Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07730
- Subject:
- XR_935716.2
- Aligned Length:
- 1724
- Identities:
- 1162
- Gaps:
- 438
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 TCTTCCCTATTTCCCTGCATTTCTCTTCTGTGCTCACTGCCACACGCAGCTCAGCCTGGGCGGCACAGCCAGAT 74
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 75 GCGAGATGCGTCTCTGCTGATCTGAGTCTGCCTGCAGCATGGACCTGGGTCTTCCCTGAAGCATCTCCAGGGCT 148
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 149 GGAGGGACGACTGCCATGATGACAGCACCCCATGAGAAGAAGGACCCAGCCTCCGATTGGCCACACTCTGTGTG 222
Query 1 -----------------------------------------------------------------ATGACCCCC 9
|||||||||
Sbjct 223 TCTCTCTATCCTGCCAGCACCGAGGGCTCATCCATCCACAGAGCAGGGCAGTGGGAGGAGACGCCATGACCCCC 296
Query 10 ATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCAGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAA 83
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 ATCCTCACGGTCCTGATCTGTCTCGGGCTGAGTCTGGGCCCCCGGACCCACGTGCAGGCAGGGCACCTCCCCAA 370
Query 84 GCCCACCCTCTGGGCTGAGCCAGGCTCTGTGATCATCCAGGGAAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGAGCC 157
||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 371 GCCCACCCTCTGGGCTGAACCAGGCTCTGTGATCACCCAGGGGAGTCCTGTGACCCTCAGGTGTCAGGGGGGCC 444
Query 158 TTCAGGCTGAGGAGTACCATCTATATAGGGAAAACAAATCAGCATCCTGGGTTAGACGGAT---ACAAGAGCCT 228
...||.|..|||||||||.|||||||||.|||||.|||.|||||.|||||.|||.|||||| |||.||||.|
Sbjct 445 AGGAGACCCAGGAGTACCGTCTATATAGAGAAAAGAAAACAGCACCCTGGATTACACGGATCCCACAGGAGCTT 518
Query 229 GGGAAGAATGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACGCAGGGCGGTATCACTGTCAGTACTA--- 299
|.||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.|||| |||||
Sbjct 519 GTGAAGAAGGGCCAGTTCCCCATCCCATCCATCACCTGGGAACACACAGGGCGGTATCGCTGT---TACTATGG 589
Query 300 CAGCCACAATCACT-CA------TCAGAGTACAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACAGCAAA 366
.|||.| |||| || ||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 590 TAGCGA----CACTGCAGGCCGCTCAGAGAGCAGTGACCCCCTGGAGCTGGTGGTGACAGGAGCCTACATCAAA 659
Query 367 CCCACCCTCTCAGCTCTGCCCAGCCCTGTGGTGACCTTAGGAGGGAACGTGACCCTCCAGTGTGTCTCACAGGT 440
||||||||||||||.|.|||||||||.|||||||.||.|||||||||.||.|||||||||||||.|||||||||
Sbjct 660 CCCACCCTCTCAGCCCAGCCCAGCCCCGTGGTGAACTCAGGAGGGAATGTAACCCTCCAGTGTGACTCACAGGT 733
Query 441 GGCATTTGACGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAACGCCTGAACTCCCATTCCCATG 514
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||..||||||
Sbjct 734 GGCATTTGATGGCTTCATTCTGTGTAAGGAAGGAGAAGATGAACACCCACAATGCCTGAACTCCCAGCCCCATG 807
Query 515 CCCGTGGGTGGTCCTGGGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTCGTACAGGTGCTAT 588
|||||||||.||||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 808 CCCGTGGGTCGTCCCGCGCCATCTTCTCCGTGGGCCCCGTGAGCCCGAGTCGCAGGTGGTGGTACAGGTGCTAT 881
Query 589 GCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGTGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCCAGGTGTTTC 662
