Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07727
• Subject: NM_024471.5
• Aligned Length: 1123
• Identities: 971
• Gaps: 11

Alignment

Query    1  ATGTCTCTACGCTGCGGGGATGCAGCCCGCACCCTGGGGCCCCGGGTATTTGGGAGATATTTTTGCAGCCCAGT  74
            |||.|||||||||||.|||||.||||.||||.|||||||.|||||.|||||||.||||||...|.||   |.||
Sbjct    1  ATGGCTCTACGCTGCTGGGATACAGCTCGCAGCCTGGGGTCCCGGATATTTGGAAGATATGCGTTCA---CGGT  71

Query   75  CAGACCGTTAAGCTCCTTGCCAGATAAAAAAAAGGAACTCCTACAGAATGGACCAGACCTTCAAGATTTTGTAT  148
            .|||.|.|||||.||.|||||||||||.|||||||||.|..|.||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   72  TAGAGCATTAAGTTCTTTGCCAGATAAGAAAAAGGAATTTTTGCATAATGGACCAGACCTTCAAGATTTTGTAT  145

Query  149  CTGGTGATCTTGCAGACAGGAGCACCTGGGATGAATATAAAGGAAACCTAAAACGCCAGAAAGGAGAAAGGTTA  222
            ||||||||||||||||||.|||.||.|||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||.||
Sbjct  146  CTGGTGATCTTGCAGACAAGAGTACATGGGATGAATATAAAGGAAACTTAAAGCGCCAGAAAGGAGAAAGGCTA  219

Query  223  AGACTACCTCCATGGCTAAAGACAGAGATTCCCATGGGGAAAAATTACAATAAACTGAAAAATACTTTGCGGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  220  AGACTACCTCCATGGCTAAAGACAAAGATACCCATGGGTAAAAACTACAATAAACTGAAAAATACATTGCGGAA  293

Query  297  TTTAAATCTCCATACAGTATGTGAGGAAGCTCGATGTCCCAATATTGGAGAGTGTTGGGGAGGTGGAGAATATG  370
            |||||.||||||.|||||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  294  TTTAAGTCTCCACACAGTGTGTGAGGAAGCCCGGTGCCCCAACATTGGAGAGTGTTGGGGAGGTGGGGAATATG  367

Query  371  CCACCGCCACAGCCACGATCATGTTGATGGGTGACACATGTACAAGAGGTTGCAGATTTTGTTCTGTTAAGACT  444
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  368  CCACAGCCACAGCCACGATCATGTTGATGGGGGACACATGCACAAGAGGTTGCAGATTTTGTTCCGTTAAGACC  441

Query  445  GCAAGAAATCCTCCTCCACTGGATGCCAGTGAGCCCTACAATACTGCAAAGGCAATTGCAGAATGGGGTCTGGA  518
            |||||||||||.||||||.|||||||||.|||||||.|||||||.||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct  442  GCAAGAAATCCCCCTCCATTGGATGCCAATGAGCCCGACAATACGGCCAAAGCAATTGCAGAGTGGGGTCTGGA  515

Query  519  TTATGTTGTCCTGACATCTGTGGATCGAGATGATATGCCTGATGGGGGAGCTGAACACATTGCAAAGACCGTAT  592
            |||||||||||||||.||.|||||||||||||||.||.|.||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.|
Sbjct  516  TTATGTTGTCCTGACGTCGGTGGATCGAGATGATGTGGCCGACGGGGGAGCTGAGCACATCGCCAAGACCGTGT  589

Query  593  CATATTTAAAGGAAAGGAATCCAAAAATCCTTGTGGAGTGTCTTACTCCTGATTTTCGAGGTGATCTCAAAGCA  666
            |||..||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||.||.||.||.||.||.|||||||||||.|.||||
Sbjct  590  CATGCTTGAAGGAAAGGAATCCAAAAATCCTCGTGGAATGCCTCACCCCAGACTTCCGAGGTGATCTGAGAGCA  663

Query  667  ATAGAAAAAGTTGCTCTGTCAGGATTAGATGTGTATGCACATAATGTAGAAACAGTCCCGGAATTACAGAGTAA  740
            .|.||.||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||.|||||.||.||||||||.||
Sbjct  664  GTGGAGAAGGTGGCTCTGTCTGGATTAGATGTGTATGCACACAATGTGGAGACTGTCCCCGAGTTACAGAGGAA  737

Query  741  GGTTCGTGATCCTCGGGTCAATTTTGATCAGTCCCTACGTGTACTGAAACATGCCAAGAAGGTTCAGCCTGATG  814
            .|||||||||||.||||.|||||||||.|||||.||.||||||||||.||||||||||.||||.||||||||||
Sbjct  738  AGTTCGTGATCCCCGGGCCAATTTTGACCAGTCTCTTCGTGTACTGAGACATGCCAAGGAGGTCCAGCCTGATG  811

Query  815  TTATTTCTAAAACATCTATAATGTTGGGTTTAGGCGAGAATGATGAGCAAGTATATGCAACAATGAAAGCACTT  888
            ||.||||.||||||||.||||||.||||..|.||.||||..||.||||||||.|||||.|||.|||||||.||.
Sbjct  812  TTGTTTCCAAAACATCGATAATGCTGGGCCTTGGTGAGACAGACGAGCAAGTCTATGCCACACTGAAAGCTCTC  885

Query  889  CGTGAGGCAGATGTAGACTGCTTGACTTTAGGACAATATATGCAGCCAACAAGGCGTCACCTTAAGGTTGAAGA  962
            ||||.|||.||.||.|||||.||.|||.||||.||.||.|||||||||||.|.|||.|||||||||||||||||
Sbjct  886  CGTGCGGCCGACGTGGACTGTTTAACTCTAGGGCAGTACATGCAGCCAACGAAGCGCCACCTTAAGGTTGAAGA  959

Query  963  ATATATTACTCCTGAAAAATTCAAATACTGGGAAAAAGTAGGAAATGAACTTGGATTTCATTATACTGCAAGTG  1036
            ||||.||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||..|||||.|||||||
Sbjct  960  ATATGTTACTCCTGAGAAGTTCAAATACTGGGAAAAAGTAGGGAATGAACTTGGATTTCTCTATACGGCAAGTG  1033

Query 1037  GCCCTTTGGTGCGTTCTTCATATAAAGCAGGTGAATTTTTCCTGAAAAATCTAGTGGCTAAAAGAAAAACAAAA  1110
            |.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1034  GTCCTTTGGTGCGATCTTCATATAAAGCAGGTGAATTTTTCCTGAAAAATCTAGTGGCTAGAAGAAAAACAAAA  1107

Query 1111  GACCTC-------  1116
            | |.||       
Sbjct 1108  G-CTTCTAAAGTG  1119