Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07730
- Subject:
- XM_017026183.2
- Aligned Length:
- 1997
- Identities:
- 1247
- Gaps:
- 616
Alignment
Query 1 ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA 74
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA 74
Query 75 CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCATCCAGGGAAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC 148
|||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC 148
Query 149 AGGGGAGCCTTCAGGCTGAGGAGTACCATCTATATAGGGAAAACAAATCAGCATCCTGGGTTAGACGGAT---A 219
|||||.|||...||.|..|||||||||.|||||||||.|||||.|||.|||||.|||||.|||.|||||| |
Sbjct 149 AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA 222
Query 220 CAAGAGCCTGGGAAGAATGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACGCAGGGCGGTATCACTGTCA 293
||.||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||
Sbjct 223 CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGT-- 294
Query 294 GTACTA---CAGCCACAATCACT-CA------TCAGAGTACAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCC 357
||||| .|||.| |||| || ||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 295 -TACTATGGTAGCGA----CACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCC 363
Query 358 TACAGCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTTAGGAGGGAACGTGACCCTCCAGTGTGT 431
||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||.||.|||||||||.||.|||||||||||||.
Sbjct 364 TACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGA 437
Query 432 CTCACAGGTGGCATTTGACGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAACGCCTGAACTCCC 505
||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 438 CTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCC 511
Query 506 ATTCCCATGCCCGTGGGTGGTCCTGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTAC 579
|..|||||||||||||||.||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 512 AGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTAC 585
Query 580 AGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCC 653
||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 586 AGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCT 659
Query 654 AGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATGGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCC 727
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|
Sbjct 660 AGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGC 733
Query 728 AGTGTGTCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCT 801
||||||.||||||||..||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|.||
Sbjct 734 AGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCT 807
Query 802 GGTTGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGCCA 875
||....||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||
Sbjct 808 GGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCA 881
Query 876 GTACAGATGCTACAGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATC- 948
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 882 GTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCG 955
Query 949 --------------------------ACAGGACAGTTCTATGACAGACCCTCTCTCTCGGTGCAGCCGGTCCCC 996
.||||||||||||||||||||..|||.||||||||||||||||.||||
Sbjct 956 CAGCCCCTCGCCCATCCTTCTTCTCTCCAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCC 1029
Query 997 ACAGTAGCCCCAGGAAAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACGGGGGCAGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAA 1070
||.||.|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||...|.|.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1030 ACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAA 1103
Query 1071 GGAGGGGGCAGGCCATCCCCCACTGCATCTGAGATCAGAGCACCAAGCTCAGCAGAACCAGGCTGAATTCCGCA 1144
|||||||||||...||..||||..||.|||.||||||..|.|||||.||||..|..|||||||||||||||.||
Sbjct 1104 GGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCA 1177
Query 1145 TGGGTCCTGTGACCTCAGCCCACGTGGGGACCTACAGATGCTACAGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTG 1218
||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||.||||||..||||||||.||||||||||||
Sbjct 1178 TGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTG 1251
Query 1219 TCTCTCCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAG------------------------------------- 1255
.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1252 ACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACAACAGGCCC 1325
Query 1256 --------CAT----CCCT-------AGGCCAACACCCCCA-------GGAT-TACACAGTGGAGAATCT---- 1298
||| |||| ||.||..|||||||| |||| ..||.||||| |||
Sbjct 1326 CACCTCCACATCTGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGG----TCTGGGA 1395
Query 1299 ---CATCCGCATGGG---TGTGGCTGG---CTTGG---------TCCTGGTGGTCCTC---------------- 1338
|| |.|||| ||||...|| ||||| ||||..||.|||||
Sbjct 1396 AGGCA----CCTGGGGGTTGTGATCGGCATCTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCT 1465
Query 1339 -------------------------GGG---ATTCT--------------------GCT-ATTT---------- 1353
||| |..|| ||| ||||
Sbjct 1466 TCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCT 1539
Query 1354 ---GAGGCT-------CAG----CACAGCCAGAGAAGCCTACA----AGATGCAGCCGGG------------AG 1397
|.|||| ||| |||||.||||| ||||.|| ||.|.|||||..| ||
Sbjct 1540 GCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAG--GCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAG 1611
Query 1398 G------------------------------------------------------------------------- 1398
|
Sbjct 1612 GAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGCAGAGCCC 1685
Query 1399 -------------------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1686 ACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTC 1759
Query 1399 -------------------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1760 CTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACT 1833
Query 1399 -------------------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1834 GAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGC 1907
Query 1399 ------------------------------------------------------------------------- 1398
Sbjct 1908 AACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC 1980
