Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07674
- Subject:
- NM_147200.3
- Aligned Length:
- 1722
- Identities:
- 1694
- Gaps:
- 27
Alignment
Query 1 ---------------------------ATGAACCGAAGCATTCCTGTGGAGGTTGATGAATCAGAACCATACCC 47
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCTCCTCAGCTTCAAGAAACTAGAATGAACCGAAGCATTCCTGTGGAGGTTGATGAATCAGAACCATACCC 74
Query 48 AAGTCAGTTGCTGAAACCAATCCCAGAATATTCCCCGGAAGAGGAATCAGAACCACCTGCTCCAAATATAAGGA 121
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AAGTCAGTTGCTGAAACCAATCCCAGAATATTCCCCGGAAGAGGAATCAGAACCACCTGCTCCAAATATAAGGA 148
Query 122 ACATGGCACCCAACAGCTTGTCTGCACCCACAATGCTTCACAATTCCTCCGGAGACTTTTCTCAAGCTCACTCA 195
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ACATGGCACCCAACAGCTTGTCTGCACCCACAATGCTTCACAATTCCTCCGGAGACTTTTCTCAAGCTCACTCA 222
Query 196 ACCCTGAAACTTGCAAATCACCAGCGGCCTGTATCCCGGCAGGTCACCTGCCTGCGCACTCAAGTTCTGGAGGA 269
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACCCTGAAACTTGCAAATCACCAGCGGCCTGTATCCCGGCAGGTCACCTGCCTGCGCACTCAAGTTCTGGAGGA 296
Query 270 CAGTGAAGACAGTTTCTGCAGGAGACACCCAGGCCTGGGCAAAGCTTTCCCTTCTGGGTGCTCTGCAGTCAGCG 343
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CAGTGAAGACAGTTTCTGCAGGAGACACCCAGGCCTGGGCAAAGCTTTCCCTTCTGGGTGCTCTGCAGTCAGCG 370
Query 344 AGCCTGCGTCTGAGTCTGTGGTTGGAGCCCTCCCTGCAGAGCATCAGTTTTCATTTATGGAAAAACGTAATCAA 417
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGCCTGCGTCTGAGTCTGTGGTTGGAGCCCTCCCTGCAGAGCATCAGTTTTCATTTATGGAAAAACGTAATCAA 444
Query 418 TGGCTGGTATCTCAGCTTTCAGCGGCTTCTCCTGACACTGGCCATGACTCAGACAAATCAGACCAAAGTTTACC 491
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TGGCTGGTATCTCAGCTTTCAGCGGCTTCTCCTGACACTGGCCATGACTCAGACAAATCAGACCAAAGTTTACC 518
Query 492 TAATGCCTCAGCAGACTCCTTGGGCGGTAGCCAGGAGATGGTGCAACGGCCCCAGCCTCACAGGAACCGAGCAG 565
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TAATGCCTCAGCAGACTCCTTGGGCGGTAGCCAGGAGATGGTGCAACGGCCCCAGCCTCACAGGAACCGAGCAG 592
Query 566 GCCTGGATCTGCCAACCATAGACACGGGATATGATTCCCAGCCCCAGGATGTCCTGGGCATCAGGCAGCTGGAA 639
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 GCCTGGATCTGCCAACCATAGACACGGGATATGATTCCCAGCCCCAGGATGTCCTGGGCATCAGGCAGCTGGAA 666
Query 640 AGGCCCCTGCCCCTCACCTCCGTGTGTTACCCCCAGGACCTCCCCAGACCTCTCAGGTCCAGGGAGTTCCCTCA 713
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 AGGCCCCTGCCCCTCACCTCCGTGTGTTACCCCCAGGACCTCCCCAGACCTCTCAGGTCCAGGGAGTTCCCTCA 740
Query 714 GTTTGAACCTCAGAGGTATCCAGCATGTGCACAGATGCTGCCTCCCAATCTTTCCCCACATGCTCCATGGAACT 787
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 GTTTGAACCTCAGAGGTATCCAGCATGTGCACAGATGCTGCCTCCCAATCTTTCCCCACATGCTCCATGGAACT 814
Query 788 ATCATTACCATTGTCCTGGAAGTCCCGATCACCAGGTGCCATATGGCCATGACTACCCTCGAGCAGCCTACCAG 861
