Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07740
- Subject:
- XM_011534900.2
- Aligned Length:
- 1083
- Identities:
- 883
- Gaps:
- 198
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 ATGCCCTGCACGTCGGGGCAGCGGGACAGATCCCAGGGTGCCCAGGGAGTCTCCAAGTGCCTCACTCCTCCCGC 74
Query 1 -------ATGACAGAGAACTCCGACAAAGTTCCCATTGCCCTGGTGGGACCTGATGACGTGGAATTCTGCAGCC 67
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CGCAAACATGACAGAGAACTCCGACAAAGTTCCCATTGCCCTGGTGGGACCTGATGACGTGGAATTCTGCAGCC 148
Query 68 CCCCGGCGTACGCTACGCTGACGGTGAAGCCCTCCAGCCCCGCGCGGCTGCTCAAGGTGGGAGCCGTGGTCCTC 141
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 CCCCGGCGTACGCTACGCTGACGGTGAAGCCCTCCAGCCCCGCGCGGCTGCTCAAGGTGGGAGCCGTGGTCCTC 222
Query 142 ATTTCGGGAGCTGTGCTGCTGCTCTTTGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAGCGACAGTCACAT 215
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATTTCGGGAGCTGTGCTGCTGCTCTTTGGGGCCATCGGGGCCTTCTACTTCTGGAAGGGGAGCGACAGTCACAT 296
Query 216 TTACAATGTCCATTACACCATGAGTATCAATGGGAAATTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGACGCTGGGAACA 289
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTACAATGTCCATTACACCATGAGTATCAATGGGAAATTACAAGATGGGTCAATGGAAATAGACGCTGGGAACA 370
Query 290 ACTTGGAGACCTTTAAAATGGGAAGTGGAGCTGAAGAAGCAATTGCAGTTAATGATTTCCAGAATGGCATCACA 363
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACTTGGAGACCTTTAAAATGGGAAGTGGAGCTGAAGAAGCAATTGCAGTTAATGATTTCCAGAAT--------- 435
Query 364 GGAATTCGTTTTGCTGGAGGAGAGAAGTGCTACATTAAAGCGCAAGTGAAGGCTCGTATTCCTGAGGTGGGCGC 437
Sbjct 436 -------------------------------------------------------------------------- 435
Query 438 CGTGACCAAACAGAGCATCTCCTCCAAACTGGAAGGCAAGATCATGCCAGTCAAATATGAAGAAAATTCTCTTA 511
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 436 -------------------------------GAAGGCAAGATCATGCCAGTCAAATATGAAGAAAATTCTCTTA 478
Query 512 TCTGGGTGGCTGTAGATCAGCCTGTGAAGGACAACAGCTTCTTGAGTTCTAAGGTGTTAGAACTCTGCGGTGAC 585
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 479 TCTGGGTGGCTGTAGATCAGCCTGTGAAGGACAACAGCTTCTTGAGTTCTAAGGTGTTAGAACTCTGCGGTGAC 552
Query 586 CTTCCTATTTTCTGGCTTAAACCAACCTATCCAAAAGAAATCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGTGGTAAGAAAAAT 659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 553 CTTCCTATTTTCTGGCTTAAACCAACCTATCCAAAAGAAATCCAGAGGGAAAGAAGAGAAGTGGTAAGAAAAAT 626
Query 660 TGTTCCAACTACCACAAAAAGACCACACAGTGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCTGGAAGACTGAATAATGAAA 733
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 627 TGTTCCAACTACCACAAAAAGACCACACAGTGGACCACGGAGCAACCCAGGCGCTGGAAGACTGAATAATGAAA 700
Query 734 CCAGACCCAGTGTTCAAGAGGACTCACAAGCCTTCAATCCTGATAATCCTTATCAT---CAGGAAGGGGAAAGC 804
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||
Sbjct 701 CCAGACCCAGTGTTCAAGAGGACTCACAAGCCTTCAATCCTGATAATCCTTATCATCAGCAGGAAGGGGAAAGC 774
Query 805 ATGACATTCGACCCTAGACTGGATCACGAAGGAATCTGTTGTATAGAATGTAGGCGGAGCTACACCCACTGCCA 878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 775 ATGACATTCGACCCTAGACTGGATCACGAAGGAATCTGTTGTATAGAATGTAGGCGGAGCTACACCCACTGCCA 848
Query 879 GAAGATCTGTGAACCCCTGGGGGGCTATTACCCATGGCCTTATAATTATCAAGGCTGCCGTTCGGCCTGCAGAG 952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 849 GAAGATCTGTGAACCCCTGGGGGGCTATTACCCATGGCCTTATAATTATCAAGGCTGCCGTTCGGCCTGCAGAG 922
Query 953 TCATCATGCCATGTAGCTGGTGGGTGGCCCGTATCTTAGGCATGGTA 999
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.
Sbjct 923 TCATCATGCCATGTAGCTGGTGGGTGGCCCGTATCTTGGGCATGGTG 969