Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07841
• Subject: NM_015116.3
• Aligned Length: 2289
• Identities: 2181
• Gaps: 105

Alignment

Query    1  ATGGCGACGCCGGGAAGCGAACCCCAACCTTTCGTCCCGGCCCTTTCGGTAGCTACTCTGCACCCACTTCATCA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGACGCCGGGAAGCGAACCCCAACCTTTCGTCCCGGCCCTTTCGGTAGCTACTCTGCACCCACTTCATCA  74

Query   75  TCCCCACCACCACCACCACCACCATCAGCACCACGGAGGAACCGGCGCCCCCGGCGGGGCGGGTGGTGGCGGCG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCCCCACCACCACCACCACCACCATCAGCACCACGGAGGAACCGGCGCCCCCGGCGGGGCGGGTGGTGGCGGCG  148

Query  149  GTGGCAGCGGGGGCTTCAACCTGCCCTTGAACCGGGGTCTGGAGCGCGCGCTTGAGGAGGCGGCCAACTCCGGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GTGGCAGCGGGGGCTTCAACCTGCCCTTGAACCGGGGTCTGGAGCGCGCGCTTGAGGAGGCGGCCAACTCCGGG  222

Query  223  GGGCTGAACCTGAGCGCCAGGAAATTGAAGGAATTTCCCCGTACCGCAGCCCCCGGGCATGACCTCTCGGACAC  296
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  GGGCTGAACCTGAGCGCCAGGAAATTGAAGGAATTTCCCCGTACCGCAGCCCCCGGGCACGACCTCTCGGACAC  296

Query  297  GGTGCAGGCAGACTTATCTAAAAACAGACTGGTTGAAGTTCCAATGGAATTGTGCCATTTTGTATCACTGGAAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGTGCAGGCAGACTTATCTAAAAACAGACTGGTTGAAGTTCCAATGGAATTGTGCCATTTTGTATCACTGGAAA  370

Query  371  TTCTTAATCTGTATCACAACTGTATCAGAGTCATTCCTGAGGCCATCGTTAATCTGCAGATGCTGACTTACCTG  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTCTTAATCTGTATCACAACTGTATCAGAGTCATTCCTGAGGCCATCGTTAATCTGCAGATGCTGACTTACCTG  444

Query  445  AACTTGAGTCGAAATCAGCTGTCCGCCCTGCCTGCCTGCCTGTGTGGTCTGCCTCTCAAAGTCTTAATCGCAAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  AACTTGAGTCGAAATCAGCTGTCCGCCCTGCCTGCCTGCCTGTGTGGTCTGCCTCTCAAAGTCTTAATCGCAAG  518

Query  519  TAACAACAAACTTGGATCATTACCAGAAGAGATAGGTCAGCTCAAACAGTTAATGGAGCTGGATGTCAGCTGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAACAACAAACTTGGATCATTACCAGAAGAGATAGGTCAGCTCAAACAGTTAATGGAGCTGGATGTCAGCTGCA  592

Query  593  ACGAGATCACAGCGTTGCCCCAGCAGATAGGTCAGTTGAAATCTCTACGAGAACTGAATGTCAGAAGAAATTAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACGAGATCACAGCGTTGCCCCAGCAGATAGGTCAGTTGAAATCTCTACGAGAACTGAATGTCAGAAGAAATTAC  666

Query  667  CTTAAAGTTTTACCACAAGAACTAGTAGATCTTCCCTTGGTAAAGTTTGACTTTTCCTGCAACAAAGTGCTCGT  740
            |||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CTTAAAGTTTTACCACAAGAACTAGTAGATCTTTCCTTGGTAAAGTTTGACTTTTCCTGCAACAAAGTGCTCGT  740

Query  741  GATTCCAATTTGTTTTAGAGAGATGAAGCAGCTGCAAGTGTTACTACTTGAGAATAACCCTCTGCAGTCTCCTC  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GATTCCAATTTGTTTTAGAGAGATGAAGCAGCTGCAAGTGTTACTACTTGAGAATAACCCTCTGCAGTCTCCTC  814

Query  815  CAGCACAGATTTGCACAAAGGGCAAAGTTCACATATTTAAGTATCTGAGCATACAAGCATGCCAGATTAAGACA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CAGCACAGATTTGCACAAAGGGCAAAGTTCACATATTTAAGTATCTGAGCATACAAGCATGCCAGATTAAGACA  888

Query  889  GCTGACTCCCTTTATCTCCACACCATGGAGAGGCCACATTTACACCAGCACGTGGAAGATGGCAAGAAGGATTC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCTGACTCCCTTTATCTCCACACCATGGAGAGGCCACATTTACACCAGCACGTGGAAGATGGCAAGAAGGATTC  962

Query  963  TGATTCGGGAGTTGGAAGTGATAATGGAGATAAGCGATTATCTGCCACCGAGCCTTCTGACGAAGACACTGTTA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGATTCGGGAGTTGGAAGTGATAATGGAGATAAGCGATTATCTGCCACCGAGCCTTCTGACGAAGACACTGTTA  1036

Query 1037  GCCTCAATGTGCCAATGTCAAACATCATGGAAGAAGAACAGATCATCAAGGAGGACTCGTGCCATCGCCTTAGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  GCCTCAATGTGCCAATGTCAAACATCATGGAAGAAGAACAGATCATCAAGGAGGACTCGTGCCATCGCCTTAGC  1110

