Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07740
• Subject: XM_011534898.2
• Aligned Length: 1092
• Identities: 997
• Gaps: 93

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCCTGCACGTCGGGGCAGCGGGACAGATCCCAGGGTGCCCAGGGAGTCTCCAAGTGCCTCACTCCTCCCGC  74

Query    1  -------ATGACAGAGAACTCCGACAAAGTTCCCATTGCCCTGGTGGGACCTGATGACGTGGAATTCTGCAGCC  67
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCAAACATGACAGAGAACTCCGACAAAGTTCCCATTGCCCTGGTGGGACCTGATGACGTGGAATTCTGCAGCC  148

Query   68  CCCCGGCGTACGCTACGCTGACGGTGAAGCCCTCCAGCCCCGCGCGGCTGCTCAAGGTGGGAGCCGTGGTCCTC  141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCCGGCGTACGCTACGCTGACGGTGAAGCCCTCCAGCCCCGCGCGGCTGCTCAAGGTGGGAGCCGTGGTCCTC  222

Query  142  ATTTCGGGAGCTGTGCTGCTGCTCTTTGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAGCGACAGTCACAT  215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTTCGGGAGCTGTGCTGCTGCTCTTTGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAGCGACAGTCACAT  296

Query  216  TTACAATGTCCATTACACCATGAGTATCAATGGGAAATTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGACGCTGGGAACA  289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTACAATGTCCATTACACCATGAGTATCAATGGGAAATTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGACGCTGGGAACA  370

Query  290  ACTTGGAGACCTTTAAAATGGGAAGTGGAGCTGAAGAAGCAATTGCAGTTAATGATTTCCAGAATGGCATCACA  363
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTTGGAGACCTTTAAAATGGGAAGTGGAGCTGAAGAAGCAATTGCAGTTAATGATTTCCAGAATGGCATCACA  444

Query  364  GGAATTCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATTAAAGCGCAAGTGAAGGCTCGTATTCCTGAGGTGGGCGC  437
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGAATTCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATTAAAGCGCAAGTGAAGGCTCGTATTCCTGAGGTGGGCGC  518

Query  438  CGTGACCAAACAGAGCATCTCCTCCAAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGTCAAATATGAAGAAAATTCTCTTA  511
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CGTGACCAAACAGAGCATCTCCTCCAAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGTCAAATATGAAGAAAATTCTCTTA  592

Query  512  TCTGGGTGGCTGTAGATCAGCCTGTGAAGGACAACAGCTTCTTGAGTTCTAAGGTGTTAGAACTCTGCGGTGAC  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTGGGTGGCTGTAGATCAGCCTGTGAAGGACAACAGCTTCTTGAGTTCTAAGGTGTTAGAACTCTGCGGTGAC  666

Query  586  CTTCCTATTTTCTGGCTTAAACCAACCTATCCAAA------------AGAAATCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGT  647
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTCCTATTTTCTGGCTTAAACCAACCTATCCAAAAGAAATTTTTGCAGAAATCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGT  740

Query  648  GGTAAGAAAAATTGTTCCAACTACCACAAAAAGACCACACAGTGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCTGGAAGAC  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGTAAGAAAAATTGTTCCAACTACCACAAAAAGACCACACAGTGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCTGGAAGAC  814

Query  722  TGAATAATGAAACCAGACCCAGTGTTCAAGAGGACTCACAAGCCTTCAATCCTGATAATCCTTATCATCAGGAA  795
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGAATAATGAAACCAGACCCAGTGTTCAAGAGGACTCACAAGCCTTCAATCCTGATAATCCTTATCATCAGGAA  888

Query  796  GGGGAAAGCATGACATTCGACCCTAGACTGGATCACGAAGGAATCTGTTGTATAGAATGTAGGCGGAGCTACAC  869
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GGGGAAAGCATGACATTCGACCCTAGACTGGATCACGAAGGAATCTGTTGTATAGAATGTAGGCGGAGCTACAC  962

Query  870  CCACTGCCAGAAGATCTGTGAACCCCTGGGGGGCTATTACCCATGGCCTTATAATTATCAAGGCTGCCGTTCGG  943
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CCACTGCCAGAAGATCTGTGAACCCCTGGGGGGCTATTACCCATGGCCTTATAATTATCAAGGCTGCCGTTCGG  1036

Query  944  CCTGCAGAGTCATCATGCCATGTAGCTGGTGGGTGGCCCGTATCTTAGGCATGGTA  999
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 1037  CCTGCAGAGTCATCATGCCATGTAGCTGGTGGGTGGCCCGTATCTTGGGCATGGTG  1092