Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_07841
• Subject: XM_006519157.3
• Aligned Length: 2315
• Identities: 1893
• Gaps: 118

Alignment

Query    1  ATGGCGACGCCGGGAAGCGAACCCCAACCTTTCGTCCCGGCCCTTTCGGTAGCTACTCTGCACCC---ACTTCA  71
            |||||||||||||||||||||||||||.||||||..||.||.||.||||||.|..|.||||||||   .||.||
Sbjct    1  ATGGCGACGCCGGGAAGCGAACCCCAAGCTTTCGCGCCCGCTCTCTCGGTAACCGCCCTGCACCCGCATCTCCA  74

Query   72  TCATCCCCACCACCACCACCACCACCATCAGCACCACGGAGGAACCGGCGCCCCCGGCGGGGCGGGTGGTGGCG  145
            .||.|.||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||.|.||                   
Sbjct   75  CCAGCACCACCAACACCACCAACACCACCAGCACCACGGAGGCACCGGCGGCACC-------------------  129

Query  146  GCGGTGGCAGCGGGGGCTTCAACCTGCCCTTGAACCGGGGTCTGGAGCGCGCGCTTGAGGAGGCGGCCAACTCC  219
                          |||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||.|||||||||||||||||.
Sbjct  130  --------------GGCTTCAACCTGCCCTTGAACCGTGGTTTGGAGCGCGCGCTGGAGGAGGCGGCCAACTCT  189

Query  220  GGGGGGCTGAACCTGAGCGCCAGGAAATTGAAGGAATTTCCCCGTACCGCAGCCCCCGGGCATGACCTCTCGGA  293
            |||||..|||||||||||||||||||..|||||||.||||||.|.||..|.|||||.||.||||||||||||||
Sbjct  190  GGGGGCTTGAACCTGAGCGCCAGGAAGCTGAAGGAGTTTCCCAGGACTACGGCCCCGGGACATGACCTCTCGGA  263

Query  294  CACGGTGCAGGCAGACTTATCTAAAAACAGACTGGTTGAAGTTCCAATGGAATTGTGCCATTTTGTATCACTGG  367
            ||||||.|.||||||..|||||||||||||||||||.|||||.||||||||..|||||||.|||||||||||||
Sbjct  264  CACGGTTCGGGCAGATCTATCTAAAAACAGACTGGTGGAAGTGCCAATGGAGCTGTGCCAATTTGTATCACTGG  337

Query  368  AAATTCTTAATCTGTATCACAACTGTATCAGAGTCATTCCTGAGGCCATCGTTAATCTGCAGATGCTGACTTAC  441
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||.||||..||
Sbjct  338  AAATTCTTAACCTGTATCACAACTGTATCAGAGTCATTCCTGAGGCCATTGTTAATTTGCAGATGTTGACCCAC  411

Query  442  CTGAACTTGAGTCGAAATCAGCTGTCCGCCCTGCCTGCCTGCCTGTGTGGTCTGCCTCTCAAAGTCTTAATCGC  515
            ||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  412  CTAAACTTGAGTCGAAATCAGCTGTCTGCCCTGCCCGCCTGCCTGTGTGGTCTGCCTCTCAAAGTCTTAATCGC  485

Query  516  AAGTAACAACAAACTTGGATCATTACCAGAAGAGATAGGTCAGCTCAAACAGTTAATGGAGCTGGATGTCAGCT  589
            |||.||||||||.||.||||||.|.||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.||.|
Sbjct  486  AAGCAACAACAAGCTCGGATCACTGCCTGAAGAGATAGGTCAGCTCAAACAGTTAATGGAGTTGGATGTGAGTT  559

Query  590  GCAACGAGATCACAGCGTTGCCCCAGCAGATAGGTCAGTTGAAATCTCTACGAGAACTGAATGTCAGAAGAAAT  663
            |||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||.||||.|||||.||.|||||.||||||.||||||||
Sbjct  560  GCAACGAGATCACGGCCTTGCCCCAGCAGATAGGCCAGCTGAAGTCTCTGCGGGAACTCAATGTCCGAAGAAAT  633

Query  664  TACCTTAAAGTTTTACCACAAGAACTAGTAGATCTTCCCTTGGTAAAGTTTGACTTTTCCTGCAACAAAGTGCT  737
            ||||||||.||||||||||.|||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  634  TACCTTAAGGTTTTACCACCAGAGCTAGTAGATCTCCCCTTGGTAAAGTTTGACTTTTCCTGCAACAAGGTGCT  707

Query  738  CGTGATTCCAATTTGTTTTAGAGAGATGAAGCAGCTGCAAGTGTTACTACTTGAGAATAACCCTCTGCAGTCTC  811
            .|||||.||..|.||.||.||.|||||||||||||||||.|||.|.||.||||||||.||||||||||||||.|
Sbjct  708  GGTGATCCCCGTCTGCTTCAGGGAGATGAAGCAGCTGCAGGTGCTCCTGCTTGAGAACAACCCTCTGCAGTCCC  781

