Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07663
- Subject:
- NM_023670.3
- Aligned Length:
- 1737
- Identities:
- 1595
- Gaps:
- 0
Alignment
Query 1 ATGAACAAACTGTATATCGGAAACCTCAGCGAGAACGCCGCCCCCTCGGACCTAGAAAGTATCTTCAAGGACGC 74
|||||||||.||||.|||||.|||||||||||..||||||.||||.|||||||.||||||.|||||||||||||
Sbjct 1 ATGAACAAATTGTACATCGGGAACCTCAGCGACCACGCCGGCCCCGCGGACCTGGAAAGTGTCTTCAAGGACGC 74
Query 75 CAAGATCCCGGTGTCGGGACCCTTCCTGGTGAAGACTGGCTACGCGTTCGTGGACTGCCCGGACGAGAGCTGGG 148
.||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 75 TAAGATCCCGGTGGCGGGCCCCTTCCTGGTGAAGACGGGCTACGCGTTCGTGGACTGCCCGGACGAGGGCTGGG 148
Query 149 CCCTCAAGGCCATCGAGGCGCTTTCAGGTAAAATAGAACTGCACGGGAAACCCATAGAAGTTGAGCACTCGGTC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCCTCAAGGCCATCGAGGCGCTTTCAGGTAAAATGGAACTACATGGGAAACCGATGGAAGTTGAGCACTCGGTC 222
Query 223 CCAAAAAGGCAAAGGATTCGGAAACTTCAGATACGAAATATCCCGCCTCATTTACAGTGGGAGGTGCTGGATAG 296
||.|||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 223 CCTAAACGGCAGAGGATTCGTAAACTTCAGATACGAAATATCCCGCCCCACTTACAATGGGAGGTGCTGGATAG 296
Query 297 TTTACTAGTCCAGTATGGAGTGGTGGAGAGCTGTGAGCAAGTGAACACTGACTCGGAAACTGCAGTTGTAAATG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 297 TTTACTAGTCCAGTATGGAGTGGTGGAGAGCTGTGAGCAAGTGAACACGGATTCGGAAACGGCAGTTGTAAATG 370
Query 371 TAACCTATTCCAGTAAGGACCAAGCTAGACAAGCACTAGACAAACTGAATGGATTTCAGTTAGAGAATTTCACC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct 371 TAACCTATTCCAGTAAGGACCAAGCTAGACAAGCCTTAGACAAACTGAATGGATTCCAGTTAGAGAACTTCACC 444
Query 445 TTGAAAGTAGCCTATATCCCTGATGAAATGGCCGCCCAGCAAAACCCCTTGCAGCAGCCCCGAGGTCGCCGGGG 518
|||||.||.|||||.|||||.|||||||..||.|||||||||||.||||.||..||||.|||.||.||||||||
Sbjct 445 TTGAAGGTTGCCTACATCCCAGATGAAACTGCTGCCCAGCAAAATCCCTCGCCACAGCTCCGGGGGCGCCGGGG 518
Query 519 GCTTGGGCAGAGGGGCTCCTCAAGGCAGGGGTCTCCAGGATCCGTATCCAAGCAGAAACCATGTGATTTGCCTC 592
||..||||||.|||||||.||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||..||||.|
Sbjct 519 GCCAGGGCAGCGGGGCTCATCCAGGCAGGCGTCTCCAGGATCGGTGTCCAAGCAGAAACCCTGTGACCTGCCAC 592
Query 593 TGCGCCTGCTGGTTCCCACCCAATTTGTTGGAGCCATCATAGGAAAAGAAGGTGCCACCATTCGGAACATCACC 666
||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 593 TGCGCCTGCTGGTTCCCACCCAGTTTGTTGGAGCCATTATAGGAAAAGAAGGTGCTACCATTCGCAACATCACA 666
Query 667 AAACAGACCCAGTCTAAAATCGATGTCCACCGTAAAGAAAATGCGGGGGCTGCTGAGAAGTCGATTACTATCCT 740
||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.|.|||||.||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 667 AAGCAGACCCAGTCTAAAATCGATGTCCATCGTAAGGAGAATACAGGGGCCGCGGAGAAGTCCATTACTATCCT 740
Query 741 CTCTACTCCTGAAGGCACCTCTGCGGCTTGTAAGTCTATTCTGGAGATTATGCATAAGGAAGCTCAAGATATAA 814
||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTCTACCCCTGAAGGCACCTCTGCAGCTTGTAAGTCTATTCTGGAGATTATGCATAAGGAAGCTCAAGATATAA 814
Query 815 AATTCACAGAAGAGATCCCCTTGAAGATTTTAGCTCATAATAACTTTGTTGGACGTCTTATTGGTAAAGAAGGA 888
