCAGAGGTGATCCTGCGAGTGGAC 1554
Query 1555 AACATCATCAAAGCGGCACCCAGGAAACGTGTCCCTGATCACCACCCCTGT 1605
|||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1555 AACATTATCAAAGCAGCACCAAGGAAACGTGTCCCCGATCACCACCCCTGT 1605