Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07730
- Subject:
- XM_017026182.2
- Aligned Length:
- 2000
- Identities:
- 1247
- Gaps:
- 619
Alignment
Query 1 ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA 74
Query 75 CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCATCCAGGGAAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC 148
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC 148
Query 149 AGGGGAGCCTTCAGGCTGAGGAGTACCATCTATATAGGGAAAACAAATCAGCATCCTGGGTTAGACGGAT---A 219
|||||.|||...||.|..|||||||||.|||||||||.|||||.|||.|||||.|||||.|||.|||||| |
Sbjct 149 AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA 222
Query 220 CAAGAGCCTGGGAAGAATGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACGCAGGGCGGTATCACTGTCA 293
||.||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 223 CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGT-- 294
Query 294 GTACTA---CAGCCACAATCACT-CA------TCAGAGTACAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCC 357
||||| .|||.| |||| || ||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 -TACTATGGTAGCGA----CACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCC 363
Query 358 TACAGCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTTAGGAGGGAACGTGACCCTCCAGTGTGT 431
||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||.||.|||||||||.||.|||||||||||||.
Sbjct 364 TACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGA 437
Query 432 CTCACAGGTGGCATTTGACGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAACGCCTGAACTCCC 505
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 438 CTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCC 511
Query 506 ATTCCCATGCCCGTGGGTGGTCCTGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTAC 579
|..|||||||||||||||.||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 512 AGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTAC 585
Query 580 AGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCC 653
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 586 AGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCT 659
Query 654 AGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATGGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCC 727
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|
Sbjct 660 AGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGC 733
Query 728 AGTGTGTCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCT 801
||||||.||||||||..||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|.||
Sbjct 734 AGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCT 807
Query 802 GGTTGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGCCA 875
||....||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||
Sbjct 808 GGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCA 881
Query 876 GTACAGATGCTACAGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATC- 948
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 882 GTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCG 955
Query 949 --------------------------ACAGGACAGTTCTATGACAGACCCTCTCTCTCGGTGCAGCCGGTCCCC 996
.||||||||||||||||||||..|||.||||||||||||||||.||||
Sbjct 956 CAGCCCCTCGCCCATCCTTCTTCTCTCCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCC 1029
Query 997 ACAGTAGCCCCAGGAAAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACGGGGGCAGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAA 1070
||.||.|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||...|.|.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1030 ACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAA 1103
Query 1071 GGAGGGGGCAGGCCATCCCCCACTGCATCTGAGATCAGAGCACCAAGCTCAGCAGAACCAGGCTGAATTCCGCA 1144
|||||||||||...||..||||..||.|||.||||||..|.|||||.||||..|..|||||||||||||||.||
Sbjct 1104 GGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCA 1177
Query 1145 TGGGTCCTGTGACCTCAGCCCACGTGGGGACCTACAGATGCTACAGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTG 1218
||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||.||||||..||||||||.||||||||||||
Sbjct 1178 TGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTG 1251
Query 1219 TCTCTCCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAG------------------------------------- 1255
.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 ACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACAACAGGCCC 1325
Query 1256 --------CAT-------CCCT-------AGGCCAACACCCCCA-------GGAT-TACACAGTGGAGAATCT- 1298
||| |||| ||.||..|||||||| |||| ..||.||||| |||
Sbjct 1326 CACCTCCACATCTGCAGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGG----TCTG 1395
Query 1299 ------CATCCGCATGGG---TGTGGCTGG---CTTGG---------TCCTGGTGGTCCTC------------- 1338
|| |.|||| ||||...|| ||||| ||||..||.|||||
Sbjct 1396 GGAAGGCA----CCTGGGGGTTGTGATCGGCATCTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCC 1465
Query 1339 ----------------------------GGG---ATTCT--------------------GCT-ATTT------- 1353
||| |..|| ||| ||||
Sbjct 1466 TCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACAT 1539
Query 1354 ------GAGGCT-------CAG----CACAGCCAGAGAAGCCTACA----AGATGCAGCCGGG----------- 1395
|.|||| ||| |||||.||||| ||||.|| ||.|.|||||..|
Sbjct 1540 CCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAG--GCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCC 1611
Query 1396 -AGG---------------------------------------------------------------------- 1398
|||
Sbjct 1612 CAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGCAGAG 1685
Query 1399 -------------------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1686 CCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCT 1759
Query 1399 -------------------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1760 CTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGAC 1833
Query 1399 -------------------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1834 ACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGA 1907
Query 1399 -------------------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1908 GGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCC 1981
Query 1399 -- 1398
Sbjct 1982 AC 1983
