Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07740
• Subject: XM_006518663.3
• Aligned Length: 1014
• Identities: 859
• Gaps: 18

Alignment

Query    1  ATGACAGAGAACTCCGACAAAGTTCCCATTGCCCTGGTGGGACCTGATGACGTGGAATTCTGCAGCCCCCCGGC  74
            ||||||||||||||.|||||||||||.||..||.||||.||.|||||.|||||.||.||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGACAGAGAACTCAGACAAAGTTCCTATCACCATGGTAGGGCCTGAGGACGTTGAGTTTTGCAGTCCCCCGGC  74

Query   75  GTACGCTACGCTGACGGTGAAGCCCTCC---AGCCCCGCGCGGCTGCTCAAGGTGGGAGCCGTGGTCCTCATTT  145
            ||||.|.||..|.||.||||||||||||   |||||..|.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  GTACACCACCGTCACCGTGAAGCCCTCCGGGAGCCCAACACGGCTGCTCAAGGTAGGAGCTGTGGTCCTCATTT  148

Query  146  CGGGAGCTGTGCTGCTGCTCTTTGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAGCGACAGTCACATTTAC  219
            |.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||.||||||||||
Sbjct  149  CTGGCGCGGTACTGCTGCTCTTCGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAATGACAATCACATTTAC  222

Query  220  AATGTCCATTACACCATGAGTATCAATGGGAAATTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGACGCTGGGAACAACTT  293
            |||||.|||||||..||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||||
Sbjct  223  AATGTTCATTACAGTATGAGTATCAATGGGAAACTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGATGCTGTGAACAACTT  296

Query  294  GGAGACCTTTAAAATGGGAAGTGGAGCTGAAGAAGCAATTGCAGTTAATGATTTCCAGAATGGCATCACAGGAA  367
            |||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||.|||.||.|||||..|.|||||||||||.||.|
Sbjct  297  GGAGACCTTTAAAATGGGAAGCGGAGCGGAAGAAGCAATTGAAGTCAACGATTTTAAAAATGGCATCACTGGGA  370

Query  368  TTCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATTAAAGCGCAAGTGAAGGCTCGTATTCCTGAGGTGGGCGCCGTG  441
            |.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.||.||||||||||||.|.|||
Sbjct  371  TCCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATCAAAGCACAGGTGAAGGCTCGCATCCCTGAGGTGGGCACAGTG  444

Query  442  ACCAAACAGAGCATCTCCTCCAAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGTCAAATATGAAGAAAATTCTCTTATCTG  515
            |||||.||||||||   |||..||||||||||||||||||||||||..||.||.|||||.||.||.||.||.||
Sbjct  445  ACCAAGCAGAGCAT---CTCTGAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGCTAACTACGAAGAGAACTCGCTGATTTG  515

Query  516  GGTGGCTGTAGATCAGCCTGTGAAGGACAACAGCTTCTTGAGTTCTAAGGTGTTAGAACTCTGCGGTGACCTTC  589
            ||||||.||.||.||||||||||||||||.||||||||||||.|||||..|..|.||||||||.||.|||||.|
Sbjct  516  GGTGGCCGTGGACCAGCCTGTGAAGGACAGCAGCTTCTTGAGCTCTAAAATCCTTGAACTCTGTGGCGACCTGC  589

Query  590  CTATTTTCTGGCTTAAACCAACCTATCCAAA------------AGAAATCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGTGGTA  651
            |.||||||||||||||.||.|..||||||||            ||||||||||||.||.|||||||||||.||.
Sbjct  590  CGATTTTCTGGCTTAAGCCCATGTATCCAAAAGCAAATTTCGCAGAAATCCAGAGAGAGAGAAGAGAAGTCGTG  663

Query  652  AGAAAAATTGTTCCAACTACCACAAAAAGACCACACAGTGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCTGGAAGACTGAA  725
            |||||.|.||.|||..|||||||||.||||||||||||.|.|||.||..|.|||.|||||.||||||||||||.
Sbjct  664  AGAAACAGTGCTCCCTCTACCACAAGAAGACCACACAGCGAACCTCGAGGTAACGCAGGCCCTGGAAGACTGAG  737

Query  726  TAATGAAACCAGACCCAGTGTTCAAGAGGACTCACAAGCCTTCAATCCTGATAATCCTTATCATCAGGAAGGGG  799
            |||.|.|||||||||||.||||||.||.|||.||.||.|.|||||.|||||.||||||||.||.||||||||.|
Sbjct  738  TAACGGAACCAGACCCAATGTTCAGGACGACGCAGAACCTTTCAACCCTGACAATCCTTACCACCAGGAAGGAG  811

Query  800  AAAGCATGACATTCGACCCTAGACTGGATCACGAAGGAATCTGTTGTATAGAATGTAGGCGGAGCTACACCCAC  873
            |||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct  812  AAAGCATGACATTTGACCCTAGACTGGACCATGAAGGGATCTGCTGTATAGAATGCAGGCGGAGCTACACCCAC  885

Query  874  TGCCAGAAGATCTGTGAACCCCTGGGGGGCTATTACCCATGGCCTTATAATTATCAAGGCTGCCGTTCGGCCTG  947
            ||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||
Sbjct  886  TGCCAGAAGATCTGTGAACCACTGGGAGGCTACTATCCATGGCCTTACAATTACCAAGGATGCCGCTCGGCCTG  959

Query  948  CAGAGTCATCATGCCATGTAGCTGGTGGGTGGCCCGTATCTTAGGCATGGTA  999
            |||||||.||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||.
Sbjct  960  CAGAGTCGTCATGCCATGCAGCTGGTGGGTGGCCCGCATCTTGGGCATGGTG  1011