Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07695
- Subject:
- NM_001278399.2
- Aligned Length:
- 1953
- Identities:
- 1361
- Gaps:
- 588
Alignment
Query 1 ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA 74
Query 75 CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC 148
Query 149 AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA 222
Query 223 CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACATGCAGGGCGGTATCGCTGTTA 296
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct 223 CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTA 296
Query 297 CTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA 370
Query 371 AACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAG 444
Query 445 GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCA 518
Query 519 TGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCT 592
Query 593 ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT 666
Query 667 TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGG 740
Query 741 CTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCAC 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCAC 814
Query 815 AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA 888
Query 889 TGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 TGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACA 962
Query 963 GTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT 1036
Query 1037 GTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 GTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGA 1110
Query 1111 TCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 TCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTA 1184
Query 1185 CAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCT 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCT 1258
Query 1259 CAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACAACAGGCCCCACCTCCACATCT---GGCCCTGAGGACCAGCCC 1329
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||
Sbjct 1259 CAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACAACAGGCCCCACCTCCACATCTGCAGGCCCTGAGGACCAGCCC 1332
Query 1330 CTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCATCTTGGTGGC 1403
|||||||||||||||||||||||||||||||||..|
Sbjct 1333 CTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGGTGAG-------------------------------------- 1368
Query 1404 CGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGA 1477
Sbjct 1369 -------------------------------------------------------------------------- 1368
Query 1478 CATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAGGCCTG 1551
Sbjct 1369 -------------------------------------------------------------------------- 1368
Query 1552 CAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGA 1625
Sbjct 1369 -------------------------------------------------------------------------- 1368
Query 1626 GGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAAC 1699
Sbjct 1369 -------------------------------------------------------------------------- 1368
Query 1700 ACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGA 1773
Sbjct 1369 -------------------------------------------------------------------------- 1368
Query 1774 CAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCA 1847
Sbjct 1369 -------------------------------------------------------------------------- 1368
Query 1848 GCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGC 1921
Sbjct 1369 -------------------------------------------------------------------------- 1368
Query 1922 CCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1950
Sbjct 1369 ----------------------------- 1368