Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07803
- Subject:
- NM_001320822.2
- Aligned Length:
- 2502
- Identities:
- 2405
- Gaps:
- 96
Alignment
Query 1 ATGGCGGTGGAGGACGAGGGGCTCCGGGTCTTCCAGAGCGTGAAGATCAAGATCGGTGAAGCCAAAAACCTTCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTCTTACCCGGGGCCGAGCAAGATGAGGGATTGCTACTGCACGGTGAACCTGGACCAGGAGGAGGTTTTCAGGA 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ----------------------ATGAGGGATTGCTACTGCACGGTGAACCTGGACCAGGAGGAGGTTTTCAGGA 52
Query 149 CCAAAATTGTGGAAAAGTCACTCTGCCCGTTTTACGGAGAAGACTTTTACTGTGAAATTCCTCGGAGCTTTCGT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 53 CCAAAATTGTGGAAAAGTCACTCTGCCCGTTTTACGGAGAAGACTTTTACTGTGAAATTCCTCGGAGCTTTCGT 126
Query 223 CACCTGTCCTTCTACATTTTCGATAGAGACGTTTTCCGGAGGGATTCCATCATAGGGAAGGTGGCCATCCAGAA 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 127 CACCTGTCCTTCTACATTTTCGATAGAGACGTTTTCCGGAGGGATTCCATCATAGGGAAGGTGGCCATCCAGAA 200
Query 297 GGAGGACTTGCAGAAGTACCACAACAGGGACACCTGGTTCCAGCTGCAGCACGTGGACGCTGACTCGGAAGTGC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 201 GGAGGACTTGCAGAAGTACCACAACAGGGACACCTGGTTCCAGCTGCAGCACGTGGACGCTGACTCGGAAGTGC 274
Query 371 AGGGCAAAGTGCACCTGGAGCTGCGGCTGAGCGAGGTCATCACAGACACTGGGGTCGTCTGCCACAAGCTCGCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 275 AGGGCAAAGTGCACCTGGAGCTGCGGCTGAGCGAGGTCATCACAGACACTGGGGTCGTCTGCCACAAGCTCGCC 348
Query 445 ACACGCATCGTCGAGTGCCAGGGCCTCCCCATCGTGAATGGGCAATGTGACCCCTACGCCACCGTGACGCTGGC 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 349 ACACGCATCGTCGAGTGCCAGGGCCTCCCCATCGTGAATGGGCAATGTGACCCCTACGCCACCGTGACGCTGGC 422
Query 519 AGGACCCTTCAGATCAGAAGCAAAGAAGACGAAAGTGAAGAGGAAGACCAACAATCCCCAGTTCGATGAAGTGT 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 423 AGGACCCTTCAGATCAGAAGCAAAGAAGACGAAAGTGAAGAGGAAGACCAACAATCCCCAGTTCGATGAAGTGT 496
Query 593 TTTATTTTGAGGTGACCCGGCCCTGTAGCTACAGCAAGAAGTCCCACTTTGACTTTGAGGAGGAAGACGTGGAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 497 TTTATTTTGAGGTGACCCGGCCCTGTAGCTACAGCAAGAAGTCCCACTTTGACTTTGAGGAGGAAGACGTGGAC 570
Query 667 AAGCTCGAAATCAGAGTTGACCTCTGGAATGCCAGTAACCTGAAGTTTGGAGATGAATTCCTGGGAGAACTAAG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 571 AAGCTCGAAATCAGAGTTGACCTCTGGAATGCCAGTAACCTGAAGTTTGGAGATGAATTCCTGGGAGAACTAAG 644
Query 741 GATCCCGTTGAAAGTCCTGCGGCAGTCCAGCTCCTACGAGGCGTGGTACTTCCTCCAGCCCCGGGACAATGGTA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 645 GATCCCGTTGAAAGTCCTGCGGCAGTCCAGCTCCTACGAGGCGTGGTACTTCCTCCAGCCCCGGGACAATGGTA 718