Query 1111  CCCGTTAAAGGGGAATTTCATCAGGAATTTCAACCGGAGCCTTCCCTTTTGGGTGACAGCACCAACTCAGGAGA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CCCGTTAAAGGGGAATTTCATCAGGAATTTCAACCGGAGCCTTCCCTTTTGGGTGACAGCACCAACTCAGGAGA  1184

Query 1185  AGAAAGAGACCAGTTTACTGATAGAGCAGATGGTCTCCATTCGGAATTTATGAACTATAAGGCAAGGGCAGAAG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGAAAGAGACCAGTTTACTGATAGAGCAGATGGTCTCCATTCGGAATTTATGAACTATAAGGCAAGGGCAGAAG  1258

Query 1259  ACTGTGAAGAGCTGTTACGGATAGAAGAGGATGTGCACTGGCAAACTGAGGGCATAATAAGTTCATCCAAAGAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ACTGTGAAGAGCTGTTACGGATAGAAGAGGATGTGCACTGGCAAACTGAGGGCATAATAAGTTCATCCAAAGAT  1332

Query 1333  CAGGACATGGATATAGCAATGATCGAGCAGCTGAGAGAAGCAGTAGATTTGCTGCAAGATCCCAATGGATTAAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  CAGGACATGGATATAGCAATGATCGAGCAGCTGAGAGAAGCAGTAGATTTGCTGCAAGATCCCAATGGATTAAG  1406

Query 1407  CACAGATATTACAGAGAGAAGTGTTTTAAACCTATATCCTATGGGATCAGCAGAAGCCTTAGAATTACAAGATT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACAGATATTACAGAGAGAAGTGTTTTAAACCTATATCCTATGGGATCAGCAGAAGCCTTAGAATTACAAGATT  1480

Query 1481  CTGCACTGAATGGTCAAATACAGCTGGAGACATCTCCGGTGTGTGAGGTGCAAAGTGATCTAACATTACAGAGT  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  CTGCACTGAATGGTCAAATACAGCTGGAGACATCTCCGGTGTGTGAGGTGCAAAGTGATCTAACATTACAGAGT  1554

Query 1555  AACGGGAGCCAGTATTCTCCAAATGAGATTAGAGAGAACTCCCCTGCAGTCTCTCCTACCACAAACAGCACAGC  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  AACGGGAGCCAGTATTCTCCAAATGAGATTAGAGAGAACTCCCCTGCAGTCTCTCCTACCACAAACAGCACAGC  1628

Query 1629  TCCATTTGGCCTGAAGCCTCGATCAGACCCAGCCCTCATTCTTCCTCCTATCTCCTTCAACACACTTACACAGG  1702
            |||||||||||||||||||||||||                                                 
Sbjct 1629  TCCATTTGGCCTGAAGCCTCGATCA-------------------------------------------------  1653

Query 1703  CACAGACATGGGACAGCTCTAGCTACAGTGTTCCATCTGAAGGAGACAGTGACAATGTGTTTCTAAGACCTCAG  1776
                                                                    ||||||||||||||||||
Sbjct 1654  --------------------------------------------------------GTGTTTCTAAGACCTCAG  1671

Query 1777  AGAAATTTGGAATCTATAGACCCGCAGTTTACAATCCGGAGGAAAATGGAGCAGATGAGAGAAGAGAAAGAGCT  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1672  AGAAATTTGGAATCTATAGACCCGCAGTTTACAATCCGGAGGAAAATGGAGCAGATGAGAGAAGAGAAAGAGCT  1745

Query 1851  GGTGGAACAACTTCGTGAGAGCATTGAGATGAGATTGAAGGTCAGTCTACACGAAGACCTGGGGGCAGCCCTCA  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1746  GGTGGAACAACTTCGTGAGAGCATTGAGATGAGATTGAAGGTCAGTCTACACGAAGACCTGGGGGCAGCCCTCA  1819

Query 1925  TGGATGGTGTCGTCCTCTGCCATCTGGTCAACCACATCCGCCCACGGTCGGTTGCAAGCATCCATGTCCCATCA  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1820  TGGATGGTGTCGTCCTCTGCCATCTGGTCAACCACATCCGCCCACGGTCGGTTGCAAGCATCCATGTCCCATCA  1893

Query 1999  CCAGCGGTTCCCAAACTTAGCATGGCCAAATGCAGAAGAAATGTGGAAAACTTTTTGGAAGCGTGCCGAAAATT  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1894  CCAGCGGTTCCCAAACTTAGCATGGCCAAATGCAGAAGAAATGTGGAAAACTTTTTGGAAGCATGCCGAAAATT  1967

Query 2073  AGGAGTACCAGAGGCTGACCTCTGCTCTCCGTGTGACATCCTGCAGTTGGATTTTCGTCACATTCGAAAGACTG  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1968  AGGAGTACCAGAGGCTGACCTCTGCTCTCCGTGTGACATCCTGCAGTTGGATTTTCGTCACATTCGAAAGACTG  2041

Query 2147  TTGACACTCTGCTGGCACTCGGGGAGAAAGCCCCACCACCAACTTCTGCCCTCCGCTCCAGGGACCTTATAGGC  2220
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2042  TTGACACTCTGCTGGCACTCGGGGAGAAAGCCCCACCACCAACTTCTGCCCTCCGCTCCAGGGACCTTATAGGC  2115

Query 2221  TTCTGTCTTGTCCATATTCTCTTTATAGTGCTGGTCTATATCACTTACCACTGGAATGCTCTGTCCGCA  2289
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2116  TTCTGTCTTGTCCATATTCTCTTTATAGTGCTGGTCTATATCACTTACCACTGGAATGCTCTGTCCGCA  2184