Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07727
• Subject: NM_194451.3
• Aligned Length: 1116
• Identities: 963
• Gaps: 150

Alignment

Query    1  ATGTCTCTACGCTGCGGGGATGCAGCCCGCACCCTGGGGCCCCGGGTATTTGGGAGATATTTTTGCAGCCCAGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCTCTACGCTGCGGGGATGCAGCCCGCACCCTGGGGCCCCGGGTATTTGGGAGATATTTTTGCAGCCCAGT  74

Query   75  CAGACCGTTAAGCTCCTTGCCAGATAAAAAAAAGGAACTCCTACAGAATGGACCAGACCTTCAAGATTTTGTAT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CAGACCGTTAAGCTCCTTGCCAGATAAAAAAAAGGAACTCCTACAGAATGGACCAGACCTTCAAGATTTTGTAT  148

Query  149  CTGGTGATCTTGCAGACAGGAGCACCTGGGATGAATATAAAGGAAACCTAAAACGCCAGAAAGGAGAAAGGTTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CTGGTGATCTTGCAGACAGGAGCACCTGGGATGAATATAAAGGAAACCTAAAACGCCAGAAAGGAGAAAGGTTA  222

Query  223  AGACTACCTCCATGGCTAAAGACAGAGATTCCCATGGGGAAAAATTACAATAAACTGAAAAATACTTTGCGGAA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGACTACCTCCATGGCTAAAGACAGAGATTCCCATGGGGAAAAATTACAATAAACTGAAAAATACTTTGCGGAA  296

Query  297  TTTAAATCTCCATACAGTATGTGAGGAAGCTCGATGTCCCAATATTGGAGAGTGTTGGGGAGGTGGAGAATATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTTAAATCTCCATACAGTATGTGAGGAAGCTCGATGTCCCAATATTGGAGAGTGTTGGGGAGGTGGAGAATATG  370

Query  371  CCACCGCCACAGCCACGATCATGTTGATGGGTGACACATGTACAAGAGGTTGCAGATTTTGTTCTGTTAAGACT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCACCGCCACAGCCACGATCATGTTGATGGGTGACACATGTACAAGAGGTTGCAGATTTTGTTCTGTTAAGACT  444

Query  445  GCAAGAAATCCTCCTCCACTGGATGCCAGTGAGCCCTACAATACTGCAAAGGCAATTGCAGAATGGGGTCTGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GCAAGAAATCCTCCTCCACTGGATGCCAGTGAGCCCTACAATACTGCAAAGGCAATTGCAGAATGGGGTCTGGA  518

Query  519  TTATGTTGTCCTGACATCTGTGGATCGAGATGATATGCCTGATGGGGGAGCTGAACACATTGCAAAGACCGTAT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TTATGTTGTCCTGACATCTGTGGATCGAGATGATATGCCTGATGGGGGAGCTGAACACATTGCAAAGACCGTAT  592

Query  593  CATATTTAAAGGAAAGGAATCCAAAAATCCTTGTGGAGTGTCTTACTCCTGATTTTCGAGGTGATCTCAAAGCA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CATATTTAAAGGAAAGGAATCCAAAAATCCTTGTGGAGTGTCTTACTCCTGATTTTCGAGGTGATCTCAAAGCA  666

Query  667  ATAGAAAAAGTTGCTCTGTCAGGATTAGATGTGTATGCACATAATGTAGAAACAGTCCCGGAATTACAGAGTAA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  ATAGAAAAAGTTGCTCTGTCAGGATTAGATGTGTATGCACATAATGTAGAAACAGTCCCGGAATTACAGAGTAA  740

Query  741  GGTTCGTGATCCTCGGGTCAATTTTGATCAGTCCCTACGTGTACTGAAACATGCCAAGAAGGTTCAGCCTGATG  814
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTTCGTGATCCTCGGGCCAATTTTGATCAGTCCCTACGTGTACTGAAACATGCCAAGAAGGTTCAGCCTGATG  814

Query  815  TTATTTCTAAAACATCTATAATGTTGGGTTTAGGCGAGAATGATGAGCAAGTATATGCAACAATGAAAGCACTT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTATTTCTAAAACATCTATAATGTTGGGTTTAGGCGAGAATGATGAGCAAGTATATGCAACAATGAAAGCACTT  888

Query  889  CGTGAGGCAGATGTAGACTGCTTGACTTTAGGACAATATATGCAGCCAACAAGGCGTCACCTTAAGGTTGAAGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||
Sbjct  889  CGTGAGGCAGATGTAGACTGCTTGACTTTAGGACAATATATGCAGCCAACAAGGCGTCACCTTAAGGT----GA  958

Query  963  ATATATTACTCCTGAAAAATTCAAATACTGGGAAAAAGTAGGAAATGAACTTGGATTTCATTATACTGCAAGTG  1036
            || |.||.|                                                                 
Sbjct  959  AT-TTTTCC-----------------------------------------------------------------  966

Query 1037  GCCCTTTGGTGCGTTCTTCATATAAAGCAGGTGAATTTTTCCTGAAAAATCTAGTGGCTAAAAGAAAAACAAAA  1110
                                                                                      
Sbjct  967  --------------------------------------------------------------------------  966

Query 1111  GACCTC  1116
                  
Sbjct  967  ------  966