Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07803
- Subject:
- XM_006508734.1
- Aligned Length:
- 2503
- Identities:
- 2096
- Gaps:
- 98
Alignment
Query 1 ATGGCGGTGGAGGACGAGGGGCTCCGGGTCTTCCAGAGCGTGAAGATCAAGATCGGTGAAGCCAAAAACCTTCC 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 CTCTTACCCGGGGCCGAGCAAGATGAGGGATTGCTACTGCACGGTGAACCTGGACCAGGAGGAGGTTTTCAGGA 148
||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1 ----------------------ATGAGGGACTGCTACTGCACTGTGAACCTGGACCAGGAGGAGGTTTTCCGGA 52
Query 149 CCAAAATTGTGGAAAAGTCACTCTGCCCGTTTTACGGAGAAGACTTTTACTGTGAAATTCCTCGGAGCTTTCGT 222
||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||.||.
Sbjct 53 CCAAAATTGTCGAGAAGTCACTCTGCCCCTTTTACGGAGAGGACTTTTACTGTGAAATCCCTCGGAGTTTCCGC 126
Query 223 CACCTGTCCTTCTACATTTTCGATAGAGACGTTTTCCGGAGGGATTCCATCATAGGGAAGGTGGCCATCCAGAA 296
|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 127 CACCTGTCCTTTTACATTTTTGATAGAGATGTTTTCCGAAGGGACTCCATCATAGGCAAGGTGGCCATCCAGAA 200
Query 297 GGAGGACTTGCAGAAGTACCACAACAGGGACACCTGGTTCCAGCTGCAGCACGTGGACGCTGACTCGGAAGTGC 370
|||.||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 201 GGAAGACTTGCAGAGGTACCACAACAGGGACACATGGTTCCAGCTGCAGCACGTGGACGCAGACTCAGAGGTGC 274
Query 371 AGGGCAAAGTGCACCTGGAGCTGCGGCTGAGCGAGGTCATCACAGACACTGGGGTCGTCTGCCACAAGCTCGCC 444
|||||||.||.||||||||||||.|.||.||.||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.|||||.
Sbjct 275 AGGGCAAGGTCCACCTGGAGCTGAGACTAAGTGAGGTCATTACGGACACTGGTGTCGTCTGCCACAAACTCGCT 348
Query 445 ACACGCATCGTCGAGTGCCAGGGCCTCCCCATCGTGAATGGGCAATGTGACCCCTACGCCACCGTGACGCTGGC 518
.||||||||.|||||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 349 GCACGCATCTTCGAGTGCCAGGGTCTCCCCATTGTGAACGGGCAGTGTGACCCTTACGCCACAGTGACGCTGGC 422
Query 519 AGGACCCTTCAGATCAGAAGCAAAGAAGACGAAAGTGAAGAGGAAGACCAACAATCCCCAGTTCGATGAAGTGT 592
.|||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|||||||.|||.||||||||.||||||||.||.||.||||
Sbjct 423 CGGACCCTTCAGGTCTGAAGCAAAGAAAACGAAGGTGAAGAAGAAAACCAACAACCCCCAGTTTGACGAGGTGT 496
Query 593 TTTATTTTGAGGTGACCCGGCCCTGTAGCTACAGCAAGAAGTCCCACTTTGACTTTGAGGAGGAAGACGTGGAC 666
|||||||||||||||||.|.|||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 497 TTTATTTTGAGGTGACCAGACCCTGCAGCTACAGCAAAAAGTCCCACTTTGACTTTGAGGAAGAGGACGTGGAC 570
Query 667 AAGCTCGAAATCAGAGTTGACCTCTGGAATGCCAGTAACCTGAAGTTTGGAGATGAATTCCTGGGAGAACTAAG 740
||.||.||||||.||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||.||.||.||.|||||.||
Sbjct 571 AAACTTGAAATCCGAGTTGACCTCTGGAACGCCAGCAACCTGAAGTTTGGGGATGAGTTTCTCGGGGAACTGAG 644
Query 741 GATCCCGTTGAAAGTCCTGCGGCAGTCCAGCTCCTACGAGGCGTGGTACTTCCTCCAGCCCCGGGACAATGGTA 814
|.|.||..|.||..|.|||||.||.||.|||||.||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||.||.|
Sbjct 645 GCTTCCTCTCAAGATTCTGCGACACTCGAGCTCTTATGAAGCCTGGTACTTCCTCCAGCCCCGAGACAACGGCA 718
Query 815 GCAAGAGCCTAAAGCCAGACGACCTGGGCTCCCTGCGGCTGAACGTGGTATACACGGAAGACCACGTGTTTTCT 888
..||||||||.||||||||.|||.||||.||.|||.||.|.||.||.||.||.||.||||||||.||.||.||.
