Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07729
• Subject: XM_017026189.1
• Aligned Length: 2006
• Identities: 1204
• Gaps: 691

Alignment

Query    1  ---------------------------------------------------ATGACCTCCATCCTCACGGTCCT  23
                                                               ||||||.||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCACCGAGGGCTCATCCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCCATCCTCACGGTCCT  74

Query   24  GATCTGTCTCGGGCTGAGCCTGGACCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCCCCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGG  97
            ||||||||||||||||||.||||.||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGG  148

Query   98  CTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAAGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGAGCCTGGAGACGCAGGAG  171
            ||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||.||||||.||||||
Sbjct  149  CTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAG  222

Query  172  TACCATCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACTCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCA  245
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  TACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCA  296

Query  246  GTTCCCCATCCTATCCATCACCTGGGAACATGCAGGGCGGTATTGCTGTATCTATGGCAGCCACACTGTAGGCC  319
            |||||||||||.||||||||||||||||||..|||||||||||.|||||..||||||.|||.||||||.|||||
Sbjct  297  GTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGTTACTATGGTAGCGACACTGCAGGCC  370

Query  320  TCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACAGCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCC  393
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|.||||
Sbjct  371  GCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCC  444

Query  394  AGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAATGTGACCATCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCT  467
            |||||.|||||||.|||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCT  518

Query  468  GTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCATTCCCATGCCCGTGGGTCATCCCGGGCCA  541
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  519  GTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCA  592

Query  542  TCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCAAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTATGGTTATGACTCGCGCGCTCCC  615
            |||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||..|.|||||
Sbjct  593  TCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCC  666

Query  616  TATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGGGCTCCTGGTCCCAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGT  689
            ||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGT  740

Query  690  GCAGCCGGGTCCTGTCGTGGCCCCTGGGGAGAAGCTGACCTTCCAGTGTGGCTCTGATGCCGGCTACGACAGAT  763
            ||||||.||||||.||||||||||||.|||||..|||||..|.|||||||||||||||||.||||||.||||||
Sbjct  741  GCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGAT  814

Query  764  TTGTTCTGTACAAGGAGTGGGGACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGCCGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAG  837
            ||||||||||.|||||..|||.||||||||||||.||||.|.|||||...||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAG  888

Query  838  GCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACACATGCTCCGGTGCATACAACCTCTC  911
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||.||||||||||
Sbjct  889  GCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTC  962

Query  912  CTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGATCCGTGCCAGACCCTTCCTCT  985
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||..||.||||..||.|||||
Sbjct  963  CTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCT  1036

Query  986  CCGTGCGGCCGGGCCCCACAGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGAGGGATGCAC  1059
            |.||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.
Sbjct 1037  CGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAA  1110

Query 1060  ACTTTCCTTTTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATTCCCCGCTGCGTCTAAAATCAAAGCGCCAATCTCATAAGTA  1133
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||..|||...||||||||.|||||.|..|||||||||.||.||
Sbjct 1111  ACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATA  1184

Query 1134  CCAGGCTGAATTCCCCATGAGTCCTGTGACCTCGGCCCACGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCT  1207
            |||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||..||||
Sbjct 1185  CCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCT  1258

Query 1208  CCAACCCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGC  1281
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|..|||.|..||.||||
Sbjct 1259  CCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGC  1332

Query 1282  -CCACCACAAAACAAGTCCGA-CTCCAAGGCTGG---TGAG---------------------------------  1317
             ||.|.||  ||||.|.||.| |||||...||||   ||||                                 
Sbjct 1333  TCCCCGAC--AACAGGCCCCACCTCCACATCTGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCC  1404

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1405  CAGAGTGGTCTGGGAAGGCACCTGGGGGTTGTGATCGGCATCTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCT  1478

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1479  CCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATT  1552

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1553  TCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAGGCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCC  1626

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1627  GATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCG  1700

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1701  GCAGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAA  1774

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1775  TGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAG  1848

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1849  ATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAG  1922

Query 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317
                                                                                      
Sbjct 1923  ACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGG  1996

Query 1318  --------  1317
                    
Sbjct 1997  CCATCCAC  2004