Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07754
• Subject: XM_006523355.2
• Aligned Length: 1198
• Identities: 986
• Gaps: 65

Alignment

Query    1  ATGGCGGCGACGGCGGCCGCAGTGGTGGCCGAGGAGGACACGGAGCTGCGGGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA  74
            |||||||||||..|.|||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGCGACTACCGCCGCGGTGGTGGCCGAGGAAGACACGGAGCTGCGCGACCTGCTGGTGCAGACGCTGGA  74

Query   75  GAACAGCGGGGTCCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCCGAGCAGCTGTGTTTTTAGCACTAGAGGAGCAAGAAA  148
            |||||||||.||.||||||||||||||||||||||||.||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||
Sbjct   75  GAACAGCGGCGTGCTGAACCGCATCAAGGCTGAACTCAGAGCGGCTGTGTTTTTAGCACTAGAAGAACAAGAAA  148

Query  149  AAGTAGAGAACAAAACTCCTTTAGTTAATGAGAGCCTGAGAAAGTTTTTAAATACCAAAGACGGTCGTTTAGTG  222
            |||||||||||||||||||.||.||.|||||||.|.|||.||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct  149  AAGTAGAGAACAAAACTCCATTGGTCAATGAGAACTTGAAAAAGTTTTTAAACACAAAAGATGGTCGTTTAGTG  222

Query  223  GCTAGTCTTGTTGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAACCTTGACTTTACTTTGGCTGTTTTTCAACCTGAAACTAG  296
            ||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||.|||||||||||
Sbjct  223  GCTAGTCTCGTCGCAGAATTTCTTCAGTTTTTTAATCTTGACTTCACCTTGGCTGTTTTCCATCCTGAAACTAG  296

Query  297  CACACTGCAAGGTCTCGAAGGTCGAGAGAATTTAGCCCGAGATTTAGGTATAATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG  370
            ||||.|.||||||||.||||||||||||||.||.||||..||||||||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CACAATTCAAGGTCTTGAAGGTCGAGAGAACTTGGCCCAGGATTTAGGCATCATTGAAGCAGAAGGTACTGTGG  370

Query  371  GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATCAGGCGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGGCCAACCACTGGGGAAGGTGCA  444
            |||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||.||..|||.||.||||||||||
Sbjct  371  GTGGACCCTTATTATTAGAAGTGATTAGACGCTGTCAACAGAAAGAAAAAGGACCGGCCAGTGTGGAAGGTGCA  444

Query  445  CTTGATCTATCTGATGTACATTCTCCACCAAAGTCACCAGAGGGAAAAACAAGTGCACAGACAACACCAAGTAA  518
            ||.||||||||.||||.||||.|||||.||||||||||.||.||||||.||||||||.|..|.||.||||||||
Sbjct  445  CTGGATCTATCCGATGGACATCCTCCATCAAAGTCACCTGAAGGAAAATCAAGTGCAAACTCCACCCCAAGTAA  518

Query  519  G-------------AAGGCCAA--------------------------------TGA------------TGAGG  535
            |             ||||.|||                                |||            ||||.
Sbjct  519  GATACCAAGGTATAAAGGACAAGGTAAGAAGAAGACAATCGGTCAGAAGCCTGGTGACAAGACTAGCAGTGAGA  592

Query  536  CCAATCAGAGTGATACAAGTGTCTCCTTGTCAGAACCCAAGAGCAAAAGCAGCCTTCACTTACTGTCCCATGAA  609
            |||.|||||||||..|||||||||||||||||||..|||||||.|||||||||||.||||.||||.|||||||.
Sbjct  593  CCAGTCAGAGTGAGCCAAGTGTCTCCTTGTCAGAGTCCAAGAGTAAAAGCAGCCTGCACTCACTGGCCCATGAG  666

Query  610  ACAAAAATTGGATCTTTTCTAAGCAACAGAACTTTAGATGGCAAAGACAAAGC--TGGCCTTTGTCCAGATGAA  681
            ||||.|||||.||||||..||||||.|||..||.||||||.||.||||  |||  ||.||||||||||||||..
Sbjct  667  ACAAGAATTGCATCTTTCTTAAGCAGCAGCGCTGTAGATGCCAGAGAC--AGCAGTGCCCTTTGTCCAGATGGG  738

Query  682  GATGATATGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAGCCAGAGAAAACTTACGGTTTGAGGAATGA  755
            ||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||||.|||...|||
Sbjct  739  GATGATGTGGAAGGAGATTCTTTCTTTGATGATCCCATTCCTAAACCAGAAAAAACCTATGGTTGGAGAGCTGA  812

Query  756  ACCTAGGAAGCAAGCAGGAAGTCTGGCCTCGCTCTCGGATGCA--CCCCCCTTAAAAAGTGGACTCAGCTCCCT  827
            ||||.|||||||||..|||.||||||||||.||.||.||  ||  ||||.|||||..||.||.|||||||||||
Sbjct  813  ACCTCGGAAGCAAGTGGGAGGTCTGGCCTCACTGTCTGA--CAAGCCCCACTTAAGGAGCGGTCTCAGCTCCCT  884

Query  828  GGCGGGAGCCCCTTCTTTAAAAGACTCTGAGAGTAAAAGGGGAAATACAGTTTTGAAAGATCTGAAATTGATCA  901
            |||.||||||||.||..|||.|||..|.||||||||||||||||..||.||..||||.||||||||||||.|..
Sbjct  885  GGCCGGAGCCCCATCGCTAACAGATCCAGAGAGTAAAAGGGGAAGCACCGTCCTGAAGGATCTGAAATTGGTTG  958

Query  902  GTGATAAAATTGGATCACTTGGATTAGGAACTGGAGAAGATGATGACTATGTTGATGATTTTAATAGTACCAGC  975
            ||||.||.||||||||||||||..||||.||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||.|.|||
Sbjct  959  GTGAGAAGATTGGATCACTTGGGCTAGGCACTGGAGAAGATGAGGACTATGCTGATGATTTTAATAGTGCTAGC  1032

Query  976  CATCGCTCAGAGAAAAGTGAGATAAGTATTGGTGAAGAGATAGAAGAAGACCTTTCTGTGGAAATAGATGACAT  1049
            |||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||||||||..|||.|.||||.|||..
Sbjct 1033  CATCGCTCAGAAAAAAGTGAGCTAAGTATTGGTGAAGAGATTGAAGAAGACCTTTCCATGGGAGTAGAGGACGG  1106

Query 1050  CAATACCAGTGATAAGCTTGATGACCTCACACAAGATCTGACTGTATCCCAGCTCAGTGATGTTGCGGATTATC  1123
            .||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1107  GAACACCAGTGATAAACTCGATGACCTCACACAAGACCTGACTGTTTCCCAGCTCAGTGATGTTGCTGACTATC  1180

Query 1124  TGGAAGATGTTGCA  1137
            ||||||||||||||
Sbjct 1181  TGGAAGATGTTGCA  1194