Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07679
• Subject: NM_016325.3
• Aligned Length: 1959
• Identities: 1862
• Gaps: 96

Alignment

Query    1  ATGGCCTCCAGGCTTCCGACGGCCTGGTCCTGTGAACCAGTGACCTTTGAAGATGTAACACTGGGTTTTACCCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCCTCCAGGCTTCCGACGGCCTGGTCCTGTGAACCAGTGACCTTTGAAGATGTAACACTGGGTTTTACCCC  74

Query   75  GGAAGAGTGGGGACTGCTGGACCTCAAACAGAAGTCCCTGTACAGGGAAGTGATGCTGGAGAACTACAGGAACC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAAGAGTGGGGACTGCTGGACCTCAAACAGAAGTCCCTGTACAGGGAAGTGATGCTGGAGAACTACAGGAACC  148

Query  149  TGGTCTCAGTGGAACATCAGCTTTCCAAACCAGATGTGGTATCTCAGTTAGAGGAGGCAGAAGATTTCTGGCCA  222
            |||||||||||                                                               
Sbjct  149  TGGTCTCAGTG---------------------------------------------------------------  159

Query  223  GTGGAGAGAGGAATTCCTCAAGACACCATTCCAGAGTATCCTGAGCTCCAGCTGGACCCTAAATTGGATCCTCT  296
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  160  ---------------------------------GAGTATCCTGAGCTCCAGCTGGACCCTAAATTGGATCCTCT  200

Query  297  TCCTGCTGAGAGTCCCCTAATGAACATTGAGGTTGTTGAGGTCCTCACACTGAACCAGGAGGTGGCTGGTCCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  201  TCCTGCTGAGAGTCCCCTAATGAACATTGAGGTTGTTGAGGTCCTCACACTGAACCAGGAGGTGGCTGGTCCCC  274

Query  371  GGAATGCCCAGATCCAGGCCCTATATGCTGAAGATGGAAGCCTGAGTGCAGATGCCCCCAGTGAGCAGATCCAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  275  GGAATGCCCAGATCCAGGCCCTATATGCTGAAGATGGAAGCCTGAGTGCAGATGCCCCCAGTGAGCAGGTCCAA  348

Query  445  CAGCAGGGCAAGCATCCAGGTGACCCTGAGGCCGCGCGCCAGAGGTTCCGGCAGTTCCGTTATAAGGACATGAC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  349  CAGCAGGGCAAGCATCCAGGTGACCCTGAGGCCGCGCGCCAGAGGTTCCGGCAGTTCCGTTATAAGGACATGAC  422

Query  519  AGGTCCCCGGGAGGCCCTGGACCAGCTCCGAGAGCTGTGTCACCAGTGGCTACAGCCTAAGGCACGCTCCAAGG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  423  AGGTCCCCGGGAGGCCCTGGACCAGCTCCGAGAGCTGTGTCACCAGTGGCTACAGCCTAAGGCACGCTCCAAGG  496

Query  593  AGCAGATCCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTAGGTGCACTGCCTGTGAAGCTCCGGACATGGGTGGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  497  AGCAGATCCTGGAGCTGCTGGTGCTGGAGCAGTTCCTAGGTGCACTGCCTGTGAAGCTCCGGACATGGGTGGAA  570

Query  667  TCGCAGCACCCAGAGAACTGCCAAGAGGTGGTGGCCCTGGTAGAGGGTGTGACCTGGATGTCTGAGGAGGAAGT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  571  TCGCAGCACCCAGAGAACTGCCAAGAGGTGGTGGCCCTGGTAGAGGGTGTGACCTGGATGTCTGAGGAGGAAGT  644

Query  741  ACTTCCTGCAGGACAACCTGCCGAGGGCACCACCTGCTGCCTCGAGGTCACTGCCCAGCAGGAGGAGAAGCAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  645  ACTTCCTGCAGGACAACCTGCCGAGGGCACCACCTGCTGCCTCGAGGTCACTGCCCAGCAGGAGGAGAAGCAGG  718

Query  815  AGGATGCAGCCATCTGCCCAGTGACAGTGCTCCCTGAGGAGCCAGTGACCTTCCAGGATGTGGCTGTGGACTTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  719  AGGATGCAGCCATCTGCCCAGTGACAGTGCTCCCTGAGGAGCCAGTGACCTTCCAGGATGTGGCTGTGGACTTC  792

Query  889  AGCCGGGAGGAGTGGGGGCTGCTGGGCCCGACACAGAGGACCGAGTACCGCGATGTGATGCTGGAGACCTTTGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  793  AGCCGGGAGGAGTGGGGGCTGCTGGGCCCGACACAGAGGACCGAGTACCGCGATGTGATGCTGGAGACCTTTGG  866

