Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07730
• Subject: NM_001278319.1
• Aligned Length: 1429
• Identities: 1168
• Gaps: 143

Alignment

Query    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74
            ||||||||||||.||||.|||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..
Sbjct    1  ATGACCCCCATCGTCACAGTCCTGATCTGTCTCAGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGAC  74

Query   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCATCCAGGGAAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||.||||||.|||||.|||||||||.||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAGCCCACACTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCCGTGACCCTCTGGTGTC  148

Query  149  AGGGGAGCCTTCAGGCTGAGGAGTACCATCTATATAGGGAAAACAAATCAGCATCCTGGGTTAGACGGAT---A  219
            ||||||.|||..||.|..|||||||||.|||.|||||.|||||.|||.|||||.|||||.|||.||||||   |
Sbjct  149  AGGGGATCCTGGAGACCCAGGAGTACCGTCTGTATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222

Query  220  CAAGAGCCTGGGAAGAATGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACGCAGGGCGGTATCACTGTCA  293
            ||.|||..||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||  
Sbjct  223  CAGGAGATTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGT--  294

Query  294  GTACTAC---AGCCACAAT-CA--CTCATCAGAGTACAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACA  361
             |.||||   |||||||.| ||  ||..||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  -TTCTACGGTAGCCACACTGCAGGCTGGTCAGAGCCCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACA  367

Query  362  GCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTTAGGAGGGAACGTGACCCTCCAGTGTGTCTCA  435
            .|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  368  TCAAACCCACCCTCTCAGCTCTACCCAGCCCTGTGGTGACCTCAGGAGGGAACGTGACCCTCCATTGTGTCTCA  441

Query  436  CAGGTGGCATTTGACGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAACGCCTGAACTCCCATTC  509
            |||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.||..|
Sbjct  442  CAGGTGGCATTTGGCAGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCACAGCC  515

Query  510  CCATGCCCGTGGGTGGTCCTGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGT  583
            ||.|.|||.||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  CCGTACCCATGGGTGGTCCCGGGCCATCTTCTCTGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGT  589

Query  584  GCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCCAGGT  657
            ||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  590  GCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCCATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGT  663

Query  658  GTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATGGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTG  731
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  GTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATAGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTG  737

Query  732  TGTCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGTT  805
            |||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||..
Sbjct  738  TGTTTCTGATGTCAGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCTCCCTGGCC  811

Query  806  GGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGCCAGTAC  879
            ..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||
Sbjct  812  CACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTAC  885

Query  880  AGATGCTACAGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGG  953
            |||||||.|.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  886  AGATGCTCCGGTGCATACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCGCAGG  959

Query  954  ACAGTTCTATGACAGACCCTCTC-TCTCGGTGCAGCCGGTCCCCACAGTAGCCCCAGGAAAGAACGTGACCCTG  1026
            |||||||..||.|||||||| || ||||||||||.||||.||||||.||.|||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  960  ACAGTTCCGTGGCAGACCCT-TCATCTCGGTGCATCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTG  1032

Query 1027  CTGTGTCAGTCACGGGGGCAGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGGCCATCCCCCACTGCATCT  1100
            ||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||.||||...||.||||.||.|.|||
Sbjct 1033  CTGTGTCAGTCATGGGGGCCGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGCGGGAGCAGCTGATGCCCCCCTCCGTCT  1106

Query 1101  GAGATCAGAGCACCAAGCTCAGCAGAACCAGGCTGAATTCCGCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCACGTGGGGA  1174
            .||||||...|||.||..||...||.|||||||||||||||..|||.||||||||||||||||||||..|||||
Sbjct 1107  CAGATCAATACACGAATATCCTAAGTACCAGGCTGAATTCCCTATGAGTCCTGTGACCTCAGCCCACTCGGGGA  1180

Query 1175  CCTACAGATGCTACAGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCTCCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTG  1248
            |||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||||.||
Sbjct 1181  CCTACAGGTGCTACGGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCACCCCAGTGACTCCCTGGAGCTCATG  1254

Query 1249  GTCTCAGCA---------TCCCT-AGGCCAACAC---------CCCCAGGATTACACAG--TGGAGAATCTCAT  1301
            |||||||.|         .|||| ||.|||.|||         ||    ||||.|| ||  |||.||.      
Sbjct 1255  GTCTCAGGAGCAGCTGAGACCCTCAGCCCACCACAAAACAAGTCC----GATTCCA-AGGCTGGTGAG------  1317

Query 1302  CCGCATGGGTGTGGCTGGCTTGGTCCTGGTGGTCCTCGGGATTCTGCTATTTGAGGCTCAGCACAGCCAGAGAA  1375
                                                                                      
Sbjct 1318  --------------------------------------------------------------------------  1317

Query 1376  GCCTACAAGATGCAGCCGGGAGG  1398
                                   
Sbjct 1318  -----------------------  1317