Query  812  CTCCAGCACAGATTTGCACAAAGGGCAAAGTTCACATATTTAAGTATCTGAGCATACAAGCATGCCAGATTAAG  885
            ||||.||.|||||||||||.||.||.|||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  782  CTCCGGCGCAGATTTGCACGAAAGGAAAAGTACACATATTTAAGTATTTGAGCATACAAGCATGCCAGATTAAG  855

Query  886  ACAGCTGACTCCCTTTATCTCCACACCATGGAGAGGCCACATTTACACCAGCACGTGGAAGATGGCAAGAAGGA  959
            |||..||||||.|||||.||||.||||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||..|.||||||||
Sbjct  856  ACAAGTGACTCTCTTTACCTCCCCACCATAGAGAGGCCCCATTTACACCAACACGTGGAAGACAGTAAGAAGGA  929

Query  960  TTCTGATTCGGGAGTTGGAAGTGATAATGGAGATAAGCGATTATCTGCCACCGAGCCTTCTGACGAAGACACTG  1033
            .||.||.||.||.|||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||.|||||.|
Sbjct  930  CTCCGACTCAGGGGTTGGAAGTGACAATGGAGATAAGCGGTTATCTGCCACCGAGCCCTCTGATGAGGACACGG  1003

Query 1034  TTAGCCTCAATGTGCCAATGTCAAACATCATGGAAGAAGAACAGATCATCAAGGAGGACTCGTGCCATCGCCTT  1107
            ||||||||||||.|||.||||||||||||.||||||||||.||||.||||||||||||..||||||||||.||.
Sbjct 1004  TTAGCCTCAATGCGCCCATGTCAAACATCGTGGAAGAAGACCAGACCATCAAGGAGGATGCGTGCCATCGGCTC  1077

Query 1108  AGCCCCGTTAAAGGGGAATTTCATCAGGAATTTCAACCGGAGCCTTCCCTTTTGGGTGACAGCACCAACTCAGG  1181
            |.|||...||||||            .||||||||.|||.||||||||.|||||||.||||||..||.||||||
Sbjct 1078  ACCCCAACTAAAGG------------AGAATTTCAGCCGAAGCCTTCCATTTTGGGGGACAGCGGCATCTCAGG  1139

Query 1182  AGAAGAAAGAGACCAGTTTACTGATAGAGCAGATGGTCTCCATTCGGAATTTATGAACTA---TAAGG--CAAG  1250
            |.||||||||||.|||.||.|||...|.|||||||.||..||.||||.|.||||||||||   |||||  ||  
Sbjct 1140  ACAAGAAAGAGAGCAGCTTGCTGGCCGTGCAGATGCTCGACACTCGGGACTTATGAACTATATTAAGGACCA--  1211

Query 1251  GGCAGAAGACTGTGAAGAGCTGTTACGGATAGAAGAGGATGTGCACTGGCAAACTGAGGGCATAATAAGTTCAT  1324
            |||||||||||||||||||||.||.||||||||||||||||..||||||||.|..||||...||.|||.|||||
Sbjct 1212  GGCAGAAGACTGTGAAGAGCTATTGCGGATAGAAGAGGATGCTCACTGGCACATGGAGGAACTACTAAATTCAT  1285

Query 1325  CCAAAGATCAGGACATGGATATAGCAATGATCGAGCAGCTGAGAGAAGCAGTAGATTTGCTGCAAGATCCCAAT  1398
            |||||||.|.|||..||||||||||.|||||.||||||||||||||.||   |||..||||.||.||||||||.
Sbjct 1286  CCAAAGACCGGGAGCTGGATATAGCGATGATTGAGCAGCTGAGAGAGGC---AGAGCTGCTTCAGGATCCCAAC  1356

Query 1399  GGATTAAGCACAGATATTACAGAGAGAAGTGTTTTAAACCTATATCCTATGGGATCAGCAGAAGCCTTAGAATT  1472
            ||..|||||.|||||||.|.||||||||||.||||.|||||.|..||.||||..||||.||||||||.||||||
Sbjct 1357  GGTCTAAGCGCAGATATCATAGAGAGAAGTATTTTGAACCTGTTCCCCATGGACTCAGGAGAAGCCTCAGAATT  1430

Query 1473  ACAAGATTCTGCACTGAATGGTCAAATACAGCTGGAGACATCTCCGGTGTGTGAGGTGCAAAGTGATCTAACAT  1546
            .|..|||.||.||||.|||||.||..|.|||||||||||.|||||.|...||||||||||||.||||||||..|
Sbjct 1431  CCCTGATCCTTCACTCAATGGCCAGTTGCAGCTGGAGACGTCTCCAGACCGTGAGGTGCAAAATGATCTAATGT  1504