Sbjct 719 ATAAGAGCCTGAAGCCAGATGACTTGGGGTCTCTGAGGTTAAATGTCGTTTATACAGAAGACCATGTCTTCTCC 792
Query 889 TCTGACTATTACAGCCCTCTGCGGGACCTGCTGTTGAAGTCTGCGGATGTGGAGCCCGTGTCAGCGTCTGCGGC 962
|||||.||.||||||||.|||||.||||||.|..||||||||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||
Sbjct 793 TCTGAGTACTACAGCCCACTGCGTGACCTGTTACTGAAGTCTGCAGATGTGGAGCCTGTCTCAGCCTCAGCAGC 866
Query 963 CCACATCCTGGGCGAGGTTTGCCGGGAGAAGCAGGAGGCGGCCGTCCCGCTGGTGCGGCTCTTCCTACACTATG 1036
.|||||||||||.|||||.|||.|.||.|||||.|||||.|||.||||||||||.||||||.|.||.|||||||
Sbjct 867 TCACATCCTGGGTGAGGTGTGCAGAGACAAGCAAGAGGCAGCCATCCCGCTGGTACGGCTCCTGCTGCACTATG 940
Query 1037 GCAGGGTGGTGCCATTCATCAGTGCCATCGCCAGCGCGGAGGTGAAGCGGACCCAGGACCCCAACACCATCTTC 1110
|||||||.|||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||.||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 941 GCAGGGTAGTGCCCTTCATCAGTGCCATCGCTAGCGCAGAGGTGAAGAGGACCCAGGACCCCAATACCATCTTC 1014
Query 1111 CGAGGAAACTCACTGGCGTCCAAGTGCATCGACGAGACCATGAAGCTGGCGGGGATGCATTACCTGCATGTCAC 1184
|||||||||||||||.|.|||||||||||.||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||.||.|||||.||
Sbjct 1015 CGAGGAAACTCACTGACATCCAAGTGCATAGATGAGACGATGAAGCTGGCAGGCATGCACTATCTCCATGTGAC 1088
Query 1185 CCTGAAGCCCGCCATCGAGGAGATATGCCAGAGCCACAAACCCTGTGAAATCGACCCTGTGAAGTTGAAAGACG 1258
||||||||||.||||.||||||||.||||||||||||||..|||||||.||||||||||||||..|||||||||
Sbjct 1089 CCTGAAGCCCACCATTGAGGAGATCTGCCAGAGCCACAAGTCCTGTGAGATCGACCCTGTGAAACTGAAAGACG 1162
Query 1259 GAGAAAACCTTGAAAACAACATGGAGAACCTACGGCAGTATGTGGACCGCGTCTTCCAC-GCCATCACCGAGTC 1331
|.||||||||.||.|||||||||||||.|||..|||||||||||||.|||.|||| ||| |.|||||||.||||
Sbjct 1163 GCGAAAACCTCGAGAACAACATGGAGAGCCTGAGGCAGTATGTGGATCGCATCTT-CACTGTCATCACCAAGTC 1235
Query 1332 TGGGGTGAGCTGCCCGACCGTCATGTGTGACATCTTCTTCTCCCTCCGGGAGGCGGCGGCCAAGCGCTTCCAGG 1405
.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||.|.|||||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct 1236 CGGGGTGAGCTGCCCCACCGTCATGTGTGACATCTTTTTCTCCTTGCGGGAGGCGGCTGCCAAGCGCTTCCAAG 1309
Query 1406 ATGACCCGGACGTCAGGTACACTGCAGTGAGCAGCTTCATCTTCCTGAGGTTCTTTGCGCCCGCCATTCTCTCC 1479
|||||..|||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.|||
Sbjct 1310 ATGACTTGGATGTGAGGTACACGGCCGTGAGCAGCTTCATCTTCCTCAGGTTCTTCGCCCCTGCCATCCTGTCC 1383
Query 1480 CCCAACCTCTTCCAGCTCACGCCGCACCACACGGACCCCCAGACGTCCAGGACGCTGACATTGATCTCCAAGAC 1553
||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||.||||||.|.|||||.|||||
Sbjct 1384 CCAAACCTTTTCCAGCTGACACCCCACCACACGGATCCACAGACTTCTAGAACCCTGACACTTATCTCAAAGAC 1457
Query 1554 CGTTCAGACCCTCGGCAGCCTGTCCAAGTCCAAATCTGCGAGTTTTAAGGAGTCCTACATGGCTACATTTTATG 1627
..|.|||||||||||||||.|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct 1458 GATCCAGACCCTCGGCAGCTTGTCCAAGTCCAAGTCTGCCAGTTTTAAGGAGTCGTACATGGCGACATTCTATG 1531
Query 1628 AATTCTTCAATGAGCAGAAATATGCTGATGCGGTGAAGAACTTCTTGGATCTGATTTCGTCCTCGGGGAGAAGA 1701
|||||||||||||||||||.|||||.|||||.||.||.||.||..|||||.||||.||.||||||||||||||.