||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 815 AATTCACAGAGGAGATTCCCTTGAAGATCTTAGCTCACAATAACTTTGTAGGCCGTCTCATTGGTAAAGAAGGA 888
Query 889 AGAAATCTTAAAAAAATTGAGCAAGACACAGACACTAAAATCACGATATCTCCATTGCAGGAATTGACGCTGTA 962
|||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 889 AGAAACCTTAAAAAAATCGAGCAAGACACGGACACTAAAATCACAATATCTCCATTGCAGGAACTGACGCTGTA 962
Query 963 TAATCCAGAACGCACTATTACAGTTAAAGGCAATGTTGAGACATGTGCCAAAGCTGAGGAGGAGATCATGAAGA 1036
.|||||.||||||||.||||||||.|||||||.|||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||
Sbjct 963 CAATCCGGAACGCACCATTACAGTGAAAGGCAGTGTTGAGACGTGTGCCAAGGCGGAGGAGGAAATAATGAAGA 1036
Query 1037 AAATCAGGGAGTCTTATGAAAATGATATTGCTTCTATGAATCTTCAAGCACATTTAATTCCTGGATTAAATCTG 1110
|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 AGATCAGGGAGTCTTATGAAAATGATATTGCTTCCATGAATCTTCAAGCACATTTAATCCCTGGATTAAATCTG 1110
Query 1111 AACGCCTTGGGTCTGTTCCCACCCACTTCAGGGATGCCACCTCCCACCTCAGGGCCCCCTTCAGCCATGACTCC 1184
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 1111 AATGCCTTGGGTCTGTTCCCACCCACGTCAGGGATGCCACCTCCCACCTCAGGGCCCCCTTCAACCCTGACTCC 1184
Query 1185 TCCCTACCCGCAGTTTGAGCAATCAGAAACGGAGACTGTTCATCTGTTTATCCCAGCTCTATCAGTCGGTGCCA 1258
|||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||.||||
Sbjct 1185 TCCCTACCCACAATTTGAGCAATCAGAGACGGAGACTGTGCATCTGTTTATTCCCGCCCTGTCCGTTGGCGCCA 1258
Query 1259 TCATCGGCAAGCAGGGCCAGCACATCAAGCAGCTTTCTCGCTTTGCTGGAGCTTCAATTAAGATTGCTCCAGCA 1332
||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.
Sbjct 1259 TCATTGGCAAGCAGGGCCAACACATCAAACAGCTTTCTCGCTTTGCGGGAGCTTCGATTAAGATCGCTCCAGCC 1332
Query 1333 GAAGCACCAGATGCTAAAGTGAGGATGGTGATTATCACTGGACCACCAGAGGCTCAGTTCAAGGCTCAGGGAAG 1406
|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GAAGCACCAGATGCTAAAGTGCGGATGGTGATTATCACTGGACCACCAGAGGCTCAGTTCAAGGCTCAGGGAAG 1406
Query 1407 AATTTATGGAAAAATTAAAGAAGAAAACTTTGTTAGTCCTAAAGAAGAGGTGAAACTTGAAGCTCATATCAGAG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1407 AATTTATGGAAAAATTAAAGAAGAAAACTTTGTTAGTCCTAAAGAAGAGGTGAAACTTGAAGCTCACATCAGAG 1480
Query 1481 TGCCATCCTTTGCTGCTGGCAGAGTTATTGGAAAAGGAGGCAAAACGGTGAATGAACTTCAGAATTTGTCAAGT 1554
||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.||||||
Sbjct 1481 TGCCGTCCTTTGCTGCTGGCAGAGTTATTGGGAAAGGAGGCAAAACGGTGAATGAGCTCCAGAGTTTATCAAGT 1554
Query 1555 GCAGAAGTTGTTGTCCCTCGTGACCAGACACCTGATGAGAATGACCAAGTGGTTGTCAAAATAACTGGTCACTT 1628
||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1555 GCTGAAGTTGTCGTCCCCCGTGACCAGACACCTGATGAGAATGATCAAGTAGTTGTCAAAATAACTGGCCACTT 1628
Query 1629 CTATGCTTGCCAGGTTGCCCAGAGAAAAATTCAGGAAATTCTGACTCAGGTAAAGCAGCACCAACAACAGAAGG 1702
||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|
Sbjct 1629 CTATGCTTGCCAGGTTGCCCAGAGGAAAATTCAGGAAATTCTGACTCAGGTAAAGCAGCACCAGCAGCAGAAAG 1702
Query 1703 CTCTGCAAAGTGGACCACCTCAGTCAAGACGGAAG 1737
|||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1703 CTCTGCAGAGTGGACCACCTCAGTCAAGGCGGAAG 1737