Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_07810
- Subject:
- NM_001048143.2
- Aligned Length:
- 1668
- Identities:
- 1401
- Gaps:
- 36
Alignment
Query 1 ATGGAGGTCGGAGGAGACACTGCTGCCCCGGCCCCCGGGGGCGCGGAGGACTTGGAGGACACGCAGTTCCCCAG 74
|||||||.|||||||||.|.|||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGAGGCCGGAGGAGATAATGCTGTCCCAGCCCCCGGGGGCGTGGAGGACTTGGTGGACACGCAGTTCCCCAG 74
Query 75 TGAGGAAGCTAGAGAAGGTGGAGGGGTTCACGCGGTCCCGCCGGATCCCGAAGACGAGGGCCTGGAGGAAACAG 148
.|||||.|||.||||..|||.|.||||||||||...|.|||.||||||||.|||.|.||.||.||||||.||||
Sbjct 75 AGAGGAGGCTGGAGACAGTGAAAGGGTTCACGCAAGCACGCTGGATCCCGGAGATGGGGACCCGGAGGACACAG 148
Query 149 GATCCAAGGACAAGGACCAGCCACCCAG---CCCATCACCACCGCCCCAGTCAGAGGCCCTG--TCAAGCACCT 217
|||| |||||||||||||.|||| ||.||||||.|.|||.|||.|.|||| ||| ||||||||||
Sbjct 149 GATC------CAAGGACCAGCCATCCAGCCTCCTATCACCTCTGCCTCAGACTGAGG--CTGCATCAAGCACCT 214
Query 218 CTCGGCTCTGG---AGTCCTGCAGCCCCTGAGAATAGTCCCACATGTAG-CCCTGAGAGTAGCTCTGGAGGCCA 287
.|..||.|||| |.|.|.||||||.|.||.|..|| |||.|..|.|| .||||||||||.|||||..||.||
Sbjct 215 GTGAGCACTGGGAAACTGCAGCAGCCTCAGACAGCAG-CCCCCCCGGAGAACCTGAGAGTAACTCTGAGGGTCA 287
Query 288 G------------------GGCGGGGACCCCAGTGATGAGGAGTGGCGCAGCCAGCGGAAGCATGTGTTTGTGC 343
| ||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct 288 GGGAGAAGACCCCGACGATGGGGGGGACCCCAGTGACGAGGACTGGCGCAGCCAGCGGAAGCACGTGTTCGTGC 361
Query 344 TGAGTGAGGCTGGCAAGCCCATCTACTCGCGGTATGGTAGTGTGGAGGCGCTGTCGGCTACCATGGGTGTAATG 417
||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.|||
Sbjct 362 TGAGTGAGGCAGGCAAGCCCATCTACTCACGGTACGGTAGCGTGGAGGCACTGTCGGCCACCATGGGGGTGATG 435
Query 418 ACCGCCCTGGTGTCCTTTGTGCAGAGTGCGGGAGATGCCATCCGTGCCATCTACGCTGAGGACCACAAGCTGGT 491
||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 436 ACAGCCCTGGTGTCCTTTGTGCAGAGTGCAGGAGACGCCATCCGTGCCATCTATGCTGAGGATCACAAGCTGGT 509
Query 492 GTTCCTACAACAGGGCCCACTGTTGCTCGTGGCCATGTCACGGACTTCTCAGTCAGCAGCCCAGCTGCGGGGGG 565
||||||.||.|||||.|||||..||||||||||..||||.||||||.|.|||||.|||||.|||||.||.||.|
Sbjct 510 GTTCCTGCAGCAGGGTCCACTCCTGCTCGTGGCTGTGTCCCGGACTCCACAGTCTGCAGCACAGCTACGAGGTG 583
Query 566 AGCTGCTAGCTGTGCACGCACAGATCGTGAGCACACTTACACGTGCAAGTGTCGCCCGCATCTTCGCACACAAG 639
|.|||||.|||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 584 AACTGCTTGCTGTACACGCCCAAATTGTGAGCACACTAACGCGTGCAAGCGTGGCCCGCATCTTCGCACATAAG 657
Query 640 CAGAACTATGACCTCCGCCGCCTGCTGGCTGGTTCAGAGCGCACACTGGACCGACTTCTGGACAGTATGGAGCA 713
|||||||||||||||||.||||||.||||.||.||||||||||||||||||||.||..||||||||.|||||||
Sbjct 658 CAGAACTATGACCTCCGTCGCCTGTTGGCCGGCTCAGAGCGCACACTGGACCGGCTCTTGGACAGTGTGGAGCA 731
Query 714 GGACCCAGGAGCCCTGCTCCTGGGTGCCGTGCGCTGTGTGCCCCTTGCCCGCCCGCTGCGAGACGCACTAGGTG 787
.|||||.||.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||.|||||.||.|||||.||.||.||.||..
