Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07736
- Subject:
- XR_001744543.1
- Aligned Length:
- 1395
- Identities:
- 1028
- Gaps:
- 351
Alignment
Query 1 ----------------------------------------------------------------ATGGAGGCCT 10
||||||||||
Sbjct 1 AGGTGGGCGCGCGTTGCCTAACGACCTTCCGCGCGGACGGTGGGCAGGCGACGGCGGCGTGTGGATGGAGGCCT 74
Query 11 TTGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCGGGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCGGGCCGCCATC 84
|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TCGCCCTTGGCCCAGCGCGGCGGGGCAGGCGGCGGACCCGGGCCGCCGGCTCCCTGCTCTCTCGGGCCGCCATC 148
Query 85 CTCCTCTTTATCTCCGCCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAGTTGGACACTTGGTTCGATTACCAAGAGCTTT 158
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CTCCTCTTTATCTCCGCCTTCCTGGTGCGGGTGCCCTCATCAGTTGGACACTTGGTTCGATTACCAAGAGCTTT 222
Query 159 TCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGGATCAACAAGTTTTCCAGTGAAAGCGTATGTCATGCTCCATC 232
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TCGCTTGACCAAAGATTCAGTGAAAATAGTGGGATCAACAAGTTTTCCAGTGAAAGCGTATGTCATGCTCCATC 296
Query 233 AAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAACTGATAGACCCATCATTCCAATGG 306
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAAAGAGTCCACACGTGTTATGTGTAACGCAACAACTGCGAAATGCTGAACTGATAGACCCATCATTCCAATGG 370
Query 307 TATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTCAGTAGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAAGCCTTGTATT 380
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 TATGGGCCTAAAGGAAAAGTTGTTTCAGTAGAAAACCGCACTGCACAAATAACATCCACAGGAAGCCTTGTATT 444
Query 381 CCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTCCTCGAATATAAACCTACTGTGGAAGAAATTG 454
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CCAAAATTTTGAGGAGAGTATGAGTGGAATTTATACATGTTTCCTCGAATATAAACCTACTGTGGAAGAAATTG 518
Query 455 TTAAACGTCTTCAACTAAAATATGCTATATATGCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATCAGTTCACAGCTCGA 528
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TTAAACGTCTTCAACTAAAATATGCTATATATGCTTATCGTGAGCCTCATTATTATTATCAGTTCACAGCTCGA 592
Query 529 TATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATTTCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTTTAAGCAAACT 602
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TATCATGCAGCTCCCTGCAATAGCATTTATAATATTTCTTTTGAGAAGAAACTTCTTCAGATTTTAAGCAAACT 666
Query 603 GCTTCTTGACCTTTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGCAAAGAGCTGGTT 676
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTTCTTGACCTTTCATGTGAAATTTCCTTACTTAAGTCTGAATGCCATCGCGTTAAAATGCAAAGAGCTGGTT 740
Query 677 TGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCGATGTACAGAC 750
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TGCAAAATGAATTGTTCTTTGCATTTTCAGTTTCATCTCTAGACACTGAAAAAGGACCCAAGCGATGTACAGAC 814
Query 751 CATAACTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAGGCTAAAAATCTCATAGAGAGATTTTTTAATCAACAAGTAGA 824
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 CATAACTGTGAACCTTACAAAAGACTTTTTAAGGCTAAAAATCTCATAGAGAGATTTTTTAATCAACAAGTAGA 888
Query 825 AATTCTTGGCAGACGTGCAGAACAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATGGTTTGGATTA 898
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 AATTCTTGGCAGACGTGCAGAACAATTACCTCAAATATACTATATTGAAGGTACTCTCCAAATGGTTTGGATTA 962
Query 899 ATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAATGTCCTGAGTGCTGTG----------- 961
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATCGCTGCTTTCCAGGATATGGAATGAATGTCCAGCAACATCCAAAATGTCCTGAGTGCTGTGTAGTTGGGACT 1036
Query 962 -------TGATCT----------------------GCAGCCCTGGATCAT-------ATAACCCCCGTGATGGA 999
||||.| .||||| |.|| .|||.||..||| |||
Sbjct 1037 TCCACTATGATGTTGAAAGGAAATGAAGAAAGGAGACAGCC-----TTATTTTGTTCCTAATCCTGGTG--GGA 1103
Query 1000 A---TTCA--TTGCCTTCAA---------TGCA----------------------------------------- 1018
| |||| ||.| |||| ||||
Sbjct 1104 AAGCTTCAAGTTTC--TCAACAGACCTCCTGCAGAGCCCCTGTCCATCTCCTTGTGCCTAAGCTACCACTCCTT 1175
Query 1019 --ATAG---CAG-----CCTGG--TGTATGGA--------GCAAAAACGAG----CTTA--------------- 1053
|||| ||| |.||| |.||.||| |.|.|.|.||| ||||
Sbjct 1176 CCATAGTTCCAGGAATACTTGGCTTATAAGGATGCCACAGGAAGACAGGAGGCCTCTTACACTGGATGTGAAGC 1249
Query 1054 -------------------------------------------------------------------------- 1053
Sbjct 1250 TATGTCATGGCACTGGCCAGTTTTGTTCATCTTGGACTCACCAATGGAACTGGCAGATGGCAGATGTCAAAAAT 1323
Query 1054 --------------------------------------------------------------- 1053
Sbjct 1324 GTCCCACAGGGCTGGAGCCCTGCATGTAGTTCTGGGAGCAGCAACAGTGGACAGCTGTTAAGA 1386