Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07654
• Subject: NM_001282526.2
• Aligned Length: 948
• Identities: 823
• Gaps: 123

Alignment

Query   1  ATGGCGGAGGTGAAGGTGAAGGTGCAGCCGCCTGACGCGGATCCGGTCGAAATAGAAAACAGGATTATAGAATT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  ATGTCACCAGTTCCCTCATGGAATCACAGACCAAGTAATTCAGAATGAAATGCCTCATATAGAAGCCCAGCAGC  148
                                                            |||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  -------------------------------------------------ATGCCTCATATAGAAGCCCAGCAGC  25

Query 149  GGGCAGTAGCCATCAATAGGTTGTTGTCTATGGGTCAGTTGGATCTCTTAAGGAGCAATACGGGCCTTTTATAT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  26  GGGCAGTAGCCATCAATAGGTTGTTGTCTATGGGTCAGTTGGATCTCTTAAGGAGCAATACGGGCCTTTTATAT  99

Query 223  AGAATAAAGGACTCTCAGAATGCTGGTAAAATGAAGGGATCCGATAACCAAGAAAAACTAGTATATCAAATCAT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 100  AGAATAAAGGACTCTCAGAATGCTGGTAAAATGAAGGGATCCGATAACCAAGAAAAACTAGTATATCAAATCAT  173

Query 297  AGAGGATGCAGGAAATAAAGGAATATGGAGCAGAGATATCCGCTATAAAAGTAATTTGCCATTAACAGAAATCA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 174  AGAGGATGCAGGAAATAAAGGAATATGGAGCAGAGATATCCGCTATAAAAGTAATTTGCCATTAACAGAAATCA  247

Query 371  ACAAAATTCTGAAGAATCTGGAAAGTAAAAAGCTTATCAAAGCTGTTAAGTCTGTAGCAGCCTCAAAAAAGAAG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 248  ACAAAATTCTGAAGAATCTGGAAAGTAAAAAGCTTATCAAAGCTGTTAAGTCTGTAGCAGCCTCAAAAAAGAAG  321

Query 445  GTGTATATGCTCTATAACCTGCAGCCAGACCGGTCTGTGACTGGTGGAGCCTGGTACAGTGACCAGGATTTTGA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 322  GTGTATATGCTCTATAACCTGCAGCCAGACCGGTCTGTGACTGGTGGAGCCTGGTACAGTGACCAGGATTTTGA  395

Query 519  ATCTGAATTTGTAGAGGTGCTTAACCAACAGTGTTTTAAATTCCTACAGTCCAAGGCAGAAACAGCACGAGAAA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 396  ATCTGAATTTGTAGAGGTGCTTAACCAACAGTGTTTTAAATTCCTACAGTCCAAGGCAGAAACAGCACGAGAAA  469

Query 593  GCAAACAGAACCCAATGATACAAAGAAATAGTTCATTTGCCTCATCACATGAAGTGTGGAAATATATCTGCGAA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 470  GCAAACAGAACCCAATGATACAAAGAAATAGTTCATTTGCCTCATCACATGAAGTGTGGAAATATATCTGCGAA  543

Query 667  TTGGGAATCAGTAAGGTAGAGTTATCCATGGAAGACATTGAAACCATCCTGAATACACTCATTTATGATGGAAA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 544  TTGGGAATCAGTAAGGTAGAGTTATCCATGGAAGACATTGAAACCATCCTGAATACACTCATTTATGATGGAAA  617

Query 741  AGTGGAGATGACGATTATTGCTGCAAAAGAAGGCACAGTTGGCAGTGTAGATGGACACATGAAACTGTACAGGG  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 618  AGTGGAGATGACGATTATTGCTGCAAAAGAAGGCACAGTTGGCAGTGTAGATGGACACATGAAACTGTACAGGG  691

Query 815  CAGTCAATCCAATCATCCCTCCCACGGGTTTGGTCCGGGCACCCTGTGGACTCTGCCCGGTTTTTGATGACTGC  888
           |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 692  CAGTCAATCCAATCATCCCTCCCACAGGTTTGGTCCGGGCACCCTGTGGACTCTGCCCGGTTTTTGATGACTGC  765

Query 889  CACGAAGGTGGTGAGATTTCACCATCTAACTGTATTTACATGACAGAGTGGCACGAATTT  948
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 766  CACGAAGGTGGTGAGATTTCACCATCTAACTGTATTTACATGACAGAGTGGCTCGAATTT  825