Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_07768
Subject:
NM_022656.2
Aligned Length:
1603
Identities:
1350
Gaps:
109

Alignment

Query    1  MATAR-TFGPEREAEPAKEARVVGSELVDTYTVYIIQVTDGSHEWTVKHRYSDFHDLHEKLVAERKIDKNLLPP  73
            ||.|. .|||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||.||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct    1  MAAATLSFGPEREAEPAKEARVVGSELVDTYTVYVIQVTDGNHEWTIKHRYSDFHDLHEKLVAERKIDKSLLPP  74

Query   74  KKIIGKNSRSLVEKREKDLEVYLQKLLAAFPGVTPRVLAHFLHFHFYEINGITAALAEELFEKGEQLLGAGEVF  147
            ||||||||||||||||.|||||||.||..||.|.|||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  KKIIGKNSRSLVEKRERDLEVYLQTLLTTFPDVAPRVLAHFLHFHLYEVNGVTAALAEELFEKGEQLLGAGEVF  148

Query  148  AIGPLQLYAVTEQLQQGKPTCASGDAKTDLGHILDFTCRLKYLKVSGTEGPFGTSNIQEQLLPFDLSIFKSLHQ  221
            ||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct  149  AIRPLQLYAITEQLQQGKPTCASGDAKTDLGHILDFTCRLKYLKVSGTEGPFGTSNIKEQLLPFDLSIFKSLHQ  222

Query  222  VEISHCDAKHIRGLVASKPTLATLSVRFSATSMKEVLVPEASEFDEWEPEGT-TLEGPVTAVIPTWQALTTLDL  294
            |||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||.|||||||||||||| ||.|||||.||||||||||||
Sbjct  223  VEISHCDAKHIRGLVTSKPTLATMSVRFSATSMKEVLAPEASEFDEWEPEGTATLGGPVTAIIPTWQALTTLDL  296

Query  295  SHNSISEIDESVKLIPKIEFLDLSHNGLLVVDNLQHLYNLVHLDLSYNKLSSLEGLHTKLGNIKTLNLAGNLLE  368
            |||||.|||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||.||
Sbjct  297  SHNSICEIDESVKLIPKIEYLDLSHNGLRVVDNLQHLYNLVHLDLSYNKLSSLEGVHTKLGNVKTLNLAGNFLE  370

Query  369  SLSGLHKLYSLVNLDLRDNRIEQMEEVRSIGSLPCLEHVSLLNNPLSIIPDYRTKVLAQFGERASEVCLDDTVT  442
            |||||||||||||.|||||||||..||.|||||||||...|||||||||||||||||.||||||||.||||..|
Sbjct  371  SLSGLHKLYSLVNVDLRDNRIEQLDEVKSIGSLPCLERLTLLNNPLSIIPDYRTKVLSQFGERASEICLDDVAT  444

Query  443  TEKELDTVEVLKAIQKAKEVKSKLSNPEKKGGEDSRLSAAPCIRPSSSPPTVAPASASLPQPILSNQGIMFVQE  516
            ||||||||||||||||||.|||||||.|||.|||.||..||||||..||| .||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TEKELDTVEVLKAIQKAKDVKSKLSNTEKKAGEDFRLPPAPCIRPGGSPP-AAPASASLPQPILSNQGIMFVQE  517

Query  517  EALASSLSSTDSLTPE-HQPIAQGCSDSLESIPAGQAASDDLRDVPGAVGGASPEHAEPEVQVVPGSGQIIFLP  589
            |||||||||||||.|| |.|||..||||||||||||.||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  518  EALASSLSSTDSLPPEDHRPIARACSDSLESIPAGQVASDDLRDVPGAVGGVSPDHAEPEVQVVPGSGQIIFLP  591

Query  590  FTCIGYTATNQDFIQRLSTLIRQAIERQLPAWIEAANQREEGQGEQGEEEDEEEEEEEDVAENRYFEMGPPDVE  663
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||||||| |||||||||||||||||||||.|
Sbjct  592  FTCIGYTATNQDFIQRLSTLIRQAIERQLPAWIEAANQREEAHGEQGEEE-EEEEEEEDVAENRYFEMGPPDAE  664

Query  664  EEEGGGQGEEEEEEEEDEEAEEERLALEWALGADEDFLLEHIRILKVLWCFLIHVQGSIRQFAACLVLTDFGIA  737
            ||||.||| ||.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  665  EEEGSGQG-EEDEEDEDEEAEEERLALEWALGADEDFLLEHIRILKVLWCFLIHVQGSIRQFAACLVLTDFGIA  737

Query  738  VFEIPHQESRGSSQHILSSLRFVFCFPHGDLTEFGFLMPELCLVLKVRHSENTLFIISDAANLHEFHADLRSCF  811
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  738  VFEIPHQESRGSSQHILSSLRFVFCFPHGDLTEFGFLMPELCLVLKVRHSENTLFIISDAANLHEFHADLRSCF  811

