Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07736
Subject:
XM_024446646.1
Aligned Length:
1053
Identities:
827
Gaps:
225

Alignment

Query    1  ATGGAGGCCTTTGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCGGGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGCCGCCATCCTCCTCTTTATCTCCGCCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAGTTGGACACTTGGTTCGATTAC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  CAAGAGCTTTTCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGGATCAACAAGTTTTCCAGTGAAAGCGTATGTC  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ATGCTCCATCAAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAACTGATAGACCCATC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCTCCATCAAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAACTGATAGACCCATC  74

Query  297  ATTCCAATGGTATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTCAGTAGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ATTCCAATGGTATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTC---AGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAA  145

Query  371  GCCTTGTATTCCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTCCTCGAATATAAACCTACTGTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  146  GCCTTGTATTCCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTCCTCGAATATAAACCTACTGTG  219

Query  445  GAAGAAATTGTTAAACGTCTTCAACTAAAATATGCTATATATGCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATCAGTT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  220  GAAGAAATTGTTAAACGTCTTCAACTAAAATATGCTATATATGCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATCAGTT  293

Query  519  CACAGCTCGATATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATTTCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  294  CACAGCTCGATATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATTTCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTT  367

Query  593  TAAGCAAACTGCTTCTTGACCTTTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGCAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  368  TAAGCAAACTGCTTCTTGACCTTTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGCAA  441

Query  667  AGAGCTGGTTTGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  442  AGAGCTGGTTTGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCG  515

Query  741  ATGTACAGACCATAACTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAGGCTAAAAATCTCATAGAGAGATTTTTTAATC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  516  ATGTACAGACCATAACTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAGGCTAAAAATCTCATAGAGAGATTTTTTAATC  589

Query  815  AACAAGTAGAAATTCTTGGCAGACGTGCAGAACAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  590  AACAAGTAGAAATTCTTGGCAGACGTGCAGAACAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATG  663

Query  889  GTTTGGATTAATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAATGTCCTGAGTGCTGTGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  664  GTTTGGATTAATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAATGTCCTGAGTGCTGTGT  737

Query  963  GATCTGCAGCCCTGGATCATATAACCCCCGTGATGGAATTCATTGCCTTCAATGCAATAGCAGCCTGGTGTATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  GATCTGCAGCCCTGGATCATATAACCCCCGTGATGGAATTCATTGCCTTCAATGCAATAGCAGCCTGGTGTATG  811

Query 1037  GAGCAAAAACGAGCTTA  1053
            |||||||||||.|||||
Sbjct  812  GAGCAAAAACGTGCTTA  828