Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07799
• Subject: XM_006539727.3
• Aligned Length: 1425
• Identities: 1245
• Gaps: 57

Alignment

Query    1  ATGTCGGACTTCGACGAGTTCGAGCGGCAGCTCAACGAGAATAAACAAGAGCGGGACAAGGAGAACCGGCATCG  74
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||..|
Sbjct    1  ATGTCGGACTTCGACGAGTTCGAGCGGCAGCTCAACGAGAATAAACAAGAGCGGGACAAGGAGAATCGGCACAG  74

Query   75  GAAGCGCAGCCACAGCCGCTCTCGGAGCCGGGACCGCAAACGCCGGAGCCGGAGCCGCGACCGGCGCAACCGGG  148
            ||||||.||.|||||.||||||||.|||||.||.||.||.|||.|||||.|||||||.||.|||||||||||||
Sbjct   75  GAAGCGTAGTCACAGTCGCTCTCGAAGCCGAGATCGAAAGCGCAGGAGCAGGAGCCGAGATCGGCGCAACCGGG  148

Query  149  ACCAGCGGAGCGCCTCCCGGGACAGGCGACGACGCAGCAAACCTTTGACCAGAGGCGCTAAAGAGGAGCACGGT  222
            |||||||.||.|||||.|||||.|||.|||||||.||                                     
Sbjct  149  ACCAGCGCAGTGCCTCTCGGGATAGGAGACGACGAAG-------------------------------------  185

Query  223  GGACTGATTCGTTCCCCCCGCCACGAGAAGAAGAAGAAGGTCCGTAAATACTGGGACGTGCCACCCCCAGGCTT  296
                    ||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct  186  --------TCGTTCTCCCCGCCATGAGAAGAAGAAGAAGGTGCGTAAATACTGGGACGTGCCACCGCCTGGCTT  251

Query  297  TGAGCACATCACCCCAATGCAGTACAAGGCCATGCAAGCTGCGGGTCAGATTCCAGCCACTGCTCTTCTCCCCA  370
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  252  TGAGCACATCACCCCAATGCAGTACAAGGCCATGCAAGCTGCGGGTCAGATTCCAGCCACTGCCCTTCTCCCGA  325

Query  371  CCATGACCCCTGACGGTCTGGCTGTGACCCCAACGCCGGTGCCCGTGGTCGGGAGCCAGATGACCAGACAAGCC  444
            |||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  326  CCATGACTCCTGATGGTCTGGCTGTGACCCCAACGCCAGTGCCTGTGGTTGGGAGCCAGATGACCAGACAGGCC  399

Query  445  CGGCGCCTCTACGTGGGCAACATCCCCTTTGGCATCACTGAGGAGGCCATGATGGATTTCTTCAACGCCCAGAT  518
            .|.||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  400  AGACGTCTCTACGTGGGCAACATCCCTTTTGGCATTACTGAGGAGGCTATGATGGACTTCTTCAACGCCCAGAT  473

Query  519  GCGCCTGGGGGGGCTGACCCAGGCCCCTGGCAACCCAGTGTTGGCTGTGCAGATTAACCAGGACAAGAATTTTG  592
            ||||.||||.|||.||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||.||.|||||||||||||
Sbjct  474  GCGCTTGGGAGGGTTGACTCAGGCCCCTGGCAACCCAGTCTTGGCTGTGCAGATAAATCAAGACAAGAATTTTG  547

Query  593  CCTTTTTGGAGTTCCGCTCAGTGGACGAGACTACCCAGGCTATGGCCTTTGATGGCATCATCTTCCAGGGCCAG  666
            ||||||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  548  CCTTTTTGGAGTTCCGGTCAGTGGATGAGACGACCCAGGCCATGGCATTTGATGGCATCATCTTCCAGGGCCAG  621

Query  667  TCACTAAAGATCCGCAGGCCTCACGACTACCAGCCGCTTCCTGGCATGTCAGAGAACCCCTCCGTCTATGTGCC  740
            |||.|.|||||.||.||||||||.|||||.|||||..|.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct  622  TCATTGAAGATTCGAAGGCCTCATGACTATCAGCCATTGCCTGGCATGTCAGAGAACCCCTCTGTTTATGTGCC  695

