Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07754
- Subject:
- NM_001197046.1
- Aligned Length:
- 1201
- Identities:
- 986
- Gaps:
- 68
Alignment
Query 1 ATGGCGGCGACGGCGGCCGCAGTGGTGGCCGAGGAGGACACGGAGCTGCGGGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA 74
|||||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCGACTACCGCCGCGGTGGTGGCCGAGGAAGACACGGAGCTGCGCGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA 74
Query 75 GAACAGCGGGGTCCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCCGAGCAGCTGTGTTTTTAGCACTAGAGGAGCAAGAAA 148
|||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct 75 GAACAGCGGCGTGCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCAGAGCGGCTGTGTTTTTAGCACTAGAAGAACAAGAAA 148
Query 149 AAGTAGAGAACAAAACTCCTTTAGTTAATGAGAGCCTGAGAAAGTTTTTAAATACCAAAGACGGTCGTTTAGTG 222
|||||||||||||||||||.||.||.|||||||.|.|||.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 149 AAGTAGAGAACAAAACTCCATTGGTCAATGAGAACTTGAAAAAGTTTTTAAACACAAAAGATGGTCGTTTAGTG 222
Query 223 GCTAGTCTTGTTGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAACCTTGACTTTACTTTGGCTGTTTTTCAACCTGAAACTAG 296
||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct 223 GCTAGTCTCGTCGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAATCTTGACTTCACCTTGGCTGTTTTCCATCCTGAAACTAG 296
Query 297 CACACTGCAAGGTCTCGAAGGTCGAGAGAATTTAGCCCGAGATTTAGGTATAATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG 370
||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||||..||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CACAATTCAAGGTCTTGAAGGTCGAGAGAACTTGGCCCAGGATTTAGGCATCATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG 370
Query 371 GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATCAGGCGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGGCCAACCACTGGGGAAGGTGCA 444
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||..|||.||.||||||||||
Sbjct 371 GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATTAGACGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGACCGGCCAGTGTGGAAGGTGCA 444
Query 445 CTTGATCTATCTGATGTACATTCTCCACCAAAGTCACCAGAGGGAAAAACAAGTGCACAGACAACACCAAGTAA 518
||.||||||||.||||.||||.|||||.||||||||||.||.||||||.||||||||.|..|.||.||||||||
Sbjct 445 CTGGATCTATCCGATGGACATCCTCCATCAAAGTCACCTGAAGGAAAATCAAGTGCAAACTCCACCCCAAGTAA 518
Query 519 G-------------AAGGCCAA--------------------------------TGA---------------TG 532
| ||||.||| ||| ||
Sbjct 519 GATACCAAGGTATAAAGGACAAGGTAAGAAGAAGACAATCGGTCAGAAGCCTGGTGACAAGAAGACTAGCAGTG 592
Query 533 AGGCCAATCAGAGTGATACAAGTGTCTCCTTGTCAGAACCCAAGAGCAAAAGCAGCCTTCACTTACTGTCCCAT 606
||.|||.|||||||||..|||||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||.||||.||||.|||||
Sbjct 593 AGACCAGTCAGAGTGAGCCAAGTGTCTCCTTGTCAGAGTCCAAGAGTAAAAGCAGCCTGCACTCACTGGCCCAT 666
Query 607 GAAACAAAAATTGGATCTTTTCTAAGCAACAGAACTTTAGATGGCAAAGACAAAGC--TGGCCTTTGTCCAGAT 678
||.||||.|||||.||||||..||||||.|||..||.||||||.||.|||| ||| ||.|||||||||||||
Sbjct 667 GAGACAAGAATTGCATCTTTCTTAAGCAGCAGCGCTGTAGATGCCAGAGAC--AGCAGTGCCCTTTGTCCAGAT 738
Query 679 GAAGATGATATGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAGCCAGAGAAAACTTACGGTTTGAGGAA 752
|..||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||.|||...
Sbjct 739 GGGGATGATGTGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAACCAGAAAAAACCTATGGTTGGAGAGC 812
Query 753 TGAACCTAGGAAGCAAGCAGGAAGTCTGGCCTCGCTCTCGGATGCA--CCCCCCTTAAAAAGTGGACTCAGCTC 824
|||||||.|||||||||..|||.||||||||||.||.||.|| || ||||.|||||..||.||.||||||||
Sbjct 813 TGAACCTCGGAAGCAAGTGGGAGGTCTGGCCTCACTGTCTGA--CAAGCCCCACTTAAGGAGCGGTCTCAGCTC 884
Query 825 CCTGGCGGGAGCCCCTTCTTTAAAAGACTCTGAGAGTAAAAGGGGAAATACAGTTTTGAAAGATCTGAAATTGA 898
||||||.||||||||.||..|||.|||..|.||||||||||||||||..||.||..||||.||||||||||||.
Sbjct 885 CCTGGCCGGAGCCCCATCGCTAACAGATCCAGAGAGTAAAAGGGGAAGCACCGTCCTGAAGGATCTGAAATTGG 958
Query 899 TCAGTGATAAAATTGGATCACTTGGATTAGGAACTGGAGAAGATGATGACTATGTTGATGATTTTAATAGTACC 972
|..||||.||.||||||||||||||..||||.||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||.|.
Sbjct 959 TTGGTGAGAAGATTGGATCACTTGGGCTAGGCACTGGAGAAGATGAGGACTATGCTGATGATTTTAATAGTGCT 1032
Query 973 AGCCATCGCTCAGAGAAAAGTGAGATAAGTATTGGTGAAGAGATAGAAGAAGACCTTTCTGTGGAAATAGATGA 1046
||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||..|||.|.||||.||
Sbjct 1033 AGCCATCGCTCAGAAAAAAGTGAGCTAAGTATTGGTGAAGAGATTGAAGAAGACCTTTCCATGGGAGTAGAGGA 1106
Query 1047 CATCAATACCAGTGATAAGCTTGATGACCTCACACAAGATCTGACTGTATCCCAGCTCAGTGATGTTGCGGATT 1120
|...||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|
Sbjct 1107 CGGGAACACCAGTGATAAACTCGATGACCTCACACAAGACCTGACTGTTTCCCAGCTCAGTGATGTTGCTGACT 1180
Query 1121 ATCTGGAAGATGTTGCA 1137
|||||||||||||||||
Sbjct 1181 ATCTGGAAGATGTTGCA 1197