Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07695
• Subject: XM_017026182.2
• Aligned Length: 1983
• Identities: 1946
• Gaps: 33

Alignment

Query    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74

Query   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148

Query  149  AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222

Query  223  CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACATGCAGGGCGGTATCGCTGTTA  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTA  296

Query  297  CTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA  370

Query  371  AACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAG  444

Query  445  GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCA  518

Query  519  TGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCT  592

Query  593  ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT  666

Query  667  TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGG  740

Query  741  CTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCAC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCAC  814

Query  815  AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA  888

Query  889  TGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCG-------  955
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  889  TGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGCCCC  962

Query  956  --------------------CAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGG  1009
                                ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TCGCCCATCCTTCTTCTCTCCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGG  1036

Query 1010  CCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGG  1083
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGG  1110

Query 1084  GCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCC  1157
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCC  1184

Query 1158  TGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACC  1231
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACC  1258

Query 1232  CCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACAACAGGCCCCACCTCC  1305
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACAACAGGCCCCACCTCC  1332

Query 1306  ACATCT---GGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCT  1376
            ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ACATCTGCAGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCT  1406

Query 1377  GGGGGTTGTGATCGGCATCTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCC  1450
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  GGGGGTTGTGATCGGCATCTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCC  1480

Query 1451  GACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTG  1524
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTG  1554

Query 1525  GGGCCAGAGCCCACAGACAGAGGCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTA  1598
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  GGGCCAGAGCCCACAGACAGAGGCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTA  1628

Query 1599  TGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCG---GAGCCCACACGATGAAGACC  1669
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGCAGAGCCCACACGATGAAGACC  1702

Query 1670  CCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTG  1743
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  CCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTG  1776

Query 1744  TCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATC  1817
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATC  1850

Query 1818  TGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTTAGACGGAAGGCAACTGAGCCTCCTC  1891
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTC  1924

Query 1892  CATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1950
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1983