Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07736
• Subject: NM_001159878.2
• Aligned Length: 1053
• Identities: 1048
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGAGGCCTTTGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCGGGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCG  74
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCCTTCGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCGGGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCG  74

Query   75  GGCCGCCATCCTCCTCTTTATCTCCGCCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAGTTGGACACTTGGTTCGATTAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCGCCATCCTCCTCTTTATCTCCGCCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAGTTGGACACTTGGTTCGATTAC  148

Query  149  CAAGAGCTTTTCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGGATCAACAAGTTTTCCAGTGAAAGCGTATGTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAGAGCTTTTCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGGATCAACAAGTTTTCCAGTGAAAGCGTATGTC  222

Query  223  ATGCTCCATCAAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAACTGATAGACCCATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGCTCCATCAAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAACTGATAGACCCATC  296

Query  297  ATTCCAATGGTATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTCAGTAGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATTCCAATGGTATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTC---AGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAA  367

Query  371  GCCTTGTATTCCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTCCTCGAATATAAACCTACTGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  GCCTTGTATTCCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTCCTCGAATATAAACCTACTGTG  441

Query  445  GAAGAAATTGTTAAACGTCTTCAACTAAAATATGCTATATATGCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATCAGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  GAAGAAATTGTTAAACGTCTTCAACTAAAATATGCTATATATGCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATCAGTT  515

Query  519  CACAGCTCGATATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATTTCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  CACAGCTCGATATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATTTCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTT  589

Query  593  TAAGCAAACTGCTTCTTGACCTTTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGCAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  TAAGCAAACTGCTTCTTGACCTTTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGCAA  663

Query  667  AGAGCTGGTTTGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  AGAGCTGGTTTGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCG  737

Query  741  ATGTACAGACCATAACTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAGGCTAAAAATCTCATAGAGAGATTTTTTAATC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  ATGTACAGACCATAACTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAGGCTAAAAATCTCATAGAGAGATTTTTTAATC  811

Query  815  AACAAGTAGAAATTCTTGGCAGACGTGCAGAACAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  812  AACAAGTAGAAATTCTTGGCAGACGTGCAGAACAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATG  885

Query  889  GTTTGGATTAATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAATGTCCTGAGTGCTGTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  GTTTGGATTAATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAATGTCCTGAGTGCTGTGT  959

Query  963  GATCTGCAGCCCTGGATCATATAACCCCCGTGATGGAATTCATTGCCTTCAATGCAATAGCAGCCTGGTGTATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  960  GATCTGCAGCCCTGGATCATATAACCCCCGTGATGGAATTCATTGCCTTCAATGCAATAGCAGCCTGGTGTATG  1033

Query 1037  GAGCAAAAACGAGCTTA  1053
            |||||||||||.|||||
Sbjct 1034  GAGCAAAAACGTGCTTA  1050