Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07841
• Subject: NM_015116.3
• Aligned Length: 763
• Identities: 727
• Gaps: 35

Alignment

Query   1  MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLNRGLERALEEAANSG  74
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Sbjct   1  MATPGSEPQPFVPALSVATLHPLHHPHHHHHHHQHHGGTGAPGGAGGGGGGSGGFNLPLNRGLERALEEAANSG  74

Query  75  GLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYL  148
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Sbjct  75  GLNLSARKLKEFPRTAAPGHDLSDTVQADLSKNRLVEVPMELCHFVSLEILNLYHNCIRVIPEAIVNLQMLTYL  148

Query 149  NLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNY  222
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Sbjct 149  NLSRNQLSALPACLCGLPLKVLIASNNKLGSLPEEIGQLKQLMELDVSCNEITALPQQIGQLKSLRELNVRRNY  222

Query 223  LKVLPQELVDLPLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKT  296
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Sbjct 223  LKVLPQELVDLSLVKFDFSCNKVLVIPICFREMKQLQVLLLENNPLQSPPAQICTKGKVHIFKYLSIQACQIKT  296

Query 297  ADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLS  370
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Sbjct 297  ADSLYLHTMERPHLHQHVEDGKKDSDSGVGSDNGDKRLSATEPSDEDTVSLNVPMSNIMEEEQIIKEDSCHRLS  370

Query 371  PVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKD  444
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Sbjct 371  PVKGEFHQEFQPEPSLLGDSTNSGEERDQFTDRADGLHSEFMNYKARAEDCEELLRIEEDVHWQTEGIISSSKD  444

Query 445  QDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQS  518
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Sbjct 445  QDMDIAMIEQLREAVDLLQDPNGLSTDITERSVLNLYPMGSAEALELQDSALNGQIQLETSPVCEVQSDLTLQS  518

Query 519  NGSQYSPNEIRENSPAVSPTTNSTAPFGLKPRSDPALILPPISFNTLTQAQTWDSSSYSVPSEGDSDNVFLRPQ  592
           |||||||||||||||||||||||||||||||||                                   ||||||
Sbjct 519  NGSQYSPNEIRENSPAVSPTTNSTAPFGLKPRS-----------------------------------VFLRPQ  557

Query 593  RNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPS  666
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Sbjct 558  RNLESIDPQFTIRRKMEQMREEKELVEQLRESIEMRLKVSLHEDLGAALMDGVVLCHLVNHIRPRSVASIHVPS  631

Query 667  PAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLIG  740
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Sbjct 632  PAVPKLSMAKCRRNVENFLEACRKLGVPEADLCSPCDILQLDFRHIRKTVDTLLALGEKAPPPTSALRSRDLIG  705

Query 741  FCLVHILFIVLVYITYHWNALSA  763
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Sbjct 706  FCLVHILFIVLVYITYHWNALSA  728