Query  963  GCACCTGGTCTCTGTGGGGTGGGAGACTACACTGGAAAATAAAGAGTTAGCTCCAAATTCTGACATTCCTGAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  867  GCACCTGGTCTCTGTGGGGTGGGAGACTACACTGGAAAATAAAGAGTTAGCTCCAAATTCTGACATTCCTGAGG  940

Query 1037  AAGAACCAGCCCCCAGCCTGAAAGTACAAGAATCCTCAAGGGATTGTGCCTTGTCCTCTACATTAGAAGATACC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  941  AAGAACCAGCCCCCAGCCTGAAAGTACAAGAATCCTCAAGGGATTGTGCCTTGTCCTCTACATTAGAAGATACC  1014

Query 1111  TTGCAGGGTGGGGTCCAGGAAGTCCAAGACACAGTGTTGAAGCAGATGGAGTCTGCTCAGGAAAAAGACCTTCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015  TTGCAGGGTGGGGTCCAGGAAGTCCAAGACACAGTGTTGAAGCAGATGGAGTCTGCTCAGGAAAAAGACCTTCC  1088

Query 1185  TCAGAAGAAGCACTTTGACAACCGTGAGTCCCAGGCAAACAGTGGTGCTCTTGACACAAACCAAGTTTCGCTCC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089  TCAGAAGAAGCACTTTGACAACCGTGAGTCCCAGGCAAACAGTGGTGCTCTTGACACAAACCAAGTTTCGCTCC  1162

Query 1259  AGAAAATTGACAACCCTGAGTCCCAGGCAAACAGTGGCGCTCTTGACACAAACCAAGTTTTGCTCCACAAAATT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1163  AGAAAATTGACAACCCTGAGTCCCAGGCAAACAGTGGCGCTCTTGACACAAACCAAGTTTTGCTCCACAAAATT  1236

Query 1333  CCTCCTAGAAAACGATTGCGCAAACGTGACTCACAAGTTAAAAGTATGAAACATAATTCACGTGTAAAAATTCA  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237  CCTCCTAGAAAACGATTGCGCAAACGTGACTCACAAGTTAAAAGTATGAAACATAATTCACGTGTAAAAATTCA  1310

Query 1407  TCAGAAGAGCTGTGAAAGGCAAAAGGCCAAGGAAGGCAATGGTTGTAGGAAAACCTTCAGTCGGAGTACTAAAC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311  TCAGAAGAGCTGTGAAAGGCAAAAGGCCAAGGAAGGCAATGGTTGTAGGAAAACCTTCAGTCGGAGTACTAAAC  1384

Query 1481  AGATTACGTTTATAAGAATTCACAAGGGGAGCCAAGTTTGCCGATGCAGTGAATGTGGTAAAATATTCCGGAAC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385  AGATTACGTTTATAAGAATTCACAAGGGGAGCCAAGTTTGCCGATGCAGTGAATGTGGTAAAATATTCCGGAAC  1458

Query 1555  CCAAGATACTTTTCTGTGCATAAGAAAATCCATACCGGAGAGAGGCCCTATGTGTGTCAAGACTGTGGGAAAGG  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459  CCAAGATACTTTTCTGTGCATAAGAAAATCCATACCGGAGAGAGGCCCTATGTGTGTCAAGACTGTGGGAAAGG  1532

Query 1629  ATTTGTTCAGAGCTCTTCCCTCACACAGCATCAGAGAGTTCATTCTGGAGAGAGACCATTTGAATGTCAGGAGT  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533  ATTTGTTCAGAGCTCTTCCCTCACACAGCATCAGAGAGTTCATTCTGGAGAGAGACCATTTGAATGTCAGGAGT  1606

Query 1703  GTGGGAGGACCTTCAATGATCGCTCAGCCATCTCCCAGCACCTGAGGACTCACACTGGCGCTAAGCCCTACAAG  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1607  GTGGGAGGACCTTCAATGATCGCTCAGCCATCTCCCAGCACCTGAGGACTCACACTGGCGCTAAGCCCTACAAG  1680

Query 1777  TGTCAGGACTGTGGAAAAGCCTTCCGCCAGAGCTCCCACCTCATCAGACATCAGAGGACTCACACCGGGGAGCG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681  TGTCAGGACTGTGGAAAAGCCTTCCGCCAGAGCTCCCACCTCATCAGACATCAGAGGACTCACACCGGGGAGCG  1754

Query 1851  CCCATATGCATGCAACAAATGTGGAAAGGCCTTCACCCAGAGCTCACACCTTATTGGGCACCAGAGAACCCACA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755  CCCATATGCATGCAACAAATGTGGAAAGGCCTTCACCCAGAGCTCACACCTTATTGGGCACCAGAGAACCCACA  1828

Query 1925  ATAGGACAAAGCGAAAGAAGAAACAGCCTACCTCA  1959
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1829  ATAGGACAAAGCGAAAGAAGAAACAGCCTACCTCA  1863