Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07730
• Subject: XM_017026184.2
• Aligned Length: 1997
• Identities: 1238
• Gaps: 616

Alignment

Query    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74

Query   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCATCCAGGGAAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148

Query  149  AGGGGAGCCTTCAGGCTGAGGAGTACCATCTATATAGGGAAAACAAATCAGCATCCTGGGTTAGACGGAT---A  219
            |||||.|||...||.|..|||||||||.|||||||||.|||||.|||.|||||.|||||.|||.||||||   |
Sbjct  149  AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222

Query  220  CAAGAGCCTGGGAAGAATGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACGCAGGGCGGTATCACTGTCA  293
            ||.||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||  
Sbjct  223  CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGT--  294

Query  294  GTACTA---CAGCCACAATCACT-CA------TCAGAGTACAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCC  357
             |||||   .|||.|    |||| ||      ||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  -TACTATGGTAGCGA----CACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCC  363

Query  358  TACAGCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTTAGGAGGGAACGTGACCCTCCAGTGTGT  431
            ||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||.||.|||||||||.||.|||||||||||||.
Sbjct  364  TACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGA  437

Query  432  CTCACAGGTGGCATTTGACGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAACGCCTGAACTCCC  505
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  438  CTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCC  511

Query  506  ATTCCCATGCCCGTGGGTGGTCCTGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTAC  579
            |..|||||||||||||||.||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  512  AGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTAC  585

Query  580  AGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCC  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  586  AGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCT  659

Query  654  AGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATGGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCC  727
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|
Sbjct  660  AGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGC  733

Query  728  AGTGTGTCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCT  801
            ||||||.||||||||..||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|.||
Sbjct  734  AGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCT  807

Query  802  GGTTGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGCCA  875
            ||....||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||
Sbjct  808  GGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCA  881

Query  876  GTACAGATGCTACAGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCA  949
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct  882  GTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCG  955

Query  950  CAGGACA------------GTTCTATGACAGACCC-------------TCTCTCTCGGTG-----CAGCCGGTC  993
            ||||..|            ||||..|.|..|||||             .|.||..|||.|     |||||||.|
Sbjct  956  CAGGTGAGGAGCCCAGCGGGTTCAGTCAGGGACCCAGGCTCCGCACAGGCCCTGCCGGGGGAGCTCAGCCGGGC  1029

Query  994  CCCACAGTAGCCCCAGGAAAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACGGGGGCAGTTCCACACTTTCCTTCTGAC  1067
            |||||.||.|||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||...|.|.||.||||||||||||||
Sbjct 1030  CCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGAC  1103

Query 1068  CAAGGAGGGGGCAGGCCATCCCCCACTGCATCTGAGATCAGAGCACCAAGCTCAGCAGAACCAGGCTGAATTCC  1141
            ||||||||||||||...||..||||..||.|||.||||||..|.|||||.||||..|..|||||||||||||||
Sbjct 1104  CAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCC  1177

Query 1142  GCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCACGTGGGGACCTACAGATGCTACAGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTG  1215
            .||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||.||||||.||||||..||||||||.|||||||||
Sbjct 1178  CCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTG  1251

Query 1216  CTGTCTCTCCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAG----------------------------------  1255
            |||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||                                  
Sbjct 1252  CTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACAACAGG  1325

Query 1256  -----------CAT----CCCT-------AGGCCAACACCCCCA-------GGAT-TACACAGTGGAGAATCT-  1298
                       |||    ||||       ||.||..||||||||       |||| ..||.|||||    ||| 
Sbjct 1326  CCCCACCTCCACATCTGGCCCTGAGGACCAGCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGG----TCTG  1395

Query 1299  ------CATCCGCATGGG---TGTGGCTGG---CTTGG---------TCCTGGTGGTCCTC-------------  1338
                  ||    |.||||   ||||...||   |||||         ||||..||.|||||             
Sbjct 1396  GGAAGGCA----CCTGGGGGTTGTGATCGGCATCTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCC  1465

Query 1339  ----------------------------GGG---ATTCT--------------------GCT-ATTT-------  1353
                                        |||   |..||                    ||| ||||       
Sbjct 1466  TCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGGGCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACAT  1539

Query 1354  ------GAGGCT-------CAG----CACAGCCAGAGAAGCCTACA----AGATGCAGCCGGG-----------  1395
                  |.||||       |||    |||||.|||||  ||||.||    ||.|.|||||..|           
Sbjct 1540  CCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACAGACAGAG--GCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCC  1611

Query 1396  -AGG----------------------------------------------------------------------  1398
             |||                                                                      
Sbjct 1612  CAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAGCACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGAGCCC  1685

Query 1399  --------------------------------------------------------------------------  1398
                                                                                      
Sbjct 1686  ACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTATGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTC  1759

Query 1399  --------------------------------------------------------------------------  1398
                                                                                      
Sbjct 1760  CTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGGACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACT  1833

Query 1399  --------------------------------------------------------------------------  1398
                                                                                      
Sbjct 1834  GAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGATGTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGC  1907

Query 1399  -------------------------------------------------------------------------  1398
                                                                                     
Sbjct 1908  AACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCCCTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1980