Query  812  APQHMAMLCSPILYGSHTSLQEFLRQLLTFYKVAGGCQERSQGCFPVYLVYSDKRMVQTAAGDYSGNIEWASCT  885
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  812  APQHMAMLCSPILYGSHTTLQEFLRQLLTFYKVAGGSQERSQGCFPVYLVYSDKRMVQTPAGDYSGNIEWASCT  885

Query  886  LCSAVRRSCCAPSEAVKSAAIPYWLLLTPQHLNVIKADFNPIPNRGTHNCRNRNSFKLSRVPLSTVLLDPTRSC  959
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  886  LCSAVRRSCCAPSEAVKSAAIPYWLLLTSQHLNVIKADFNPMPNRGTHNCRNRNSFKLSRVPLSTVLLDPTRSC  959

Query  960  TQPRGAFADGHVLELLVGYRFVTAIFVLPHEKFHFLRVYNQLRASLQDLKTVVIAKTPGTGGSPQGSFADGQPA  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.|  ...|.     .|||
Sbjct  960  TQPRGAFADGHVLELLVGYRFVTAIFVLPHEKFHFLRVYNQLRASLQDLKTVVISKNP--SAKPR-----NQPA  1026

Query 1034  ERRASNDQRPQE------------------VPAEALAP--APVEVP----------------------------  1059
            ..|||..||.||                  .|||||||  |||..|                            
Sbjct 1027  KSRASAEQRLQETPADAPAPAAVPPTASAPAPAEALAPDLAPVQAPGEDRGLTSAEAPAAAEAPAAAEAPAAAE  1100

Query 1060  ----APAPAAASASGPAKTPAPAEASTSALVP--------------EETPVEAPAPPP----------------  1099
                |.|||||.|...|..||||||...|..|              .|.|..|.||.|                
Sbjct 1101  APAAAEAPAAAEAPAAAEAPAPAEAPAAAEAPAAAEAPAAAEAPAAAEAPASAEAPAPNQAPAPARGPAPARGP  1174

Query 1100  --------------AEAPAQYPSEHLIQATSEENQIPSHLPACPSLRHVASLRGSAIIELFHSSIAEVENEELR  1159
                          ||.|||||||.|||.||||||||||||.||||.|.|.|||.|||.|||.|||||||||||
Sbjct 1175  APAGGPAPAEALAQAEVPAQYPSERLIQSTSEENQIPSHLPVCPSLQHIARLRGRAIIDLFHNSIAEVENEELR  1248

Query 1160  HLMWSSVVFYQTPGLEVTACVLLSTKAVYFVLHDGLRRYFSEPLQDFWHQKNTDYNNSPFHISQCFVLKLSDLQ  1233
            ||.|||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1249  HLLWSSVVFYQTPGLEVTACVLLSSKAVYFILHDGLRRYFSEPLQDFWHQKNTDYNNSPFHVSQCFVLKLSDLQ  1322

Query 1234  SVNVGLFDQHFRLTGSTPMQVVTCLTRDSYLTHCFLQHLMVVLSSLERTPSPEPVDKDFYSEFGNKTTGKMENY  1307
            |||||||||.||||||.|.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|.|||||||
Sbjct 1323  SVNVGLFDQYFRLTGSSPTQVVTCLTRDSYLTHCFLQHLMLVLSSLERTPSPEPVDKDFYSEFGDKNTGKMENY  1396

Query 1308  ELIHSSRVKFTYPSEEEIGDLTFTVAQKMAEPEKAPALSILLYVQAFQVGMPPPGCCRGPLRPKTLLLTSSEIF  1381
            |||||||||||||||||.||||..||||||.|.|.||||||||.|||||..|..|..|||||||||||||.|||
Sbjct 1397  ELIHSSRVKFTYPSEEEVGDLTYIVAQKMADPAKNPALSILLYIQAFQVVTPHLGRGRGPLRPKTLLLTSAEIF  1470

Query 1382  LLDEDCVHYPLPEFAKEPPQRDRYRLDDGRRVRDLDRVLMGYQTYPQALTLVFDDVQGHDLMGSVTLDHFGEVP  1455
            |||||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||||||||.||||||||||||||||.|
Sbjct 1471  LLDEDYIHYPLPEFAKEPPQRDRYRLDDGRRVRDLDRVLMGYYPYPQALTLVFDDTQGHDLMGSVTLDHFGEMP  1544

Query 1456  GGPARASQGREVQWQVFVPSAESREKLISLLARQWEALCGRELPVELTG  1504
            |||.|..||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1545  GGPGRVGQGREVQWQVFVPSAESREKLISLLARQWEALCGRELPVELTG  1593