Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07740
• Subject: XM_011534899.2
• Aligned Length: 1095
• Identities: 883
• Gaps: 210

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGCCCTGCACGTCGGGGCAGCGGGACAGATCCCAGGGTGCCCAGGGAGTCTCCAAGTGCCTCACTCCTCCCGC  74

Query    1  -------ATGACAGAGAACTCCGACAAAGTTCCCATTGCCCTGGTGGGACCTGATGACGTGGAATTCTGCAGCC  67
                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  CGCAAACATGACAGAGAACTCCGACAAAGTTCCCATTGCCCTGGTGGGACCTGATGACGTGGAATTCTGCAGCC  148

Query   68  CCCCGGCGTACGCTACGCTGACGGTGAAGCCCTCCAGCCCCGCGCGGCTGCTCAAGGTGGGAGCCGTGGTCCTC  141
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CCCCGGCGTACGCTACGCTGACGGTGAAGCCCTCCAGCCCCGCGCGGCTGCTCAAGGTGGGAGCCGTGGTCCTC  222

Query  142  ATTTCGGGAGCTGTGCTGCTGCTCTTTGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAGCGACAGTCACAT  215
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATTTCGGGAGCTGTGCTGCTGCTCTTTGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAGCGACAGTCACAT  296

Query  216  TTACAATGTCCATTACACCATGAGTATCAATGGGAAATTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGACGCTGGGAACA  289
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTACAATGTCCATTACACCATGAGTATCAATGGGAAATTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGACGCTGGGAACA  370

Query  290  ACTTGGAGACCTTTAAAATGGGAAGTGGAGCTGAAGAAGCAATTGCAGTTAATGATTTCCAGAATGGCATCACA  363
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||         
Sbjct  371  ACTTGGAGACCTTTAAAATGGGAAGTGGAGCTGAAGAAGCAATTGCAGTTAATGATTTCCAGAAT---------  435

Query  364  GGAATTCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATTAAAGCGCAAGTGAAGGCTCGTATTCCTGAGGTGGGCGC  437
                                                                                      
Sbjct  436  --------------------------------------------------------------------------  435

Query  438  CGTGACCAAACAGAGCATCTCCTCCAAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGTCAAATATGAAGAAAATTCTCTTA  511
                                           |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  436  -------------------------------GAAGGCAAGATCATGCCAGTCAAATATGAAGAAAATTCTCTTA  478

Query  512  TCTGGGTGGCTGTAGATCAGCCTGTGAAGGACAACAGCTTCTTGAGTTCTAAGGTGTTAGAACTCTGCGGTGAC  585
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  479  TCTGGGTGGCTGTAGATCAGCCTGTGAAGGACAACAGCTTCTTGAGTTCTAAGGTGTTAGAACTCTGCGGTGAC  552

Query  586  CTTCCTATTTTCTGGCTTAAACCAACCTATCCAAA------------AGAAATCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGT  647
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||            |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  553  CTTCCTATTTTCTGGCTTAAACCAACCTATCCAAAAGAAATTTTTGCAGAAATCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGT  626

Query  648  GGTAAGAAAAATTGTTCCAACTACCACAAAAAGACCACACAGTGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCTGGAAGAC  721
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  627  GGTAAGAAAAATTGTTCCAACTACCACAAAAAGACCACACAGTGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCTGGAAGAC  700

Query  722  TGAATAATGAAACCAGACCCAGTGTTCAAGAGGACTCACAAGCCTTCAATCCTGATAATCCTTATCAT---CAG  792
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||
Sbjct  701  TGAATAATGAAACCAGACCCAGTGTTCAAGAGGACTCACAAGCCTTCAATCCTGATAATCCTTATCATCAGCAG  774

Query  793  GAAGGGGAAAGCATGACATTCGACCCTAGACTGGATCACGAAGGAATCTGTTGTATAGAATGTAGGCGGAGCTA  866
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  775  GAAGGGGAAAGCATGACATTCGACCCTAGACTGGATCACGAAGGAATCTGTTGTATAGAATGTAGGCGGAGCTA  848

Query  867  CACCCACTGCCAGAAGATCTGTGAACCCCTGGGGGGCTATTACCCATGGCCTTATAATTATCAAGGCTGCCGTT  940
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  849  CACCCACTGCCAGAAGATCTGTGAACCCCTGGGGGGCTATTACCCATGGCCTTATAATTATCAAGGCTGCCGTT  922

Query  941  CGGCCTGCAGAGTCATCATGCCATGTAGCTGGTGGGTGGCCCGTATCTTAGGCATGGTA  999
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct  923  CGGCCTGCAGAGTCATCATGCCATGTAGCTGGTGGGTGGCCCGTATCTTGGGCATGGTG  981