Sbjct 1532 AATTCTTCAATGAGCAGAAGTATGCAGATGCTGTAAAAAATTTTCTGGATTTGATCTCATCCTCGGGGAGAAGG 1605
Query 1702 GACCCCAAGAGTGTTGAGCAGCCCATCGTGCTTAAAGAAGGGTTCATGATCAAGAGGGCCCAAGGACGGAAGCG 1775
|||||||||||..|.||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||.||||.||
Sbjct 1606 GACCCCAAGAGCATAGAGCAGCCCATCCTGCTTAAAGAAGGGTTCATGATCAAGCGGGCCCAGGGAAGGAAACG 1679
Query 1776 CTTTGGGATGAAGAATTTTAAGAAGAGATGGTTTCGCTTGACCAACCATGAATTTACCTACCACAAAAGCAAAG 1849
.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||.||||.|||||.||.||.||||||||.||||||||||
Sbjct 1680 GTTTGGAATGAAGAATTTCAAGAAGAGGTGGTTTCGCCTGACGAACCACGAGTTCACCTACCAGAAAAGCAAAG 1753
Query 1850 GGGACCAGCCTCTCTACAGCATTCCCATCGAGAACATCCTGGCAGTGGAGAAGCTGGAGGAGGAGTCTTTCAAA 1923
|.||.|||||.||||.||.|||.|||||||||||||||.||||.|||||||.|||.|||||||||||.|||..|
Sbjct 1754 GTGATCAGCCACTCTGCAACATCCCCATCGAGAACATCTTGGCTGTGGAGAGGCTAGAGGAGGAGTCCTTCCGA 1827
Query 1924 ATGAAAAACATGTTCCAGGTCATCCAGCCAGAGCGTGCGCTGTACATCCAGGCCAACAACTGCGTGGAGGCCAA 1997
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1828 ATGAAAAACATGTTCCAGGTCATCCAGCCAGAGCGTGCCCTGTACATCCAGGCCAACAACTGTGTGGAGGCCAA 1901
Query 1998 GGACTGGATCGACATTCTCACCAAAGTGAGCCAGTGCAACCAGAAGCGCCTCACCGTCTACCACCCGTCCGCCT 2071
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||.||||
Sbjct 1902 GGACTGGATCGACATCCTCACCAAAGTGAGCCAGTGCAACCAGAAGCGGCTCACCGTCTTCCACCCGTCGGCCT 1975
Query 2072 ACCTGAGCGGCCACTGGCTGTGCTGTAGGGCGCCATCCGACTCGGCTCCGGGCTGCTCGCCCTGCACTGGCGGC 2145
||||||.||||||||||||.|||||.|||||..|.||.|||.|||||.|.||||||.|.|||||||||||.||.
Sbjct 1976 ACCTGAACGGCCACTGGCTCTGCTGCAGGGCCTCCTCAGACACGGCTGCTGGCTGCACTCCCTGCACTGGTGGG 2049
Query 2146 CTCCCAGCCAACATCCAGCTGGACATTGATGGGGACCGTGAGACGGAGCGTATCTACTCCCTCTTCAACTTGTA 2219
|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||||.|||.||||
Sbjct 2050 CTCCCGGCCAACATCCAGCTGGACATTGATGGGGACCGTGAAACAGAGCGCATCTACTCTCTCTTTAACCTGTA 2123
Query 2220 CATGAGCAAGCTGGAGAAGATGCAGGAGGCCTGTGGGAGCAAATCTGTGTATGACGGCCCGGAGCAGGAGGAGT 2293
||||.||||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2124 CATGGGCAAGCTGGAAAAGATGCAGGAGGCCTGCGGCAGCAAGTCTGTGTATGACGGCCCTGAGCAGGAGGAGT 2197
Query 2294 ATTCGACGTTCGTCATTGACGACCCCCAGGAGACCTACAAGACGCTAAAGCAAGTCATCGCTGGGGTTGGGGCT 2367
|.||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||.|.
Sbjct 2198 ACTCAACGTTCGTCATCGACGACCCCCAGGAGACGTACAAGACGCTGAAGCAGGTCATCGCTGGGGTGGGGACC 2271
Query 2368 TTGGAGCAGGAGCACGCCCAGTATAAGAGGGACAAGTTCAAGAAGACGAAATATGGAAGCCAGGAGCACCCCAT 2441
.|.||||||||||||||.|||||.|.|||.|||||||||||||||||||.|||.||.||||||||||||||.||
Sbjct 2272 CTTGAGCAGGAGCACGCACAGTACAGGAGAGACAAGTTCAAGAAGACGAGATACGGGAGCCAGGAGCACCCTAT 2345
Query 2442 CGGAGACAAGAGCTTCCAGAACTACATCCGGCAGCAGTCCGAGACCTCCACTCATTCCATT 2502
.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||.||||||.|||||||||
Sbjct 2346 TGGAGACAAGAGCTTCCAGAACTACATCCGGCAGCAGTCTGAGATCTCCACCCATTCCATT 2406