Sbjct 732 AGACCCGGGCGCCCTGCTCCTGGGCGCTGTGCGCTGTGTGCCTCTGGCCCGTCCACTGCGGGATGCCCTGGGCA 805
Query 788 CGCTCCTCCGACGTTGCACAGCGCCTGGCCTGGCGCTGTCAGTGCTGGCAGTAGGCGGTCGACTTATAACAGCA 861
|.||.||.||.||.||.|||||.||.||||||||..|||||||||||||.||.|||||||||||.|||||.|..
Sbjct 806 CACTACTGCGGCGCTGTACAGCCCCAGGCCTGGCCTTGTCAGTGCTGGCTGTTGGCGGTCGACTGATAACCGTG 879
Query 862 GCCCAGGAGCGGAATGTGCTGGCCGAGTGCCGGCTGGACCCAGCTGACCTGCAGTTGCTGCTCGACTGGGTGGG 935
|||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 880 GCCCAGGAGAGGAATGTGCTGGCGGAGTGCCGGCTGGACCCTGCTGATCTACAGTTGCTGCTTGACTGGGTGGG 953
Query 936 TGCACCAGCCTTTGCGGCGGGTGAGGCTTGGGCACCTGTGTGCCTGCCCCGCTTCAACCCTGATGGTTTTTTCT 1009
||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 954 TGCACCAGCCTTCGCGGCAGGTGAAGCATGGGCACCTGTGTGCCTGCCTCGCTTTAACCCAGATGGTTTCTTCT 1027
Query 1010 ACGCCTACGTGGCCCGCCTGGATGCTATGCCTGTCTGCCTGCTGCTGCTTGGCACCCAACGTGAAGCCTTCCAT 1083
|.|||||.|||||||||||||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.|||.|.|||||||||||||||
Sbjct 1028 ATGCCTATGTGGCCCGCCTGGATTCCATGCCCGTCTGCCTGCTGCTGCTTGGTACCAACCGTGAAGCCTTCCAT 1101
Query 1084 GCCATGGCCGCCTGCCGGCGCCTGGTTGAAGATGGGATGCATGCCCTTGGTGCCATGCGTGCCCTTGGGGAGGC 1157
|||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||...||||||||||.|||||.|.|||||||||||
Sbjct 1102 GCCATGGCCGCCTGCCGGCGCTTAGTTGAAGATGGGATGCACAACCTTGGTGCCCTGCGTACTCTTGGGGAGGC 1175
Query 1158 TGCCAGCTTCTCTAATGCCTCATCAGCCAGTGCTCCTGCCTACAGCGTGCAGGCTGTCGGGGCGCCGGGCCTCC 1231
|||||.|||||||||||.|.||.||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||.||.||.|||||||
Sbjct 1176 TGCCAACTTCTCTAATGGCCCAGCAGCCAGTGCCCCAGCCTACAGTGTGCAGGCTGTGGGAGCCCCTGGCCTCC 1249
Query 1232 GGCACTTCCTGTATAAGCCGCTGGACATCCCTGACCACCACCACCAACTGCCCCAGTTTACCAGCCCTGAGCTA 1305
||||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||.||||.|||.|||||.|||||||||||.||.||||||
Sbjct 1250 GGCATTTTCTCTATAAGCCACTGGATATCCCTGAACAACACCGCCAGCTGCCACAGTTTACCAGTCCCGAGCTA 1323
Query 1306 GAGGCCCCCTACAGCAGAGAGGAGGAGCGGCAGCGGCTGTCGGACCTGTACCACCGCCTGCATGCTCGTCTCCA 1379
||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 1324 GAGGCCCCATACAGCAGAGAGGAAGAGCGACAGCGACTGTCAGACTTGTATCACCGCCTGCATGCTCGCCTCCA 1397
Query 1380 CAGCACCTCCCGACCCCTGCGCCTCATTTACCACGTGGCTGAGAAGGAGACACTACTGGCCTGGGTGACCTCCA 1453
||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||.||||||||.||||
Sbjct 1398 CAGCACCTCCCGGCCCCTGCGCCTCATTTACCACGTGGCTGAGAAAGAGACGCTGCTGGCTTGGGTGACTTCCA 1471
Query 1454 AATTCGAGCTCTATACCTGCCTCAGCCCTCTGGTGACCAAGGCAGGTGCAATCTTGGTAGTGACCAAACTCCTG 1527
|.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||.||.|||.||
Sbjct 1472 AGTTTGAGCTCTATACTTGCCTCAGCCCCCTGGTAACCAAGGCTGGTGCCATCTTAGTAGTGACGAAGCTCTTG 1545
Query 1528 CGCTGGGTGAAGAAAGAGGAGGACCGGCTCTTCATTCGTTACCCACCCAAGTACTCCACACCACCAGCCACCTC 1601
||||||||.|.|||.||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||.|||||||
Sbjct 1546 CGCTGGGTAAGGAAGGAAGAGGACCGGCTTTTCATCCGTTACCCACCCAAATACTCCACACCCCCATCCACCTC 1619
Query 1602 TACGGACCAAGCTGCCCATAATGGCTTGTTCACTGGACTC 1641
..|||||||.||..||.|.||||||||||||||.||||||
Sbjct 1620 GGCGGACCAGGCCCCCAACAATGGCTTGTTCACAGGACTC 1659