Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07654
Subject:
XM_017027596.1
Aligned Length:
948
Identities:
802
Gaps:
144

Alignment

Query   1  ATGGCGGAGGTGAAGGTGAAGGTGCAGCCGCCTGACGCGGATCCGGTCGAAATAGAAAACAGGATTATAGAATT  74
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   1  ATGGCGGAGGTGAAGGTGAAGGTGCAGCCGCCTGACGCGGATCCGGTCGAAATAGAAAACAGGATTATAGAATT  74

Query  75  ATGTCACCAGTTCCCTCATGGAATCACAGACCAAGTAATTCAGAATGAAATGCCTCATATAGAAGCCCAGCAGC  148
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  75  ATGTCACCAGTTCCCTCATGGAATCACAGACCAAGTAATTCAGAATGAAATGCCTCATATAGAAGCCCAGCAGC  148

Query 149  GGGCAGTAGCCATCAATAGGTTGTTGTCTATGGGTCAGTTGGATCTCTTAAGGAGCAATACGGGCCTTTTATAT  222
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149  GGGCAGTAGCCATCAATAGGTTGTTGTCTATGGGTCAGTTGGATCTCTTAAGGAGCAATACGGGCCTTTTATAT  222

Query 223  AGAATAAAGGACTCTCAGAATGCTGGTAAAATGAAGGGATCCGATAACCAAGAAAAACTAGTATATCAAATCAT  296
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223  AGAATAAAGGACTCTCAGAATGCTGGTAAAATGAAGGGATCCGATAACCAAGAAAAACTAGTATATCAAATCAT  296

Query 297  AGAGGATGCAGGAAATAAAGGAATATGGAGCAGAGATATCCGCTATAAAAGTAATTTGCCATTAACAGAAATCA  370
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297  AGAGGATGCAGGAAATAAAGGAATATGGAGCAGAGATATCCGCTATAAAAGTAATTTGCCATTAACAGAAATCA  370

Query 371  ACAAAATTCTGAAGAATCTGGAAAGTAAAAAGCTTATCAAAGCTGTTAAGTCTGTAGCAGCCTCAAAAAAGAAG  444
           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||               
Sbjct 371  ACAAAATTCTGAAGAATCTGGAAAGTAAAAAGCTTATCAAAGCTGTTAAGTCTGTAGCA---------------  429

Query 445  GTGTATATGCTCTATAACCTGCAGCCAGACCGGTCTGTGACTGGTGGAGCCTGGTACAGTGACCAGGATTTTGA  518
                                                                                     
Sbjct 430  --------------------------------------------------------------------------  429

Query 519  ATCTGAATTTGTAGAGGTGCTTAACCAACAGTGTTTTAAATTCCTACAGTCCAAGGCAGAAACAGCACGAGAAA  592
                                                                  |||||||||||||||||||
Sbjct 430  -------------------------------------------------------GCAGAAACAGCACGAGAAA  448

Query 593  GCAAACAGAACCCAATGATACAAAGAAATAGTTCATTTGCCTCATCACATGAAGTGTGGAAATATATCTGCGAA  666
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 449  GCAAACAGAACCCAATGATACAAAGAAATAGTTCATTTGCCTCATCACATGAAGTGTGGAAATATATCTGCGAA  522

Query 667  TTGGGAATCAGTAAGGTAGAGTTATCCATGGAAGACATTGAAACCATCCTGAATACACTCATTTATGATGGAAA  740
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 523  TTGGGAATCAGTAAGGTAGAGTTATCCATGGAAGACATTGAAACCATCCTGAATACACTCATTTATGATGGAAA  596

Query 741  AGTGGAGATGACGATTATTGCTGCAAAAGAAGGCACAGTTGGCAGTGTAGATGGACACATGAAACTGTACAGGG  814
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 597  AGTGGAGATGACGATTATTGCTGCAAAAGAAGGCACAGTTGGCAGTGTAGATGGACACATGAAACTGTACAGGG  670

Query 815  CAGTCAATCCAATCATCCCTCCCACGGGTTTGGTCCGGGCACCCTGTGGACTCTGCCCGGTTTTTGATGACTGC  888
           |||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 671  CAGTCAATCCAATCATCCCTCCCACAGGTTTGGTCCGGGCACCCTGTGGACTCTGCCCGGTTTTTGATGACTGC  744

Query 889  CACGAAGGTGGTGAGATTTCACCATCTAACTGTATTTACATGACAGAGTGGCACGAATTT  948
           ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 745  CACGAAGGTGGTGAGATTTCACCATCTAACTGTATTTACATGACAGAGTGGCTCGAATTT  804