Query 815 GCAAGAGCCTAAAGCCAGACGACCTGGGCTCCCTGCGGCTGAACGTGGTATACACGGAAGACCACGTGTTTTCT 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 719 GCAAGAGCCTAAAGCCAGACGACCTGGGCTCCCTGCGGCTGAACGTGGTATACACGGAAGACCACGTGTTTTCT 792
Query 889 TCTGACTATTACAGCCCTCTGCGGGACCTGCTGTTGAAGTCTGCGGATGTGGAGCCCGTGTCAGCGTCTGCGGC 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 793 TCTGACTATTACAGCCCTCTGCGGGACCTGCTGTTGAAGTCTGCGGATGTGGAGCCCGTGTCAGCGTCTGCGGC 866
Query 963 CCACATCCTGGGCGAGGTTTGCCGGGAGAAGCAGGAGGCGGCCGTCCCGCTGGTGCGGCTCTTCCTACACTATG 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 867 CCACATCCTGGGCGAGGTTTGCCGGGAGAAGCAGGAGGCGGCCGTCCCGCTGGTGCGGCTCTTCCTACACTATG 940
Query 1037 GCAGGGTGGTGCCATTCATCAGTGCCATCGCCAGCGCGGAGGTGAAGCGGACCCAGGACCCCAACACCATCTTC 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 941 GCAGGGTGGTGCCATTCATCAGTGCCATCGCCAGCGCGGAGGTGAAGCGGACCCAGGACCCCAACACCATCTTC 1014
Query 1111 CGAGGAAACTCACTGGCGTCCAAGTGCATCGACGAGACCATGAAGCTGGCGGGGATGCATTACCTGCATGTCAC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1015 CGAGGAAACTCACTGGCGTCCAAGTGCATCGACGAGACCATGAAGCTGGCGGGGATGCATTACCTGCATGTCAC 1088
Query 1185 CCTGAAGCCCGCCATCGAGGAGATATGCCAGAGCCACAAACCCTGTGAAATCGACCCTGTGAAGTTGAAAGACG 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1089 CCTGAAGCCCGCCATCGAGGAGATATGCCAGAGCCACAAACCCTGTGAAATCGACCCTGTGAAGTTGAAAGACG 1162
Query 1259 GAGAAAACCTTGAAAACAACATGGAGAACCTACGGCAGTATGTGGACCGCGTCTTCCACGCCATCACCGAGTCT 1332
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1163 GAGAAAACCTTGAAAACAACATGGAGAACCTACGGCAGTATGTGGACCGCGTCTTCCACGCCATCACTGAGTCT 1236
Query 1333 GGGGTGAGCTGCCCGACCGTCATGTGTGACATCTTCTTCTCCCTCCGGGAGGCGGCGGCCAAGCGCTTCCAGGA 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1237 GGGGTGAGCTGCCCGACCGTCATGTGTGACATCTTCTTCTCCCTCCGGGAGGCGGCGGCCAAGCGCTTCCAGGA 1310
Query 1407 TGACCCGGACGTCAGGTACACTGCAGTGAGCAGCTTCATCTTCCTGAGGTTCTTTGCGCCCGCCATTCTCTCCC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1311 TGACCCGGACGTCAGGTACACTGCAGTGAGCAGCTTCATCTTCCTGAGGTTCTTTGCGCCCGCCATTCTCTCCC 1384
Query 1481 CCAACCTCTTCCAGCTCACGCCGCACCACACGGACCCCCAGACGTCCAGGACGCTGACATTGATCTCCAAGACC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1385 CCAACCTCTTCCAGCTCACGCCGCACCACACGGACCCCCAGACGTCCAGGACGCTGACATTGATCTCCAAGACC 1458
Query 1555 GTTCAGACCCTCGGCAGCCTGTCCAAGTCCAAATCTGCGAGTTTTAAGGAGTCCTACATGGCTACATTTTATGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1459 GTTCAGACCCTCGGCAGCCTGTCCAAGTCCAAATCTGCGAGTTTTAAGGAGTCCTACATGGCTACATTTTATGA 1532
Query 1629 ATTCTTCAATGAGCAGAAATATGCTGATGCGGTGAAGAACTTCTTGGATCTGATTTCGTCCTCGGGGAGAAGAG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1533 ATTCTTCAATGAGCAGAAATATGCTGATGCGGTGAAGAACTTCTTGGATCTGATTTCGTCCTCGGGGAGAAGAG 1606
