Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07663
- Subject:
- XM_006505517.3
- Aligned Length:
- 1741
- Identities:
- 1476
- Gaps:
- 131
Alignment
Query 1 ATGAACAAACTGTATATCGGAAACCTCAGCGAGAACGCCGCCCCCTC----GGACCTAGAAAGTATCTTCAAGG 70
||||| |||||| ||||
Sbjct 1 -----------------------------------------------ATGTGGACC-AGAAAG-------AAGG 19
Query 71 ACGCCAAGATCCCGGTGTCGGGACCCTTCCTGGTGAAGACTGGCTACGCGTTCGTGGACTGCCCGGACGAGAGC 144
.|| ||.|.||| |.||| |.|||| |||.||
Sbjct 20 CCG---------------CGCGCCCC--CATGG------CAGGCT----GTTTGT------------------- 47
Query 145 TGGGCCCTCAAGGCCATCGAGGCGCTTTCAGGTAAAATAGAACTGCACGGGAAACCCATAGAAGTTGAGCACTC 218
|||| ||||||||.|||||.||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 48 TGGG--------------------------GGTAAAATGGAACTACATGGGAAACCGATGGAAGTTGAGCACTC 95
Query 219 GGTCCCAAAAAGGCAAAGGATTCGGAAACTTCAGATACGAAATATCCCGCCTCATTTACAGTGGGAGGTGCTGG 292
||||||.|||.||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||
Sbjct 96 GGTCCCTAAACGGCAGAGGATTCGTAAACTTCAGATACGAAATATCCCGCCCCACTTACAATGGGAGGTGCTGG 169
Query 293 ATAGTTTACTAGTCCAGTATGGAGTGGTGGAGAGCTGTGAGCAAGTGAACACTGACTCGGAAACTGCAGTTGTA 366
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 170 ATAGTTTACTAGTCCAGTATGGAGTGGTGGAGAGCTGTGAGCAAGTGAACACGGATTCGGAAACGGCAGTTGTA 243
Query 367 AATGTAACCTATTCCAGTAAGGACCAAGCTAGACAAGCACTAGACAAACTGAATGGATTTCAGTTAGAGAATTT 440
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 244 AATGTAACCTATTCCAGTAAGGACCAAGCTAGACAAGCCTTAGACAAACTGAATGGATTCCAGTTAGAGAACTT 317
Query 441 CACCTTGAAAGTAGCCTATATCCCTGATGAAATGGCCGCCCAGCAAAACCCCTTGCAGCAGCCCCGAGGTCGCC 514
|||||||||.||.|||||.|||||.|||||||..||.|||||||||||.||||.||..||||.|||.||.||||
Sbjct 318 CACCTTGAAGGTTGCCTACATCCCAGATGAAACTGCTGCCCAGCAAAATCCCTCGCCACAGCTCCGGGGGCGCC 391
Query 515 GGGGGCTTGGGCAGAGGGGCTCCTCAAGGCAGGGGTCTCCAGGATCCGTATCCAAGCAGAAACCATGTGATTTG 588
||||||..||||||.|||||||.||.|||||||.||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||..||
Sbjct 392 GGGGGCCAGGGCAGCGGGGCTCATCCAGGCAGGCGTCTCCAGGATCGGTGTCCAAGCAGAAACCCTGTGACCTG 465
Query 589 CCTCTGCGCCTGCTGGTTCCCACCCAATTTGTTGGAGCCATCATAGGAAAAGAAGGTGCCACCATTCGGAACAT 662
||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 466 CCACTGCGCCTGCTGGTTCCCACCCAGTTTGTTGGAGCCATTATAGGAAAAGAAGGTGCTACCATTCGCAACAT 539
Query 663 CACCAAACAGACCCAGTCTAAAATCGATGTCCACCGTAAAGAAAATGCGGGGGCTGCTGAGAAGTCGATTACTA 736
|||.||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||.|.|||||.||.||||||||.|||||||
Sbjct 540 CACAAAGCAGACCCAGTCTAAAATCGATGTCCATCGTAAGGAGAATACAGGGGCCGCGGAGAAGTCCATTACTA 613
Query 737 TCCTCTCTACTCCTGAAGGCACCTCTGCGGCTTGTAAGTCTATTCTGGAGATTATGCATAAGGAAGCTCAAGAT 810
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 614 TCCTCTCTACCCCTGAAGGCACCTCTGCAGCTTGTAAGTCTATTCTGGAGATTATGCATAAGGAAGCTCAAGAT 687
Query 811 ATAAAATTCACAGAAGAGATCCCCTTGAAGATTTTAGCTCATAATAACTTTGTTGGACGTCTTATTGGTAAAGA 884
||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||