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 ATCATTACCATTGTCCTGGAAGTCCCGATCACCAGGTGCCATATGGCCATGACTACCCTCGAGCAGCCTACCAG 888
Query 862 CAAGTGATCCAGCCGGCTCTGCCTGGGCAGCCCCTGCCTGGAGCCAGTGTGAGAGGCCTGCACCCTGTGCAGAA 935
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CAAGTGATCCAGCCGGCTCTGCCTGGGCAGCCCCTGCCTGGAGCCAGTGTGAGAGGCCTGCACCCTGTGCAGAA 962
Query 936 GGTTATCCTGAATTATCCCAGCCCCTGGGACCAAGAAGAGAGGCCCGCACAGAGAGACTGCTCCTTTCCGGGGC 1009
|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGTTATCCTGAATTATCCCAGCCCCTGGGACCACGAAGAGAGGCCCGCACAGAGAGACTGCTCCTTTCCGGGGC 1036
Query 1010 TTCCAAGGCACCAGGACCAGCCACATCACCAGCCACCTAATAGAGCTGGTGCTCCTGGGGAGTCCTTGGAGTGC 1083
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTCCAAGGCACCAGGACCAGCCACATCACCAGCCACCTAATAGAGCTGGTGCTCCTGGGGAGTCCTTGGAGTGC 1110
Query 1084 CCTGCAGAGCTGAGACCACAGGTTCCCCAGCCTCCGTCCCCAGCTGCTGTGCCTAGACCCCCTAGCAACCCTCC 1157
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CCTGCAGAGCTGAGACCACAGGTTCCCCAGCCTCCGTCCCCAGCTGCTGTGCCTAGACCCCCTAGCAACCCTCC 1184
Query 1158 AGCCAGAGGAACTCTAAAAACAAGCAATTTGCCAGAAGAATTGCGGAAAGTCTTTATCACTTATTCGATGGACA 1231
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 AGCCAGAGGAACTCTAAAAACAAGCAATTTGCCAGAAGAATTGCGGAAAGTCTTTATCACTTATTCGATGGACA 1258
Query 1232 CAGCTATGGAGGTGGTGAAATTCGTGAACTTTTTGTTGGTAAATGGCTTCCAAACTGCAATTGACATATTTGAG 1305
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGCTATGGAGGTGGTGAAATTCGTGAACTTTTTGTTGGTAAATGGCTTCCAAACTGCAATTGACATATTTGAG 1332
Query 1306 GATAGAATCCGAGGCATTGATATCATTAAATGGATGGAGCGCTACCTTAGGGATAAGACCGTGATGATAATCGT 1379
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 GATAGAATCCGAGGCATTGATATCATTAAATGGATGGAGCGCTACCTTAGGGATAAGACCGTGATGATAATCGT 1406
Query 1380 AGCAATCAGCCCCAAATACAAACAGGACGTGGAAGGCGCTGAGTCGCAGCTGGACGAGGATGAGCATGGCTTAC 1453
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 AGCAATCAGCCCCAAATACAAACAGGACGTGGAAGGCGCTGAGTCGCAGCTGGACGAGGATGAGCATGGCTTAC 1480
Query 1454 ATACTAAGTACATTCATCGAATGATGCAGATTGAGTTCATAAAACAAGGAAGCATGAATTTCAGATTCATCCCT 1527
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 ATACTAAGTACATTCATCGAATGATGCAGATTGAGTTCATAAAACAAGGAAGCATGAATTTCAGATTCATCCCT 1554
Query 1528 GTGCTCTTCCCAAATGCTAAGAAGGAGCATGTGCCCACCTGGCTTCAGAACACTCATGTCTACAGCTGGCCCAA 1601
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 GTGCTCTTCCCAAATGCTAAGAAGGAGCATGTGCCCACCTGGCTTCAGAACACTCATGTCTACAGCTGGCCCAA 1628
Query 1602 GAATAAAAAAAACATCCTGCTGCGGCTGCTGAGAGAGGAAGAGTATGTGGCTCCTCCACGGGGGCCTCTGCCCA 1675
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 GAATAAAAAAAACATCCTGCTGCGGCTGCTGAGAGAGGAAGAGTATGTGGCTCCTCCACGGGGGCCTCTGCCCA 1702
Query 1676 CCCTTCAGGTGGTTCCCTTG 1695
||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CCCTTCAGGTGGTTCCCTTG 1722