Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07754
• Subject: NM_007045.4
• Aligned Length: 1197
• Identities: 1135
• Gaps: 60

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGACGGCGGCCGCAGTGGTGGCCGAGGAGGACACGGAGCTGCGGGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGACGGCGGCCGCAGTGGTGGCCGAGGAGGACACGGAGCTGCGGGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA  74

Query   75  GAACAGCGGGGTCCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCCGAGCAGCTGTGTTTTTAGCACTAGAGGAGCAAGAAA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GAACAGCGGGGTCCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCCGAGCAGCTGTGTTTTTAGCACTAGAGGAGCAAGAAA  148

Query  149  AAGTAGAGAACAAAACTCCTTTAGTTAATGAGAGCCTGAGAAAGTTTTTAAATACCAAAGACGGTCGTTTAGTG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AAGTAGAGAACAAAACTCCTTTAGTTAATGAGAGCCTGAAAAAGTTTTTAAATACCAAAGACGGTCGTTTAGTG  222

Query  223  GCTAGTCTTGTTGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAACCTTGACTTTACTTTGGCTGTTTTTCAACCTGAAACTAG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTAGTCTTGTTGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAACCTTGACTTTACTTTGGCTGTTTTTCAACCTGAAACTAG  296

Query  297  CACACTGCAAGGTCTCGAAGGTCGAGAGAATTTAGCCCGAGATTTAGGTATAATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACACTGCAAGGTCTCGAAGGTCGAGAGAATTTAGCCCGAGATTTAGGTATAATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG  370

Query  371  GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATCAGGCGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGGCCAACCACTGGGGAAGGTGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATCAGGCGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGGCCAACCACTGGGGAAGGTGCA  444

Query  445  CTTGATCTATCTGATGTACATTCTCCACCAAAGTCACCAGAGGGAAAAACAAGTGCACAGACAACACCAAGT--  516
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  
Sbjct  445  CTTGATCTATCTGATGTACATTCTCCACCAAAGTCACCAGAGGGAAAAACAAGTGCACAGACAACACCAAGTAA  518

Query  517  ----------------------------------------------------------AAGAAGGCCAATGATG  532
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct  519  GATACCAAGGTATAAAGGACAAGGTAAGAAGAAGACAAGCGGGCAGAAGGCTGGTGACAAGAAGGCCAATGATG  592

Query  533  AGGCCAATCAGAGTGATACAAGTGTCTCCTTGTCAGAACCCAAGAGCAAAAGCAGCCTTCACTTACTGTCCCAT  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGGCCAATCAGAGTGATACAAGTGTCTCCTTGTCAGAACCCAAGAGCAAAAGCAGCCTTCACTTACTGTCCCAT  666

Query  607  GAAACAAAAATTGGATCTTTTCTAAGCAACAGAACTTTAGATGGCAAAGACAAAGCTGGCCTTTGTCCAGATGA  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GAAACAAAAATTGGATCTTTTCTAAGCAACAGAACTTTAGATGGCAAAGACAAAGCTGGCCTTTGTCCAGATGA  740

Query  681  AGATGATATGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAGCCAGAGAAAACTTACGGTTTGAGGAATG  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  741  AGATGATATGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAGCCAGAGAAAACTTACGGTTTGAGGAAGG  814

Query  755  AACCTAGGAAGCAAGCAGGAAGTCTGGCCTCGCTCTCGGATGCACCCCCCTTAAAAAGTGGACTCAGCTCCCTG  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AACCTAGGAAGCAAGCAGGAAGTCTGGCCTCGCTCTCGGATGCACCCCCCTTAAAAAGTGGACTCAGCTCCCTG  888

Query  829  GCGGGAGCCCCTTCTTTAAAAGACTCTGAGAGTAAAAGGGGAAATACAGTTTTGAAAGATCTGAAATTGATCAG  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCGGGAGCCCCTTCTTTAAAAGACTCTGAGAGTAAAAGGGGAAATACAGTTTTGAAAGATCTGAAATTGATCAG  962

Query  903  TGATAAAATTGGATCACTTGGATTAGGAACTGGAGAAGATGATGACTATGTTGATGATTTTAATAGTACCAGCC  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGATAAAATTGGATCACTTGGATTAGGAACTGGAGAAGATGATGACTATGTTGATGATTTTAATAGTACCAGCC  1036

Query  977  ATCGCTCAGAGAAAAGTGAGATAAGTATTGGTGAAGAGATAGAAGAAGACCTTTCTGTGGAAATAGATGACATC  1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  ATCGCTCAGAGAAAAGTGAGATAAGTATTGGTGAAGAGATAGAAGAAGACCTTTCTGTGGAAATAGATGACATC  1110

Query 1051  AATACCAGTGATAAGCTTGATGACCTCACACAAGATCTGACTGTATCCCAGCTCAGTGATGTTGCGGATTATCT  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AATACCAGTGATAAGCTTGATGACCTCACACAAGATCTGACTGTATCCCAGCTCAGTGATGTTGCGGATTATCT  1184

Query 1125  GGAAGATGTTGCA  1137
            |||||||||||||
Sbjct 1185  GGAAGATGTTGCA  1197