Sbjct 688 ATAAAATTCACAGAGGAGATTCCCTTGAAGATCTTAGCTCACAATAACTTTGTAGGCCGTCTCATTGGTAAAGA 761
Query 885 AGGAAGAAATCTTAAAAAAATTGAGCAAGACACAGACACTAAAATCACGATATCTCCATTGCAGGAATTGACGC 958
|||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 762 AGGAAGAAACCTTAAAAAAATCGAGCAAGACACGGACACTAAAATCACAATATCTCCATTGCAGGAACTGACGC 835
Query 959 TGTATAATCCAGAACGCACTATTACAGTTAAAGGCAATGTTGAGACATGTGCCAAAGCTGAGGAGGAGATCATG 1032
||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||.|||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||
Sbjct 836 TGTACAATCCGGAACGCACCATTACAGTGAAAGGCAGTGTTGAGACGTGTGCCAAGGCGGAGGAGGAAATAATG 909
Query 1033 AAGAAAATCAGGGAGTCTTATGAAAATGATATTGCTTCTATGAATCTTCAAGCACATTTAATTCCTGGATTAAA 1106
|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 910 AAGAAGATCAGGGAGTCTTATGAAAATGATATTGCTTCCATGAATCTTCAAGCACATTTAATCCCTGGATTAAA 983
Query 1107 TCTGAACGCCTTGGGTCTGTTCCCACCCACTTCAGGGATGCCACCTCCCACCTCAGGGCCCCCTTCAGCCATGA 1180
||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 984 TCTGAATGCCTTGGGTCTGTTCCCACCCACGTCAGGGATGCCACCTCCCACCTCAGGGCCCCCTTCAACCCTGA 1057
Query 1181 CTCCTCCCTACCCGCAGTTTGAGCAATCAGAAACGGAGACTGTTCATCTGTTTATCCCAGCTCTATCAGTCGGT 1254
|||||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||.||.||.||.
Sbjct 1058 CTCCTCCCTACCCACAATTTGAGCAATCAGAGACGGAGACTGTGCATCTGTTTATTCCCGCCCTGTCCGTTGGC 1131
Query 1255 GCCATCATCGGCAAGCAGGGCCAGCACATCAAGCAGCTTTCTCGCTTTGCTGGAGCTTCAATTAAGATTGCTCC 1328
||||||||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||
Sbjct 1132 GCCATCATTGGCAAGCAGGGCCAACACATCAAACAGCTTTCTCGCTTTGCGGGAGCTTCGATTAAGATCGCTCC 1205
Query 1329 AGCAGAAGCACCAGATGCTAAAGTGAGGATGGTGATTATCACTGGACCACCAGAGGCTCAGTTCAAGGCTCAGG 1402
|||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1206 AGCCGAAGCACCAGATGCTAAAGTGCGGATGGTGATTATCACTGGACCACCAGAGGCTCAGTTCAAGGCTCAGG 1279
Query 1403 GAAGAATTTATGGAAAAATTAAAGAAGAAAACTTTGTTAGTCCTAAAGAAGAGGTGAAACTTGAAGCTCATATC 1476
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1280 GAAGAATTTATGGAAAAATTAAAGAAGAAAACTTTGTTAGTCCTAAAGAAGAGGTGAAACTTGAAGCTCACATC 1353
Query 1477 AGAGTGCCATCCTTTGCTGCTGGCAGAGTTATTGGAAAAGGAGGCAAAACGGTGAATGAACTTCAGAATTTGTC 1550
||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||.|||.||
Sbjct 1354 AGAGTGCCGTCCTTTGCTGCTGGCAGAGTTATTGGGAAAGGAGGCAAAACGGTGAATGAGCTCCAGAGTTTATC 1427
Query 1551 AAGTGCAGAAGTTGTTGTCCCTCGTGACCAGACACCTGATGAGAATGACCAAGTGGTTGTCAAAATAACTGGTC 1624
||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.|
Sbjct 1428 AAGTGCTGAAGTTGTCGTCCCCCGTGACCAGACACCTGATGAGAATGATCAAGTAGTTGTCAAAATAACTGGCC 1501
Query 1625 ACTTCTATGCTTGCCAGGTTGCCCAGAGAAAAATTCAGGAAATTCTGACTCAGGTAAAGCAGCACCAACAACAG 1698
||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||
Sbjct 1502 ACTTCTATGCTTGCCAGGTTGCCCAGAGGAAAATTCAGGAAATTCTGACTCAGGTAAAGCAGCACCAGCAGCAG 1575
Query 1699 AAGGCTCTGCAAAGTGGACCACCTCAGTCAAGACGGAAG 1737
||.||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1576 AAAGCTCTGCAGAGTGGACCACCTCAGTCAAGGCGGAAG 1614