|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 882 GCTTATGACTCGAACTCTCCCTATGAGTGGTCTCTACCCAGTGATCTCCTGGAGCTCCTGGTCCTAGGTGTTTC 955
Query 663 TAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATGGTGGCCCCTGGGGAGAGCCTGACCCTCCAGTGTGTCT 736
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||.||||||.||.|||||||.||
Sbjct 956 TAAGAAGCCATCACTCTCAGTGCAGCCAGGTCCTATCGTGGCCCCTGAGGAGACCCTGACTCTGCAGTGTGGCT 1029
Query 737 CTGATGTCGGCTACGACAGATTTGTTCTGTATAAGGAGGGAGAACGTGACTTCCTCCAGCGCCCTGGTTGGCAG 810
||||||..||||||.||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||.|.||||....|||
Sbjct 1030 CTGATGCTGGCTACAACAGATTTGTTCTGTATAAGGACGGGGAACGTGACTTCCTTCAGCTCGCTGGCGCACAG 1103
Query 811 CCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCCCTCCCACGGGGGCCAGTACAGATG 884
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1104 CCCCAGGCTGGGCTCTCCCAGGCCAACTTCACCCTGGGCCCTGTGAGCCGCTCCTACGGGGGCCAGTACAGATG 1177
Query 885 CTACAGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGTGACCCCCTGGACATCCTGATCACAGGACAGT 958
||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 1178 CTACGGTGCACACAACCTCTCCTCCGAGTGGTCGGCCCCCAGCGACCCCCTGGACATCCTGATC---------- 1241
Query 959 TCTATGACAGACCCTCTCTCTCGGTGCAGCCGGTCCCCACAGTAGCCCCAGGAAAGAACGTGACCCTGCTGTGT 1032
||||||||.||||||.||.|||.|||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1242 -------------------------GCAGCCGGGCCCCACGGTGGCCTCAGGAGAGAACGTGACCCTGCTGTGT 1290
Query 1033 CAGTCACGGGGGCAGTTCCACACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGGCCATCCCCCACTGCATCTGAGATC 1106
|||||||.|||...|.|.||.||||||||||||||||||||||||||||...||..||||..||.|||.|||||
Sbjct 1291 CAGTCACAGGGATGGATGCAAACTTTCCTTCTGACCAAGGAGGGGGCAGCTGATGACCCATGGCGTCTAAGATC 1364
Query 1107 AGAGCACCAAGCTCAGCAGAACCAGGCTGAATTCCGCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCACGTGGGGACCTACA 1180
|..|.|||||.||||..|..|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||
Sbjct 1365 AACGTACCAATCTCAAAAATACCAGGCTGAATTCCCCATGGGTCCTGTGACCTCAGCCCATGCGGGGACCTACA 1438
Query 1181 GATGCTACAGCTCACTCAGCTCCAACCCCTACCTGCTGTCTCTCCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCA 1254
|.||||||.||||||..||||||||.||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1439 GGTGCTACGGCTCACAGAGCTCCAAACCCTACCTGCTGACTCACCCCAGTGACCCCCTGGAGCTCGTGGTCTCA 1512
Query 1255 GCATCC--CTAGG----CCAACACCCC--CAGGATTACACAGTGGAGAATCTCATCCGCATGGGTGTGGCTGGC 1320
|.| || ||.|| |||.|.|||| || |||| |...|.|.|||.||| |||||
Sbjct 1513 GGA-CCGTCTGGGGGCCCCAGCTCCCCGACA-------ACAG----GCCCCACCTCCACAT--------CTGGC 1566
Query 1321 TTGGTCCTGGTGGTCCTCGGGATTCTGCTATTTGAGGCTCAG-----CACAGCCAGAGAAGCCTACAAGATGCA 1389
|| |||||..||| |||..|||
Sbjct 1567 -----CC-------------------------TGAGGACCAGCCCCTCACCCCCA------------------- 1591
Query 1390 GCCGGGAGG------------- 1398
|||||..|
Sbjct 1592 -CCGGGTCGGATCCCCAGAGTG 1612