Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07729
- Subject:
- NM_001081637.2
- Aligned Length:
- 1959
- Identities:
- 1204
- Gaps:
- 645
Alignment
Query 1 ATGACCTCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGCCTGGACCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCC 74
||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct 1 ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA 74
Query 75 CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAAGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC 148
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC 148
Query 149 AGGGGAGCCTGGAGACGCAGGAGTACCATCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACTCTGGATTACACGGATCCCA 222
|||||.|||.||||||.||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA 222
Query 223 CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCTATCCATCACCTGGGAACATGCAGGGCGGTATTGCTGTAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||..
Sbjct 223 CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTA 296
Query 297 CTATGGCAGCCACACTGTAGGCCTCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACAGCA 370
||||||.|||.||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 297 CTATGGTAGCGACACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCA 370
Query 371 AACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAATGTGACCATCCAGTGTGACTCACAG 444
||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||.|||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||
Sbjct 371 AACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAG 444
Query 445 GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCATTCCCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 445 GTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCA 518
Query 519 TGCCCGTGGGTCATCCCGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCAAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCT 592
||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 519 TGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCT 592
Query 593 ATGGTTATGACTCGCGCGCTCCCTATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGGGCTCCTGGTCCCAGGTGTT 666
|||.||||||||||..|.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||
Sbjct 593 ATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTT 666
Query 667 TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCGGGTCCTGTCGTGGCCCCTGGGGAGAAGCTGACCTTCCAGTGTGG 740
|||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||||.|||||..|||||..|.||||||||
Sbjct 667 TCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGG 740
Query 741 CTCTGATGCCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTACAAGGAGTGGGGACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCGGC 814
|||||||||.||||||.||||||||||||||||.|||||..|||.||||||||||||.||||.|.|||||...|
Sbjct 741 CTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCAC 814
Query 815 AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACACA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 815 AGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGA 888
Query 889 TGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACA 962
||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 889 TGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACA 962
Query 963 GATCCGTGCCAGACCCTTCCTCTCCGTGCGGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT 1036
|.||..||.||||..||.||||||.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGT 1036
Query 1037 GTCAGTCACAGGGAGGGATGCACACTTTCCTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATTCCCCGCTGCGTCTAAAA 1110
||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||..|||...||||||||.|
Sbjct 1037 GTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGA 1110
Query 1111 TCAAAGCGCCAATCTCATAAGTACCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCGGCCCACGCGGGGACCTA 1184
||||.|..|||||||||.||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.|||||||||||
Sbjct 1111 TCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTA 1184
Query 1185 CAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCT 1258
|||||||||||||||||..||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCT 1258
Query 1259 CAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC-CCACCACAAAACAAGTCCGA-CTCCA-------AGGCTGGTGAG------ 1317
|||||.|..|||.|..||.|||| ||.|.|| ||||.|.||.| ||||| |||| ..||||
Sbjct 1259 CAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGAC--AACAGGCCCCACCTCCACATCTGCAGGC-CCTGAGGACCAG 1329
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1330 CCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCATCTTGGT 1403
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1404 GGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACT 1477
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1478 GGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAGGC 1551
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1552 CTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCC 1625
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1626 TGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGG 1699
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1700 TGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAG 1773
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1774 GACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTA 1847
Query 1318 -------------------------------------------------------------------------- 1317
Sbjct 1848 CGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAG 1921
Query 1318 ----------------------------------- 1317
Sbjct 1922 CTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1956