Query 1547  TACAGAGTAACGGGAGCCAGTATTCTCCAAATGAGATTAGAGAGAACTCCCCTGCAGTCTCTCCTACCACAAAC  1620
            ||||||||||.||.||||||||||||||.||||||||..||||||||||||||.||||.||||||||..|||||
Sbjct 1505  TACAGAGTAATGGAAGCCAGTATTCTCCCAATGAGATACGAGAGAACTCCCCTTCAGTGTCTCCTACTGCAAAC  1578

Query 1621  AGCACAGCTCCATTTGGCCTGAAGCCTCGATCAGACCCAGCCCTCATTCTTCCT----CCTATCTCCTTCAACA  1690
            |.|||||||||.|||||||||||||||||.||||              .|||||    ||              
Sbjct 1579  ATCACAGCTCCGTTTGGCCTGAAGCCTCGTTCAG--------------GTTCCTGGTGCC--------------  1624

Query 1691  CACTTACACAGGCACAGACATGGGACAGCTCT--AGCTACAGTGTTCCATCTGAAGGAGA---CAGT-------  1752
              ||.| ..|||.|||      ||.|||| ||  ||..|.||   |||..|..|||..||   ||||       
Sbjct 1625  --CTGA-GGAGGTACA------GGGCAGC-CTGCAGGCAGAG---TCCTCCCCAAGACGACCCCAGTTGCTTTC  1685

Query 1753  --GACAATGTGTTTCTAAGACCTCAGAGAAATTTGGAATCTATAGACCCGCAGTTTACAATCCGGAGGAAAATG  1824
              |.| ||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1686  CAGGC-ATGTGTTTCTAAGACCGCAGAGAAACTTGGAATCTATAGACCCACAGTTTACGATCCGGAGGAAGATG  1758

Query 1825  GAGCAGATGAGAGAAGAGAAAGAGCTGGTGGAACAACTTCGTGAGAGCATTGAGATGAGATTGAAGGTCAGTCT  1898
            ||||||||||||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||..|||||||.|..||
Sbjct 1759  GAGCAGATGAGAGAGGAGAAGGAGCTGGTGGAGCAACTCCGAGAGAGCATCGAGATGAGGCTGAAGGTGACCCT  1832

Query 1899  ACACGAAGACCTGGGGGCAGCCCTCATGGATGGTGTCGTCCTCTGCCATCTGGTCAACCACATCCGCCCACGGT  1972
            .||.||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||||.|||||||.||||.||..|.|
Sbjct 1833  TCATGAAGACCTGGGGGCGGCACTCATGGATGGTGTCGTCCTCTGCCACCTGGCCAACCACGTCCGTCCGAGAT  1906

Query 1973  CGGTTGCAAGCATCCATGTCCCATCACCAGCGGTTCCCAAACTTAGCATGGCCAAATGCAGAAGAAATGTGGAA  2046
            |.||.||.||||||||||||||.|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||.||.||.||||||
Sbjct 1907  CTGTCGCCAGCATCCATGTCCCCTCACCGGCTGTTCCTAAACTCAGCATGGCCAAGTGCAGGAGGAACGTGGAA  1980

Query 2047  AACTTTTTGGAAGCGTGCCGAAAATTAGGAGTACCAGAGGCTGACCTCTGCTCTCCGTGTGACATCCTGCAGTT  2120
            |||||.||||||||||||.|.|||.|.||.||.||.|||||.|||||.||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1981  AACTTCTTGGAAGCGTGCAGGAAACTTGGCGTTCCCGAGGCCGACCTGTGCTCTCCGTATGACATCCTGCAGTT  2054

Query 2121  GGATTTTCGTCACATTCGAAAGACTGTTGACACTCTGCTGGCACTCGGGGAGAAAGCCCCACCACCAACTTCTG  2194
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||.||||||...|||||||||
Sbjct 2055  GGATTTTCGTCACATTCGAAAGACTGTTGACACTCTGCTGGCCCTCGGGGAGAAACCCCCACAGTCAACTTCTG  2128

Query 2195  CCCTCCGCTCCAGGGACCTTATAGGCTTCTGTCTTGTCCATATTCTCTTTATAGTGCTGGTCTATATCACTTAC  2268
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||.||||||||||||.|||||
Sbjct 2129  CCCTCCGCTCCAGGGACCTTATAGGCTTCTGTCTTATCCATGTTCTCCTTATAGTACTGGTCTATATCGCTTAC  2202

Query 2269  CACTGGAATGCTCTGTCCGCA  2289
            |.|||||||||||||||.||.
Sbjct 2203  CGCTGGAATGCTCTGTCTGCC  2223