Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07654
• Subject: XM_011529141.1
• Aligned Length: 948
• Identities: 694
• Gaps: 252

Alignment

Query   1  ATGGCGGAGGTGAAGGTGAAGGTGCAGCCGCCTGACGCGGATCCGGTCGAAATAGAAAACAGGATTATAGAATT  74
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  75  ATGTCACCAGTTCCCTCATGGAATCACAGACCAAGTAATTCAGAATGAAATGCCTCATATAGAAGCCCAGCAGC  148
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 149  GGGCAGTAGCCATCAATAGGTTGTTGTCTATGGGTCAGTTGGATCTCTTAAGGAGCAATACGGGCCTTTTATAT  222
                                                                                     
Sbjct   1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query 223  AGAATAAAGGACTCTCAGAATGCTGGTAAAATGAAGGGATCCGATAACCAAGAAAAACTAGTATATCAAATCAT  296
                                         ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ------------------------------ATGAAGGGATCCGATAACCAAGAAAAACTAGTATATCAAATCAT  44

Query 297  AGAGGATGCAGGAAATAAAGGAATATGGAGCAGAGATATCCGCTATAAAAGTAATTTGCCATTAACAGAAATCA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  45  AGAGGATGCAGGAAATAAAGGAATATGGAGCAGAGATATCCGCTATAAAAGTAATTTGCCATTAACAGAAATCA  118

Query 371  ACAAAATTCTGAAGAATCTGGAAAGTAAAAAGCTTATCAAAGCTGTTAAGTCTGTAGCAGCCTCAAAAAAGAAG  444
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 119  ACAAAATTCTGAAGAATCTGGAAAGTAAAAAGCTTATCAAAGCTGTTAAGTCTGTAGCAGCCTCAAAAAAGAAG  192

Query 445  GTGTATATGCTCTATAACCTGCAGCCAGACCGGTCTGTGACTGGTGGAGCCTGGTACAGTGACCAGGATTTTGA  518
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 193  GTGTATATGCTCTATAACCTGCAGCCAGACCGGTCTGTGACTGGTGGAGCCTGGTACAGTGACCAGGATTTTGA  266

Query 519  ATCTGAATTTGTAGAGGTGCTTAACCAACAGTGTTTTAAATTCCTACAGTCCAAGGCAGAAACAGCACGAGAAA  592
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 267  ATCTGAATTTGTAGAGGTGCTTAACCAACAGTGTTTTAAATTCCTACAGTCCAAGGCAGAAACAGCACGAGAAA  340

Query 593  GCAAACAGAACCCAATGATACAAAGAAATAGTTCATTTGCCTCATCACATGAAGTGTGGAAATATATCTGCGAA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 341  GCAAACAGAACCCAATGATACAAAGAAATAGTTCATTTGCCTCATCACATGAAGTGTGGAAATATATCTGCGAA  414

Query 667  TTGGGAATCAGTAAGGTAGAGTTATCCATGGAAGACATTGAAACCATCCTGAATACACTCATTTATGATGGAAA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 415  TTGGGAATCAGTAAGGTAGAGTTATCCATGGAAGACATTGAAACCATCCTGAATACACTCATTTATGATGGAAA  488

Query 741  AGTGGAGATGACGATTATTGCTGCAAAAGAAGGCACAGTTGGCAGTGTAGATGGACACATGAAACTGTACAGGG  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 489  AGTGGAGATGACGATTATTGCTGCAAAAGAAGGCACAGTTGGCAGTGTAGATGGACACATGAAACTGTACAGGG  562

Query 815  CAGTCAATCCAATCATCCCTCCCACGGGTTTGGTCCGGGCACCCTGTGGACTCTGCCCGGTTTTTGATGACTGC  888
           |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 563  CAGTCAATCCAATCATCCCTCCCACAGGTTTGGTCCGGGCACCCTGTGGACTCTGCCCGGTTTTTGATGACTGC  636

Query 889  CACGAAGGTGGTGAGATTTCACCATCTAACTGTATTTACATGACAGAGTGGCACGAATTT  948
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 637  CACGAAGGTGGTGAGATTTCACCATCTAACTGTATTTACATGACAGAGTGGCTCGAATTT  696