Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07736
• Subject: XM_011515103.1
• Aligned Length: 1053
• Identities: 782
• Gaps: 270

Alignment

Query    1  ATGGAGGCCTTTGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCGGGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCG  74
            |||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGAGGCCTTCGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCGGGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCG  74

Query   75  GGCCGCCATCCTCCTCTTTATCTCCGCCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAGTTGGACACTTGGTTCGATTAC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCGCCATCCTCCTCTTTATCTCCGCCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAGTTGGACACTTGGTTCGATTAC  148

Query  149  CAAGAGCTTTTCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGGATCAACAAGTTTTCCAGTGAAAGCGTATGTC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAAGAGCTTTTCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGGATCAACAAGTTTTCCAGTGAAAGCGTATGTC  222

Query  223  ATGCTCCATCAAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAACTGATAGACCCATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGCTCCATCAAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAACTGATAGACCCATC  296

Query  297  ATTCCAATGGTATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTCAGTAGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATTCCAATGGTATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTCAGTAGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAA  370

Query  371  GCCTTGTATTCCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTCCTCGAATATAAACCTACTGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCCTTGTATTCCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTCCTCGAATATAAACCTACTGTG  444

Query  445  GAAGAAATTGTTAAACGTCTTCAACTAAAATATGCTATATATGCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATCAGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GAAGAAATTGTTAAACGTCTTCAACTAAAATATGCTATATATGCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATCAGTT  518

Query  519  CACAGCTCGATATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATTTCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CACAGCTCGATATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATTTCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTT  592

Query  593  TAAGCAAACTGCTTCTTGACCTTTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGCAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TAAGCAAACTGCTTCTTGACCTTTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGCAA  666

Query  667  AGAGCTGGTTTGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAGCTGGTTTGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCG  740

Query  741  ATGTACAGACCATAACTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAGGCTAAAAATCTCATAGAGAGATTTTTTAATC  814
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                               
Sbjct  741  ATGTACAGACCATAACTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAG-------------------------------  783

Query  815  AACAAGTAGAAATTCTTGGCAGACGTGCAGAACAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATG  888
                                                                                      
Sbjct  784  --------------------------------------------------------------------------  783

Query  889  GTTTGGATTAATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAATGTCCTGAGTGCTGTGT  962
                                                                                      
Sbjct  784  --------------------------------------------------------------------------  783

Query  963  GATCTGCAGCCCTGGATCATATAACCCCCGTGATGGAATTCATTGCCTTCAATGCAATAGCAGCCTGGTGTATG  1036
                                                                                      
Sbjct  784  --------------------------------------------------------------------------  783

Query 1037  GAGCAAAAACGAGCTTA  1053
                             
Sbjct  784  -----------------  783