Query 1703 ACCCCAAGAGTGTTGAGCAGCCCATCGTGCTTAAAGAAGGGTTCATGATCAAGAGGGCCCAAGGACGGAAGCGC 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1607 ACCCCAAGAGTGTTGAGCAGCCCATCGTGCTTAAAGAAGGGTTCATGATCAAGAGGGCCCAAGGACGGAAGCGC 1680
Query 1777 TTTGGGATGAAGAATTTTAAGAAGAGATGGTTTCGCTTGACCAACCATGAATTTACCTACCACAAAAGCAAAGG 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1681 TTTGGGATGAAGAATTTTAAGAAGAGATGGTTTCGCTTGACCAACCATGAATTTACCTACCACAAAAGCAAAGG 1754
Query 1851 GGACCAGCCTCTCTACAGCATTCCCATCGAGAACATCCTGGCAGTGGAGAAGCTGGAGGAGGAGTCTTTCAAAA 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1755 GGACCAGCCTCTCTACAGCATTCCCATCGAGAACATCCTGGCAGTGGAGAAGCTGGAGGAGGAGTCTTTCAAAA 1828
Query 1925 TGAAAAACATGTTCCAGGTCATCCAGCCAGAGCGTGCGCTGTACATCCAGGCCAACAACTGCGTGGAGGCCAAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1829 TGAAAAACATGTTCCAGGTCATCCAGCCAGAGCGTGCGCTGTACATCCAGGCCAACAACTGCGTGGAGGCCAAG 1902
Query 1999 GACTGGATCGACATTCTCACCAAAGTGAGCCAGTGCAACCAGAAGCGCCTCACCGTCTACCACCCGTCCGCCTA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1903 GACTGGATCGACATTCTCACCAAAGTGAGCCAGTGCAACCAGAAGCGCCTCACCGTCTACCACCCGTCCGCCTA 1976
Query 2073 CCTGAGCGGCCACTGGCTGTGCTGTAGGGCGCCATCCGACTCGGCTCCGGGCTGCTCGCCCTGCACTGGCGGCC 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1977 CCTGAGCGGCCACTGGCTGTGCTGTAGGGCGCCATCCGACTCGGCTCCGGGCTGCTCGCCCTGCACTGGCGGCC 2050
Query 2147 TCCCAGCCAACATCCAGCTGGACATTGATGGGGACCGTGAGACGGAGCGTATCTACTCCCTCTTCAACTTGTAC 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2051 TCCCAGCCAACATCCAGCTGGACATTGATGGGGACCGTGAGACGGAGCGTATCTACTCCCTCTTCAACTTGTAC 2124
Query 2221 ATGAGCAAGCTGGAGAAGATGCAGGAGGCCTGTGGGAGCAAATCTGTGTATGACGGCCCGGAGCAGGAGGAGTA 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2125 ATGAGCAAGCTGGAGAAGATGCAGGAGGCCTGTGGGAGCAAATCTGTGTATGACGGCCCGGAGCAGGAGGAGTA 2198
Query 2295 TTCGACGTTCGTCATTGACGACCCCCAGGAGACCTACAAGACGCTAAAGCAAGTCATCGCTGGGGTTGGGGCTT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2199 TTCGACGTTCGTCATTGACGACCCCCAGGAGACCTACAAGACGCTAAAGCAAGTCATCGCTGGGGTTGGGGCTT 2272
Query 2369 TGGAGCAGGAGCACGCCCAGTATAAGAGGGACAAGTTCAAGAAGACGAAATATGGAAGCCAGGAGCACCCCATC 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2273 TGGAGCAGGAGCACGCCCAGTATAAGAGGGACAAGTTCAAGAAGACGAAATATGGAAGCCAGGAGCACCCCATC 2346
Query 2443 GGAGACAAGAGCTTCCAGAACTACATCCGGCAGCAGTCCGAGACCTCCACTCATTCCATT 2502
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2347 GGAGACAAGAGCTTCCAGAACTACATCCGGCAGCAGTCCGAGACCTCCACTCATTCCATT 2406