Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07652
- Subject:
- NM_001353970.1
- Aligned Length:
- 1277
- Identities:
- 1222
- Gaps:
- 52
Alignment
Query 1 ATGTCTGACCACGGAGATGTGAGCCTCCCGCCCGAAGACCGGGTGAGGGCTCTCTCCCAGCTGGGTAGTGCGGT 74
|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCTGACCATGGAGATGTGAGCCTCCCGCCCGAAGACCGGGTGAGGGCTCTCTCCCAGCTGGGTAGTGCGGT 74
Query 75 AGAGGTGAATGAAGACATTCCACCCCGTCGGTACTTCCGCTCTGGAGTTGAGATTATCCGAATGGCATCCATTT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGAGGTGAATGAAGACATTCCACCCCGTCGGTACTTCCGCTCTGGAGTTGAGATTATCCGAATGGCATCCATTT 148
Query 149 ACTCTGAGGAAGGCAACATTGAACATGCCTTCATCCTCTATAACAAGTATATCACGCTCTTTATTGAGAAACTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACTCTGAGGAAGGCAACATTGAACATGCCTTCATCCTCTATAACAAGTATATCACGCTCTTTATTGAGAAACTA 222
Query 223 CCAAAACATCGAGATTACAAATCTGCTGTCATTCCTGAAAAGAAAGACACAGTAAAGAAATTAAAGGAGATTGC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 CCAAAACATCGAGATTACAAATCTGCTGTCATTCCTGAAAAGAAAGACACAGTAAAGAAATTAAAGGAGATTGC 296
Query 297 ATTTCCCAAAGCAGAAGAGCTGAAGGCAGAGCTGTTAAAACGATATACCAAAGAATATACAGAATATAATGAAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATTTCCCAAAGCAGAAGAGCTGAAGGCAGAGCTGTTAAAACGATATACCAAAGAATATACAGAATATAATGAAG 370
Query 371 AAAAGAAGAAGGAAGCAGAGGAATTGGCCCGGAACATGGCCATCCAGCAAGAGCTGGAAAAGGAAAAACAGAGG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AAAAGAAGAAGGAAGCAGAGGAATTGGCCCGGAACATGGCCATCCAGCAAGAGCTGGAAAAGGAAAAACAGAGG 444
Query 445 GTAGCACAACAGAAGCAGCAGCAATTGGAACAGGAACAGTTCCATGCCTTCGAGGAGATGATCCGGAACCAGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTAGCACAACAGAAGCAGCAGCAATTGGAACAGGAACAGTTCCATGCCTTCGAGGAGATGATCCGGAACCAGGA 518
Query 519 GCTAGAAAAAGAGCGACTGAAAATTGTACAGGAGTTTGGGAAGGTAGACCCTGGCCTAGGTGGCCCGCTAGTGC 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GCTAGAAAAAGAGCGACTGAAAATTGTACAGGAGTTTGGGAAGGTAGACCCTGGCCTAGGTGGCCCGCTAGTGC 592
Query 593 CTGACTTGGAGAAGCCCTCCTTAGATGTGTTCCCCACCTTAACAGTCTCATCCATACAGCCTTCAGACTGTCAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 CTGACTTGGAGAAGCCCTCCTTAGATGTGTTCCCCACCTTAACAGTCTCATCCATACAGCCTTCAGACTGTCAC 666
Query 667 ACAACTGTAAGGCCAGCTAAGCCACCTGTGGTGGACAGGTCCTTGAAACCTGGAGCACTGAGCAACTCAGAAAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 ACAACTGTAAGGCCAGCTAAGCCACCTGTGGTGGACAGGTCCTTGAAACCTGGAGCACTGAGCAACTCAGAAAG 740
Query 741 TATTCCCACAATCGATGGATTGCGCCATGTGGTGGTGCCTGGGCGGCTGTGCCCACAGTTTCTCCAGTTAGCCA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TATTCCCACAATCGATGGATTGCGCCATGTGGTGGTGCCTGGGCGGCTGTGCCCACAGTTTCTCCAGTTAGCCA 814
Query 815 GTGCCAACACTGCCCGGGGAGTGGAGACATGTGGAATTCTCTGTGGAAAACTGATGAGGAATGAATTTACCATT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GTGCCAACACTGCCCGGGGAGTGGAGACATGTGGAATTCTCTGTGGAAAACTGATGAGGAATGAATTTACCATT 888
Query 889 ACCCATGTTCTCATCCCCAAGCAAAGTGCTGGGTCTGATTACTGCAACACAGAGAACGAAGAAGAACTTTTCCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ACCCATGTTCTCATCCCCAAGCAAAGTGCTGGGTCTGATTACTGCAACACAGAGAACGAAGAAGAACTTTTCCT 962
Query 963 CATACAGGATCAGCAGGGCCTCATCACACTGGGCTGGATTCATACTCACCCCACACAGACCGCGTTTCTCTCCA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CATACAGGATCAGCAGGGCCTCATCACACTGGGCTGGATTCATACTCACCCCACACAGACCGCGTTTCTCTCCA 1036
Query 1037 GTGTCGACCTACACACTCACTGCTCTTACCAGATGATGTTGCCAGAGTCAGTAGCCATTGTTTGCTCCCCCAAG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTGTCGACCTACACACTCACTGCTCTTACCAGATGATGTTGCCAGAGTCAGTAGCCATTGTTTGCTCCCCCAAG 1110
Query 1111 TTCCAGGAAACTGGATTCTTTAAACTAACTGACCATGGACTAGAGGAGATTTCTTCCTGTCGCCAGAAAGGATT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TTCCAGGAAACTGGATTCTTTAAACTAACTGACCATGGACTAGAGGAGATTTCTTCCTGTCGCCAGAAAGGATT 1184
Query 1185 TCATCCACACAGCAAGGATCCACCTCTGTT-----CTGTAGCTGCAGCCACGTGACTGTTGTGGACAGAGCAGT 1253
|||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||.||.
Sbjct 1185 TCATCCACACAGCAAGGATCCACCTCTGTTCTGTCCTGTA-CTTCAA--------------------------- 1230
Query 1254 GACCATCACAGACCTTCGA 1272
Sbjct 1231 ------------------- 1230