Query  741  TGGGGTTGTGTCCACTGTGGTCCCCGACTCTGCCCACAAGCTGTTCATCGGGGGCTTACCCAACTACCTGAACG  814
            |||.|||||.||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.|
Sbjct  696  TGGAGTTGTATCCACTGTAGTCCCAGATTCTGCCCACAAGCTGTTCATCGGGGGTTTGCCCAATTACCTAAATG  769

Query  815  ATGACCAGGTCAAAGAGCTGCTGACATCCTTTGGGCCCCTCAAGGCCTTCAACCTGGTCAAGGACAGTGCCACG  888
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||.|||||.||||||||.
Sbjct  770  ATGACCAGGTAAAAGAGCTGCTGACATCCTTTGGGCCTCTCAAGGCCTTCAACTTGGTTAAGGATAGTGCCACA  843

Query  889  GGGCTCTCCAAGGGCTACGCCTTCTGTGAGTACGTGGACATCAACGTCACGGATCAGGCCATTGCGGGGCTGAA  962
            |||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct  844  GGGCTCTCCAAGGGCTATGCCTTCTGTGAGTACGTGGACATCAACGTCACAGATCAGGCCATTGCGGGGCTGAA  917

Query  963  CGGCATGCAGCTGGGGGATAAGAAGCTGCTGGTCCAGAGGGCGAGTGTGGGAGCCAAGAATGCCACGCT-----  1031
            .||.||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
Sbjct  918  TGGGATGCAGCTAGGGGACAAGAAGCTGCTTGTCCAGAGGGCGAGTGTGGGAGCCAAGAATGCCACGCTGGTGA  991

Query 1032  -------GAGCACCATCAATCAGACGCCTGTGACCCTGCAAGTGCCGGGCTTGATGAGCTCCCAGGTGCAGATG  1098
                   ||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct  992  GCCTCCCGAGCACCATCAATCAGACACCTGTGACCCTTCAAGTGCCCGGCCTGATGAGCTCTCAGGTGCAGATG  1065

Query 1099  GGCGGCCACCCGACTGAGGTCCTGTGCCTCATGAACATGGTGCTGCCTGAGGAGCTGCTGGACGACGAGGAGTA  1172
            |||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1066  GGCGGTCACCCAACTGAGGTCCTGTGCCTCATGAACATGGTGCTGCCTGAGGAGCTGCTGGACGATGAGGAGTA  1139

Query 1173  TGAGGAGATCGTGGAGGATGTGCGGGACGAGTGCAGCAAGTACGGGCTTGTCAAGTCCATCGAGATCCCCCGGC  1246
            |||||||||.||.|||||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|.|||||.|||||.||.||.|||||.|
Sbjct 1140  TGAGGAGATTGTAGAGGACGTACGAGACGAGTGCAGCAAGTATGGGTTGGTCAAATCCATTGAAATTCCCCGCC  1213

Query 1247  CTGTGGACGGCGTCGAGGTGCCCGGCTGCGGAAAGATCTTTGTGGAGTTCACCTCTGTGTTTGACTGCCAGAAA  1320
            |.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1214  CCGTGGACGGCGTCGAGGTGCCTGGCTGTGGAAAGATCTTCGTGGAGTTCACCTCTGTGTTTGACTGCCAGAAA  1287

Query 1321  GCCATGCAGGGCCTGACGGGCCGCAAGTTCGCCAACAGAGTGGTTGTCACAAAATACTGTGACCCCGACTCTTA  1394
            |||||||||||.||.||.||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||
Sbjct 1288  GCCATGCAGGGTCTAACCGGTCGCAAGTTCGCCAACAGAGTGGTGGTCACAAAATACTGTGACCCTGATTCTTA  1361

Query 1395  TCACCGCCGGGATTTCTGG  1413
            .|||||.|||||.||||||
Sbjct 1362  CCACCGTCGGGACTTCTGG  1380