Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07730
• Subject: XM_017026185.1
• Aligned Length: 1967
• Identities: 1247
• Gaps: 586

Alignment

Query    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACCCCCATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCA  74

Query   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCATCCAGGGAAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CCTCCCCAAGCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTC  148

Query  149  AGGGGAGCCTTCAGGCTGAGGAGTACCATCTATATAGGGAAAACAAATCAGCATCCTGGGTTAGACGGAT---A  219
            |||||.|||...||.|..|||||||||.|||||||||.|||||.|||.|||||.|||||.|||.||||||   |
Sbjct  149  AGGGGGGCCAGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCA  222

Query  220  CAAGAGCCTGGGAAGAATGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACGCAGGGCGGTATCACTGTCA  293
            ||.||||.||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||  
Sbjct  223  CAGGAGCTTGTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGT--  294

Query  294  GTACTA---CAGCCACAATCACT-CA------TCAGAGTACAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCC  357
             |||||   .|||.|    |||| ||      ||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  295  -TACTATGGTAGCGA----CACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCC  363

Query  358  TACAGCAAACCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTTAGGAGGGAACGTGACCCTCCAGTGTGT  431
            ||||.||||||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||.||.|||||||||.||.|||||||||||||.
Sbjct  364  TACATCAAACCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGA  437

Query  432  CTCACAGGTGGCATTTGACGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAACGCCTGAACTCCC  505
            ||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct  438  CTCACAGGTGGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCC  511

Query  506  ATTCCCATGCCCGTGGGTGGTCCTGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTAC  579
            |..|||||||||||||||.||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  512  AGCCCCATGCCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTAC  585

Query  580  AGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCC  653
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  586  AGGTGCTATGCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCT  659

Query  654  AGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATGGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCC  727
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|
Sbjct  660  AGGTGTTTCTAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGC  733

Query  728  AGTGTGTCTCTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCT  801
            ||||||.||||||||..||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|.||
Sbjct  734  AGTGTGGCTCTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCT  807

Query  802  GGTTGGCAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGCCA  875
            ||....||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||
Sbjct  808  GGCGCACAGCCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCA  881

Query  876  GTACAGATGCTACAGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCA  949
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||.
Sbjct  882  GTACAGATGCTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATCG  955

Query  950  CAGGACAGTTCTATGACAGACCCTCTCTCTCGGTGCAGCCGGTCCCCACAGTAGCCCCAGGAAAGAACGTGACC  1023
            ||||||||||||||||||||..|||.||||||||||||||||.||||||.||.|||.|||||.|||||||||||
Sbjct  956  CAGGACAGTTCTATGACAGAGTCTCCCTCTCGGTGCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACC  1029

Query 1024  CTGCTGTGTCAGTCACGGGGGCAGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGGCCATCCCCCACTGCA  1097
            ||||||||||||||||.|||...|.|.||.||||||||||||||||||||||||||||...||..||||..||.
Sbjct 1030  CTGCTGTGTCAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCG  1103

Query 1098  TCTGAGATCAGAGCACCAAGCTCAGCAGAACCAGGCTGAATTCCGCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCACGTGG  1171
            |||.||||||..|.|||||.||||..|..|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.||
Sbjct 1104  TCTAAGATCAACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGG  1177

Query 1172  GGACCTACAGATGCTACAGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCTCCCCAGTGACCCCCTGGAGCTC  1245
            ||||||||||.||||||.||||||..||||||||.||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 1178  GGACCTACAGGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTC  1251

Query 1246  GTGGTCTCAG---------------------------------------------CAT----CCCT-------A  1263
            ||||||||||                                             |||    ||||       |
Sbjct 1252  GTGGTCTCAGGACCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACAACAGGCCCCACCTCCACATCTGGCCCTGAGGACCA  1325

Query 1264  GGCCAACACCCCCA-------GGAT-TACACAGTGGAGAATCT-------CATCCGCATGGG---TGTGGCTGG  1319
            |.||..||||||||       |||| ..||.|||||    |||       ||    |.||||   ||||...||
Sbjct 1326  GCCCCTCACCCCCACCGGGTCGGATCCCCAGAGTGG----TCTGGGAAGGCA----CCTGGGGGTTGTGATCGG  1391

Query 1320  ---CTTGG---------TCCTGGTGGTCCTC-----------------------------------------GG  1340
               |||||         ||||..||.|||||                                         ||
Sbjct 1392  CATCTTGGTGGCCGTCATCCTACTGCTCCTCCTCCTCCTCCTCCTCTTCCTCATCCTCCGACATCGACGTCAGG  1465

Query 1341  G---ATTCT--------------------GCT-ATTT-------------GAGGCT-------CAG----CACA  1366
            |   |..||                    ||| ||||             |.||||       |||    ||||
Sbjct 1466  GCAAACACTGGACATCGACCCAGAGAAAGGCTGATTTCCAACATCCTGCAGGGGCTGTGGGGCCAGAGCCCACA  1539

Query 1367  GCCAGAGAAGCCTACA----AGATGCAGCCGGG------------AGG--------------------------  1398
            |.|||||  ||||.||    ||.|.|||||..|            |||                          
Sbjct 1540  GACAGAG--GCCTGCAGTGGAGGTCCAGCCCAGCTGCCGATGCCCAGGAAGAAAACCTCTATGCTGCCGTGAAG  1611

Query 1399  --------------------------------------------------------------------------  1398
                                                                                      
Sbjct 1612  CACACACAGCCTGAGGATGGGGTGGAGATGGACACTCGGAGCCCACACGATGAAGACCCCCAGGCAGTGACGTA  1685

Query 1399  --------------------------------------------------------------------------  1398
                                                                                      
Sbjct 1686  TGCCGAGGTGAAACACTCCAGACCTAGGAGAGAAATGGCCTCTCCTCCTTCCCCACTGTCTGGGGAATTCCTGG  1759

Query 1399  --------------------------------------------------------------------------  1398
                                                                                      
Sbjct 1760  ACACAAAGGACAGACAGGCGGAAGAGGACAGGCAGATGGACACTGAGGCTGCTGCATCTGAAGCCCCCCAGGAT  1833

Query 1399  --------------------------------------------------------------------------  1398
                                                                                      
Sbjct 1834  GTGACCTACGCCCAGCTGCACAGCTTGACCCTCAGACGGGAGGCAACTGAGCCTCCTCCATCCCAGGAAGGGCC  1907

Query 1399  -------------------------------------------  1398
                                                       
Sbjct 1908  CTCTCCAGCTGTGCCCAGCATCTACGCCACTCTGGCCATCCAC  1950